Thermodynamic and structural determinants of differential Pdx1 binding to elements from the insulin and IAPP promoters.

Bastidas, Monique; Showalter, Scott A

Bastidas, Monique; Showalter, Scott A.

Afiliación

Bastidas M; Department of Chemistry, Pennsylvania State University, 104 Chemistry Building, University Park, PA 16802, USA. Electronic address: mob5256@psu.edu.

J Mol Biol ; 425(18): 3360-77, 2013 Sep 23.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-23796517

Asunto(s)

Proteínas de Homeodominio/química; Proteínas de Homeodominio/metabolismo; Insulina/genética; Polipéptido Amiloide de los Islotes Pancreáticos/genética; Regiones Promotoras Genéticas; Transactivadores/química; Transactivadores/metabolismo; Secuencia de Bases; Sitios de Unión/genética; ADN/química; ADN/metabolismo; Proteínas de Homeodominio/genética; Humanos; Insulina/metabolismo; Polipéptido Amiloide de los Islotes Pancreáticos/metabolismo; Modelos Moleculares; Simulación de Dinámica Molecular; Mutagénesis Sitio-Dirigida; Conformación de Ácido Nucleico; Regiones Promotoras Genéticas/genética; Unión Proteica; Estructura Cuaternaria de Proteína; Elementos de Respuesta/genética; Termodinámica; Transactivadores/genética

Palabras clave

2D; A-box element; HSQC; IAPP; ITC; MD; NOE; PDB; Pdx1; Protein Data Bank; SSP; diabetes; double-stranded deoxyribonucleic acid; dsDNA; heteronuclear single quantum coherence; homeodomain; islet amyloid polypeptide; isothermal titration calorimetry; molecular dynamics; nuclear Overhauser enhancement; nuclear magnetic resonance; pancreatic duodenal homeobox protein 1; secondary structure propensity; two-dimensional

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Transactivadores / Regiones Promotoras Genéticas / Proteínas de Homeodominio / Polipéptido Amiloide de los Islotes Pancreáticos / Insulina Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Mol Biol Año: 2013 Tipo del documento: Article

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