Potential molecular mechanism of the Xiexin capsule in the intervention of dyslipidemia based on bioinformatics and molecular docking.

RESUMEN

Introducción: Objetivo: se utilizaron métodos bioinformáticos y técnicas de acoplamiento molecular para predecir componentes efectivos, objetivos y vías biológicas relacionadas de la cápsula Xiexin en la intervención de dislipidemia y explorar su mecanismo. Métodos: los componentes activos y los objetivos de la cápsula Xiexin fueron seleccionados por la base de datos TCMSP. Se utilizaron plataformas Genecards, OMIM, PharmGkb, Therapeutic Target Database y Drugbank para buscar dianas de la enfermedad en la dislipidemia. El diagrama reticular "componente-diana" fue construido por el software Cytoscape 3.7.0, y la interacción proteína-proteína (PPI) fue analizada por la plataforma STRING. Los análisis de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) y Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomics se realizaron mediante paquetes de datos en lenguaje R para predecir mecanismo de acción. El software AutoDockVina y PyMol se utilizó para unir componentes activos clave de la cápsula Xiexin y las proteínas clave de la PPI. Resultados: se seleccionaron 65 componentes activos y 114 dianas. Veintitrés compuestos activos clave fueron seleccionados a partir de la tabla "componentes farmacéuticos-dianas". Las redes PPI incluyen principalmente proteínas básicas como PTGS2, PTGS1 y HSP90AA1. Los resultados del análisis de enriquecimiento de GO y KEGG en los objetivos comunes se refieren principalmente a la vía de señalización mediada por esteroides, la respuesta hormonal esteroidea, el transporte y metabolismo lipídicos, la regulación del almacenamiento de colesterol, la vía de la ciclooxigenasa y otras vías biológicas, así como la vía de señalización de PPAR, IL-17, PI3K-Akt, FcεRI y otras vías relacionadas. La prueba de acoplamiento molecular mostró que la quercetina se une mejor a la proteína diana central HSP90AA1, que es la proteína diana con la mejor actividad de unión de los componentes químicos clave de la cápsula Xiexin. Conclusión: los principales componentes químicos de la cápsula Xiexin pueden participar en la regulación de la PPAR y otras vías de señalización mediante la regulación de genes clave como ESR1, MAPK14 (mitogen-activated protein kinase 14), HSP90AA1, por lo que pueden desempeñar un papel farmacológico en la intervención de dislipidemia.