Rapid identification of methylase specificity (RIMS-seq) jointly identifies methylated motifs and generates shotgun sequencing of bacterial genomes.

Baum, Chloé; Lin, Yu-Cheng; Fomenkov, Alexey; Anton, Brian P; Chen, Lixin; Yan, Bo; Evans, Thomas C; Roberts, Richard J; Tolonen, Andrew C; Ettwiller, Laurence

Baum, Chloé; Lin, Yu-Cheng; Fomenkov, Alexey; Anton, Brian P; Chen, Lixin; Yan, Bo; Evans, Thomas C; Roberts, Richard J; Tolonen, Andrew C; Ettwiller, Laurence.

Afiliación

Baum C; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Lin YC; Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, Université Paris-Saclay, 91000 Évry, France.
Fomenkov A; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Anton BP; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Chen L; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Yan B; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Evans TC; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Roberts RJ; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Tolonen AC; New England Biolabs, Inc. 240 County Road Ipswich, MA 01938, USA.
Ettwiller L; Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, Université Paris-Saclay, 91000 Évry, France.

Nucleic Acids Res ; 49(19): e113, 2021 11 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34417598

Asunto(s)

5-Metilcitosina/metabolismo; Metilasas de Modificación del ADN/metabolismo; Enzimas de Restricción del ADN/metabolismo; Escherichia coli K12/genética; Genoma Bacteriano; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Acinetobacter calcoaceticus/enzimología; Acinetobacter calcoaceticus/genética; Aeromonas hydrophila/enzimología; Aeromonas hydrophila/genética; Bacillus amyloliquefaciens/enzimología; Bacillus amyloliquefaciens/genética; Secuencia de Bases; Clostridium acetobutylicum/enzimología; Clostridium acetobutylicum/genética; Metilación de ADN; Metilasas de Modificación del ADN/genética; Enzimas de Restricción del ADN/genética; Escherichia coli K12/enzimología; Regulación Bacteriana de la Expresión Génica; Haemophilus/enzimología; Haemophilus/genética; Haemophilus influenzae/enzimología; Haemophilus influenzae/genética; Humanos; Microbiota/genética; Análisis de Secuencia de ADN; Piel/microbiología

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Metilasas de Modificación del ADN / Enzimas de Restricción del ADN / Genoma Bacteriano / 5-Metilcitosina / Escherichia coli K12 / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Diagnostic_studies Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Año: 2021 Tipo del documento: Article

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