Morphology, complete mitochondrial genome, and molecular phylogeny of Rhabdias macrocephalum n. sp. (Nematoda: Rhabdiasidae) from Diploderma splendidum (Reptilia: Agamidae).

ABSTRACT

Species of the genus Rhabdias Stiles & Hassall, 1905 are common parasitic nematodes occurring in the lungs of amphibians and reptiles worldwide. In the present study, Rhabdias macrocephalum n. sp. is described using integrated morphological methods (light and scanning electron microscopy) and molecular approaches (sequencing of the nuclear 28S and ITS regions, and mitochondrial cox1, cox2, and 12S genes) based on specimens collected from the green striped tree dragon Diploderma splendidum (Barbour & Dunn) (Reptilia Agamidae) in China. The complete mitochondrial genome of R. macrocephalum n. sp. was sequenced and annotated it is 14,819 bp in length, including 12 protein coding genes (missing atp8), 22 tRNA genes, 2 rRNA genes and three non-coding regions. The gene arrangement of R. macrocephalum n. sp. is different from all of the currently available mitogenomes of nematodes and represents a novel type of mitochondrial gene arrangement reported in Nematoda. Molecular phylogenetic results based on the ITS + 28S data support the monophyly of Entomelas, Pneumonema, Serpentirhabdias, and Rhabdias, and showed R. macrocephalum n. sp. forming a most basal lineage in Rhabdias.

Title Morphologie, génome mitochondrial complet et phylogénie moléculaire de Rhabdias macrocephalum n. sp. (Nematoda  Rhabdiasidae) de Diploderma splendidum (Reptilia  Agamidae). Abstract Les espèces du genre Rhabdias Stiles & Hassall, 1905 sont des nématodes parasites courants présents dans les poumons des amphibiens et des reptiles du monde entier. Dans cette étude, Rhabdias macrocephalum n. sp. est décrit à l'aide de méthodes morphologiques intégrées (microscopie optique et électronique à balayage) et d'approches moléculaires (séquençage des régions nucléaires 28S et ITS et des gènes mitochondriaux cox1, cox2 et 12S) basées sur des spécimens collectés chez le lézard Diploderma splendidum (Barbour & Dunn) (Reptilia  Agamidae) de Chine. Le génome mitochondrial complet de R. macrocephalum n. sp. a été séquencé et annoté  il a une longueur de 14 819 pb, dont 12 gènes codants pour des protéines (atp8 manquant), 22 gènes d'ARNt, 2 gènes d'ARNr et trois régions non codantes. L'arrangement génétique de R. macrocephalum n. sp. est différent de tous les mitogénomes de nématodes actuellement disponibles et représente un nouveau type d'arrangement de gènes mitochondriaux signalé chez les nématodes. Les résultats phylogénétiques moléculaires basés sur les données ITS + 28S ont soutenu la monophylie d'Entomelas, Pneumonema, Serpentirhabdias et Rhabdias, et ont montré que R. macrocephalum n. sp. forme la lignée la plus basale chez Rhabdias.