Variant analyses of candidate genes in orofacial clefts in multi-ethnic populations.

OBJECTIVES: Cleft lip with/without cleft palate and cleft palate only is congenital birth defects where the upper lip and/or palate fail to fuse properly during embryonic facial development. Affecting ~1.2/1000 live births worldwide, these orofacial clefts impose significant social and financial burdens on affected individuals and their families. Orofacial clefts have a complex etiology resulting from genetic variants combined with environmental covariates. Recent genome-wide association studies and whole-exome sequencing for orofacial clefts identified significant genetic associations and variants in several genes. Of these, we investigated the role of common/rare variants in SHH, RORA, MRPL53, ACVR1, and GDF11. MATERIALS AND METHODS: We sequenced these five genes in 1255 multi-ethnic cleft lip with/without palate and cleft palate only samples in order to find variants that may provide potential explanations for the missing heritability of orofacial clefts. Rare and novel variants were further analyzed using in silico predictive tools. RESULTS: Ninteen total variants of interest were found, with variant types including stop-gain, missense, synonymous, intronic, and splice-site variants. Of these, 3 novel missense variants were found, one in SHH, one in RORA, and one in GDF11. CONCLUSION: This study provides evidence that variants in SHH, RORA, MRPL53, ACVR1, and GDF11 may contribute to risk of orofacial clefts in various populations.

Non-random distribution of deleterious mutations in the DNA and protein-binding domains of IRF6 are associated with Van Der Woude syndrome.

BACKGROUND: The development of the face occurs during the early days of intrauterine life by the formation of facial processes from the first Pharyngeal arch. Derangement in these well-organized fusion events results in Orofacial clefts (OFC). Van der Woude syndrome (VWS) is one of the most common causes of syndromic cleft lip and/or palate accounting for 2% of all cases. Mutations in the IRF6 gene account for 70% of cases with the majority of these mutations located in the DNA-binding (exon 3, 4) or protein-binding domains (exon 7-9). The current study was designed to update the list of IRF6 variants reported for VWS by compiling all the published mutations from 2013 to date as well as including the previously unreported VWS cases from Africa and Puerto Rico. METHODS: We used PubMed with the search terms; "Van der Woude syndrome," "Popliteal pterygium syndrome," "IRF6," and "Orofacial cleft" to identify eligible studies. We compiled the CADD score for all the mutations to determine the percentage of deleterious variants. RESULTS: Twenty-one new mutations were identified from nine papers. The majority of these mutations were in exon 4. Mutations in exon 3 and 4 had CADD scores between 20 and 30 and mutations in exon 7-9 had CADD scores between 30 and 40. The presence of higher CADD scores in the protein-binding domain (exon 7-9) further confirms the crucial role played by this domain in the function of IRF6. In the new cases, we identified five IRF6 mutations, three novel missense mutations (p.Phe36Tyr, p.Lys109Thr, and p.Gln438Leu), and two previously reported nonsense mutations (p.Ser424*and p.Arg250*). CONCLUSION: Mutations in the protein and DNA-binding domains of IRF6 ranked among the top 0.1% and 1% most deleterious genetic mutations, respectively. Overall, these findings expand the range of VWS mutations and are important for diagnostic and counseling purposes.

Cervical cancer cells induce apoptosis in TCD4+ lymphocytes through the secretion of TGF-ß.

PURPOSE: Tumor cells are known to secrete cytokines that modify their microenvironment in order to favor their survival and continuous proliferation. In this work, we evaluated if TGF-ß secreted in vitro by cervical cancer cells could interfere with the proliferation and survival of lymphocytes. METHODS: Lymphocytes were obtained from peripheral blood of healthy human volunteers, and isolated by density gradient centrifugation and cultured in 96-well plates. Lymphocyte proliferation was induced with phytohemaglutinin and co-cultured with conditioned media (CM) from cervical cancer cell lines, and the inhibition of proliferation was evaluated after 72 h by the incorporated radioactivity and a CFSE-labeling assay. TGF-ß quantification on these CM was evaluated by ELISA. Non-apoptotic cellular death was evaluated through disruption of cell membrane integrity by measuring the liberation of lactate dehydrogenase. The apoptosis process was evaluated by annexin-V and active caspase-3. The presence of CD4+ or CD8+ lymphocytes was evaluated by flow cytometry using specific antibodies. RESULTS: It was found that the conditioned media from these cells significantly inhibited the proliferation of lymphocytes and induced them to go into apoptosis. Antibodies against TGF-ß almost completely blocked this activity, suggesting that this cytokine is responsible for the inhibitory activity. When the induced apoptosis on subpopulations of lymphocytes was evaluated, it was detected that the CD4+ cells were specifically targeted. CONCLUSIONS: Cervical cancer cells secrete TGF-ß that inhibits lymphocyte proliferation and induces apoptosis in CD4+, but not in CD8+ lymphocytes.

