Flexible and accessible workflows for improved proteogenomic analysis using the Galaxy framework.

Jagtap, Pratik D; Johnson, James E; Onsongo, Getiria; Sadler, Fredrik W; Murray, Kevin; Wang, Yuanbo; Shenykman, Gloria M; Bandhakavi, Sricharan; Smith, Lloyd M; Griffin, Timothy J

Jagtap, Pratik D; Johnson, James E; Onsongo, Getiria; Sadler, Fredrik W; Murray, Kevin; Wang, Yuanbo; Shenykman, Gloria M; Bandhakavi, Sricharan; Smith, Lloyd M; Griffin, Timothy J.

Afiliação

Jagtap PD; Center for Mass Spectrometry and Proteomics, University of Minnesota , 43 Gortner Laboratory, 1479 Gortner Avenue, St. Paul, Minnesota 55108, United States.

J Proteome Res ; 13(12): 5898-908, 2014 Dec 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25301683

Assuntos

Proteoma/metabolismo; Saliva/metabolismo; DNA Complementar/genética; Biblioteca Gênica; Humanos; Proteoma/genética; Proteômica; Fases de Leitura; Software

Palavras-chave

customized database generation; peptide corresponding to a novel proteoform; peptide-spectral match evaluation; proteogenomics; salivary proteins; workflows

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Texto completo: 1 Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Saliva / Proteoma Limite: Humans Idioma: En Revista: J Proteome Res Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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