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1.
Cell Death Dis ; 10(10): 771, 2019 10 10.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31601788

RESUMO

The retention using selective hooks (RUSH) system allows to retain a target protein fused to green fluorescent protein (GFP) and a streptavidin-binding peptide (SBP) due to the interaction with a molar excess of streptavidin molecules ("hooks") targeted to selected subcellular compartments. Supplementation of biotin competitively disrupts the interaction between the SBP moiety and streptavidin, liberating the chimeric target protein from its hooks, while addition of avidin causes the removal of biotin from the system and reestablishes the interaction. Based on this principle, we engineered two chimeric proteins involved in autophagy, namely microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B (MAP1LC3B, best known as LC3) and sequestosome-1 (SQSTM1, best known as p62) to move them as SBP-GFP-LC3 and p62-SBP-GFP at will between the cytosol and two different organelles, the endoplasmic reticulum (ER) and the Golgi apparatus. Although both proteins were functional in thus far that SBP-GFP-LC3 and p62-SBP-GFP could recruit their endogenous binding partners, p62 and LC3, respectively, their enforced relocation to the ER or Golgi failed to induce organelle-specific autophagy. Hence, artificial tethering of LC3 or p62 to the surface of the ER and the Golgi is not sufficient to trigger autophagy.


Assuntos
Autofagia/genética , Retículo Endoplasmático/metabolismo , Complexo de Golgi/metabolismo , Proteínas Associadas aos Microtúbulos/metabolismo , Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo , Proteínas Adaptadoras de Transdução de Sinal/genética , Proteínas Adaptadoras de Transdução de Sinal/metabolismo , Autofagia/efeitos dos fármacos , Biotina/metabolismo , Linhagem Celular Tumoral , Citosol/metabolismo , Proteínas de Fluorescência Verde/metabolismo , Humanos , Proteínas Associadas aos Microtúbulos/genética , Ligação Proteica/genética , Ligação Proteica/fisiologia , Transporte Proteico/genética , Transporte Proteico/fisiologia , Proteínas de Ligação a RNA/genética , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Estreptavidina/metabolismo
2.
Nat Commun ; 10(1): 1935, 2019 04 26.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31028249

RESUMO

Despite their location at the cell surface, several receptor tyrosine kinases (RTK) are also found in the nucleus, as either intracellular domains or full length proteins. However, their potential nuclear functions remain poorly understood. Here we find that a fraction of full length Colony Stimulating Factor-1 Receptor (CSF-1R), an RTK involved in monocyte/macrophage generation, migrates to the nucleus upon CSF-1 stimulation in human primary monocytes. Chromatin-immunoprecipitation identifies the preferential recruitment of CSF-1R to intergenic regions, where it co-localizes with H3K4me1 and interacts with the transcription factor EGR1. When monocytes are differentiated into macrophages with CSF-1, CSF-1R is redirected to transcription starting sites, colocalizes with H3K4me3, and interacts with ELK and YY1 transcription factors. CSF-1R expression and chromatin recruitment is modulated by small molecule CSF-1R inhibitors and altered in monocytes from chronic myelomonocytic leukemia patients. Unraveling this dynamic non-canonical CSF-1R function suggests new avenues to explore the poorly understood functions of this receptor and its ligands.


Assuntos
Regulação da Expressão Gênica , Leucemia Mielomonocítica Crônica/genética , Fator Estimulador de Colônias de Macrófagos/farmacologia , Macrófagos/efeitos dos fármacos , Receptores de Fator Estimulador das Colônias de Granulócitos e Macrófagos/genética , Sistemas CRISPR-Cas , Membrana Celular/química , Membrana Celular/efeitos dos fármacos , Membrana Celular/metabolismo , Cromatina/química , Cromatina/efeitos dos fármacos , Cromatina/metabolismo , Proteína 1 de Resposta de Crescimento Precoce/genética , Proteína 1 de Resposta de Crescimento Precoce/metabolismo , Corantes Fluorescentes/química , Edição de Genes , Células HEK293 , Histonas/genética , Histonas/metabolismo , Humanos , Leucemia Mielomonocítica Crônica/metabolismo , Leucemia Mielomonocítica Crônica/patologia , Fator Estimulador de Colônias de Macrófagos/metabolismo , Macrófagos/citologia , Macrófagos/metabolismo , Maleimidas/química , Cultura Primária de Células , Ligação Proteica , RNA Interferente Pequeno/genética , RNA Interferente Pequeno/metabolismo , Receptores de Fator Estimulador das Colônias de Granulócitos e Macrófagos/antagonistas & inibidores , Receptores de Fator Estimulador das Colônias de Granulócitos e Macrófagos/metabolismo , Transdução de Sinais , Células THP-1 , Fator de Transcrição YY1/genética , Fator de Transcrição YY1/metabolismo , Proteínas Elk-1 do Domínio ets/genética , Proteínas Elk-1 do Domínio ets/metabolismo
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