Macrophage and T lymphocyte apoptosis during experimental pulmonary tuberculosis: their relationship to mycobacterial virulence.

The kinetics of macrophage and T lymphocyte apoptosis were determined in a well-characterized mouse model of pulmonary tuberculosis, comparing strains of intermediate (H37Rv) and high virulence (Beijing strain, code 9501000). Both strains induced a high percentage of apoptotic activated macrophages at days 1 and 3 post infection, although this was twofold lower in Beijing-infected mice. Progressive pneumonia started at day 14 (Beijing) or 21 (H37Rv) post infection. Pneumonic areas contained numerous macrophages with vacuolated cytoplasm (VM). In H37Rv infection few VM were apoptotic (8.7% at day 60), and the percentage was even lower in Beijing infection (1.4% at day 28). A high percentage of VM expressed the anti-apoptotic molecule Bcl-2 (H37Rv, 83%; Beijing, 95%). Both strains induced a progressive increase of apoptotic Th1 lymphocytes, peaking at day 60 in H37Rv infection, or 28 in Beijing infection. The peak was twofold higher in the latter. VM had strong FasL immunostaining, and confocal microscopy showed numerous apoptotic Th1 cells closely associated with them, suggesting that VM might induce apoptosis of Th1 cells. These results support the hypothesis that apoptosis of macrophages is associated with protection, while apoptosis of Th1 cells favors disease progression, and is related to the virulence of the mycobacterial strain.

Aspectos inmunlóógicos del envejecimiento

La inmunosenescencia es un proceso complejo que involucra múltiples cambios en las poblaciones linfocitarias. Estos cambios en el adulto mayor incrementan la incidencia y severidad de las enfermedades infecciosas y algunos cánceres. En este artículo revisamos algunos de los cambios inmunológicos más relevantes que han sido descritos durante el envejecimiento y su asociación con algunas patologías.

Immunosenescence is a complex process involving multiple changes in lymphocyte subsets. In the elderly, these changes contribute to an increased incidence and severity of infectious diseases and some types of cancer. This paper reviews some of the immunological changes in the elderly and their association with certain diseases.

Avances recientes en el estudio de la inmunopatología de los padecimientos atópicos / Recent advances in the study of the immunopathology of the sufferings atopic

Se sabe que los padecimientos atópicos dependen, entre otros factores, de la hipersensibilidad tipo 1. De entre todas las causas, la hereditaria es la más estudiada. El desequilibrio en la regulación de la respuesta inmunitaria por los linfocitos T cooperadores Th1/Th2 es, en apariencia, uno de los factores predominantes de la generación y mantenimiento del proceso atópico. En este artículo se analizan los mecanismos de regulación de la respuesta Th1-Th2 y su desequilibrio, la participación de los factores solubles como las citocinas, quimiocinas y sus receptores, los marcadores de membrana celular actualmente propuestos para este desequilibrio y los factores de transcripción involucrados en los procesos atópicos. También se proponen algunas consideraciones generales y perspectivas en el estudio de la inmunopatología de los procesos atópicos.

Avances en el estudio de los mecanismos celulares de supresión de la respuesta inmunitaria en la tuberculosis / Advances in the study of immunosuppression cell mechanisms in tuberculosis

La respuesta inmunitaria protectora generada durante la tuberculosis es el resultado de la integración de las respuestas inmunitarias, natural y adquirida, a través de la activación de linfocitos T CD4+ productores de IFN-g, permitiendo la eliminación del bacilo por macrófagos activados. La inmunosupresión, es la consecuencia de un desequilibrio en la respuesta inmunitaria con progreso de la infección. En este trabajo, se revisan las características de la respuesta inmunitaria contra Mycobacterium tuberculosis así como los mecanismos celulares de supresión de la respuesta inmunitaria.

