Transient Unfolding and Long-Range Interactions in Viral BCL2 M11 Enable Binding to the BECN1 BH3 Domain.

Ramanathan, Arvind; Parvatikar, Akash; Chennubhotla, Srinivas C; Mei, Yang; Sinha, Sangita C

Ramanathan, Arvind; Parvatikar, Akash; Chennubhotla, Srinivas C; Mei, Yang; Sinha, Sangita C.

Afiliación

Ramanathan A; Data Science and Learning Division, Argonne National Laboratory, Lemont, IL 60439, USA.
Parvatikar A; Consortium for Advanced Science and Engineering, University of Chicago, Chicago, IL 60637, USA.
Chennubhotla SC; Department of Computational and Systems Biology, University of Pittsburgh, PA 15260, USA.
Mei Y; Department of Computational and Systems Biology, University of Pittsburgh, PA 15260, USA.
Sinha SC; Department of Chemistry and Biochemistry, North Dakota State University, Fargo, ND 58108, USA.

Biomolecules ; 10(9)2020 09 11.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32932757

Asunto(s)

Beclina-1/química; Proteínas Proto-Oncogénicas c-bcl-2/química; Proteínas Virales/química; Animales; Beclina-1/genética; Beclina-1/metabolismo; Sitios de Unión; Gammaherpesvirinae/química; Gammaherpesvirinae/metabolismo; Humanos; Interacciones Hidrofóbicas e Hidrofílicas; Cinética; Aprendizaje Automático; Ratones; Modelos Moleculares; Simulación de Dinámica Molecular; Mutación; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Pliegue de Proteína; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; Proteínas Proto-Oncogénicas c-bcl-2/genética; Proteínas Proto-Oncogénicas c-bcl-2/metabolismo; Homología de Secuencia de Aminoácido; Termodinámica; Proteínas Virales/genética; Proteínas Virales/metabolismo

Palabras clave

BCL2; BECN1; intrinsic disorder; machine learning; transient folding

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Virales / Proteínas Proto-Oncogénicas c-bcl-2 / Beclina-1 Idioma: En Revista: Biomolecules Año: 2020 Tipo del documento: Article

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