cognac: rapid generation of concatenated gene alignments for phylogenetic inference from large, bacterial whole genome sequencing datasets.

Crawford, Ryan D; Snitkin, Evan S

Crawford, Ryan D; Snitkin, Evan S.

Afiliación

Crawford RD; Department of Computational Medicine and Bioinformatics, University of Michigan, Ann Arbor, MI, 48109, USA.
Snitkin ES; Department of Microbiology and Immunology, University of Michigan, Ann Arbor, MI, 48109, USA. esnitkin@umich.edu.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 70, 2021 Feb 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33588753

Asunto(s)

Bacterias; Genoma Bacteriano; Programas Informáticos; Bacterias/clasificación; Bacterias/genética; Bases de Datos Genéticas; Composición Familiar; Filogenia; Secuenciación Completa del Genoma

Palabras clave

Concatenated gene tree; Core genome; Multiple sequence alignment; Phylogenetics

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacterias / Programas Informáticos / Genoma Bacteriano Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article

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