Estudio de Marcadores de superficie celular en pacientes con rinitis alérgica frente a reto con Der p y Der f / Estudy of the markers of cellular surface in patients with allergic rinitis forehead to challenge with Der p and Der f

Los padecimientos alérgicos están genéticamente determinados y afectan del 20 al 30 por ciento de la población general en países desarrollados; en la última década la prevalencia se ha incrementado. El desequilibrio manifiesto en los padecimientos atópicos se encuentra en las células presentadoras de antígeno (monocitos y células B) y en los linfocitos T CD4+. La asociación de moléculas como CD80, CD 86 (moléculas co-estimulatorias) en monocitos y células B; y CD30, CD62L, ALL, CD11a, CD28, CD124 y CD152 en CD4+, ha demostrado ser de particular interés en padecimientos atópicos. Sin embargo, no se encontró una diferencia estadísticamente significativa entre pacientes y controles y entre reto nasal con solución salina y alergeno. Por esto se sugiere que los cambios en la activación, proliferación y cooperación se dan en el sitio de la lesión, sin una aparente repercusión en las células de la sangre periférica.

Oxido nítrico, una molécula multifuncional / Nitric oxide, a multifunctional molecule

El óxido nítrico es un regulador importante de diversas funciones fisiológicas y además, es un factor que contribuye a la respuesta inmune innata. Su efecto también puede estar relacionado a procesos patológicos como el asma o la inflamación crónica. Objetivo. En este trabajo se revisaron algunos aspectos bioquímicos, inmunológicos y fisiopatológicos del óxido nítrico

Respuesta inmune en la tuberculosis / Immune response in tuberculosis

La tuberculosis es una de las enfermedades infecciosas más antiguas que han afectado al hombre. En la actualidad, representa uno de los padecimientos más importantes como causa de muerte. En este trabajo se pretende discutir algunos aspectos recientemente identificados relacionados con la fisiopatogenia de la enfermedad y que incluyen la respuesta inmune del individuo y a la capacidad que posee para reconocer, adecuadamente, al agente etiológico. El conocimiento de esta enfermedad en el contexto del sistema de histocompatibilidad, representa un avance importante en la identificación oportuna de individuos o poblaciontes de alto riesgo de enfermedades, lo que permitirá contemplar alternativas de pronósticos y/o tratamiento

Expresión de moléculas de adhesión en el melanoma metastásico murino B16-F10 y su modificación farmacológica in vitro con el empleo de cumarina / Adhesion molecules expression in murine B16-F10 metastatic melanoma and its pharmacological modification in vitro by the use of coumarin

Recientemente se han demostrado correlaciones significativas entre la expresión de algunas moléculas de adhesión y la capacidad de células de producir metástasis. Por ejemplo, se ha observado una correlación entre la expresión de la integrina a6/ß1 en células cancerosas pulmonares y la producción de metástasis. También se ha observado correlación entre la expresión de algunas moléculas de adhesión en células de melanoma maligno y su capacidad de producir metástasis pulmonares. En este trabajo estudiamos la acción in vitro de la cumarina en el melanoma murino B16-F10, productor de metástasis pulmonares, sobre la expresión de dos moléculas de adhesión, ICAM-1 y LFA-1. No se observó disminución en la expresión de la molécula de adhesión LFA-1, y la expresión de ICAM-1 disminuyó de manera uniforme con todas las concentraciones de cumarina estudiadas. Estos resultados no explican los efectos antimetastásicos producidos por la cumarina en modelos animales de metástasis pulmonares experimentales y espontáneas, ni los efectos antimetastásicos en humanos. Es necesario, por tanto, estudiar el efecto de la cumarina en la expresión de otras integrinas. Este tipo de estudios permite el desarrollo de nuevas estrategias en la búsqueda de mejores agentes antineoplásicos que disminuyan en mayor grado el número y tamaño de metástasis, y retarden importantemente su producción; contribuye, adenomás, al conocimiento de la fisiopatogenia de estos tumores malignos

Actividad fagocítica de monocitos de sangre venosa de pacientes con tuberculosis pulmonar / Phagocytic activity of venous blood monocytes from patients with pulmonary tuberculosis

El papel que desempeña el macrófago en los individuos infectados con Mycobacterium tuberculosis es fundamental al inicio y durante el curso de la infección. En este trabajo, presentamos la actividad fagocítica in vitro de monocitos de sangre venosa aislados de pacientes tuberculosos. El parámetro estudiado fue la capacidad de los macrófagos para fogocitar eritrocitos de carnero en ensayos in vitro el cual se expresa como índice fagocítico(IF). Los resultados muestran que el IF se encuentra disminuido en los macrófagos de pacientes con tuberculosis PPD- y, en forma más evidente, en los pacientes PPD+ con respecto al IF mostrado por los macrófagos de individuos sanos. Estos resultados sugieren que la disfunción de la fagocitosis en los macrófagos de pacientes con tuberculosis contribuye a la cronicidad de la infección