Extensive free-energy simulations identify water as the base in nucleotide addition by DNA polymerase.

Roston, Daniel; Demapan, Darren; Cui, Qiang

Roston, Daniel; Demapan, Darren; Cui, Qiang.

Afiliação

Roston D; Department of Chemistry and Biochemistry, University of California San Diego, La Jolla, CA 92093; droston@ucsd.edu qiangcui@bu.edu.
Demapan D; Department of Chemistry, Boston University, Boston, MA 02215.
Cui Q; Department of Chemistry, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 116(50): 25048-25056, 2019 12 10.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31757846

Assuntos

DNA Polimerase Dirigida por DNA; Nucleotídeos; Água; DNA Polimerase Dirigida por DNA/química; DNA Polimerase Dirigida por DNA/metabolismo; Magnésio/química; Magnésio/metabolismo; Redes e Vias Metabólicas; Simulação de Dinâmica Molecular; Nucleotídeos/química; Nucleotídeos/metabolismo; Termodinâmica; Água/química; Água/metabolismo

Palavras-chave

QM/MM; metalloenzyme; molecular dynamics; phosphoryl transfer

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Água / DNA Polimerase Dirigida por DNA / Nucleotídeos Idioma: En Revista: Proc Natl Acad Sci U S A Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article

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