Búsqueda | Biblioteca Virtual en Salud Odontología. Uruguay

1.

Evolution of immune genes is associated with the Black Death.

Klunk, Jennifer; Vilgalys, Tauras P; Demeure, Christian E; Cheng, Xiaoheng; Shiratori, Mari; Madej, Julien; Beau, Rémi; Elli, Derek; Patino, Maria I; Redfern, Rebecca; DeWitte, Sharon N; Gamble, Julia A; Boldsen, Jesper L; Carmichael, Ann; Varlik, Nükhet; Eaton, Katherine; Grenier, Jean-Christophe; Golding, G Brian; Devault, Alison; Rouillard, Jean-Marie; Yotova, Vania; Sindeaux, Renata; Ye, Chun Jimmie; Bikaran, Matin; Dumaine, Anne; Brinkworth, Jessica F; Missiakas, Dominique; Rouleau, Guy A; Steinrücken, Matthias; Pizarro-Cerdá, Javier; Poinar, Hendrik N; Barreiro, Luis B.

Nature ; 611(7935): 312-319, 2022 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36261521

2.

Scoring alignments by embedding vector similarity.

Ashrafzadeh, Sepehr; Golding, G Brian; Ilie, Silvana; Ilie, Lucian.

Brief Bioinform ; 25(3)2024 Mar 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38695119

3.

Seq-InSite: sequence supersedes structure for protein interaction site prediction.

Hosseini, SeyedMohsen; Golding, G Brian; Ilie, Lucian.

Bioinformatics ; 40(1)2024 01 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38212995

4.

A 14th century CE Brucella melitensis genome and the recent expansion of the Western Mediterranean clade.

Long, George S; Hider, Jessica; Duggan, Ana T; Klunk, Jennifer; Eaton, Katherine; Karpinski, Emil; Giuffra, Valentina; Ventura, Luca; Prowse, Tracy L; Fornaciari, Antonio; Fornaciari, Gino; Holmes, Edward C; Golding, G Brian; Poinar, Hendrik N.

PLoS Pathog ; 19(7): e1011538, 2023 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37523413

5.

Low Complexity Regions in Proteins and DNA are Poorly Correlated.

Enright, Johanna M; Dickson, Zachery W; Golding, G Brian.

Mol Biol Evol ; 40(4)2023 04 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37036379

6.

Evolution of Transcript Abundance is Influenced by Indels in Protein Low Complexity Regions.

Dickson, Zachery W; Golding, G Brian.

J Mol Evol ; 92(2): 153-168, 2024 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38485789

7.

Low Complexity Regions in Mammalian Proteins are Associated with Low Protein Abundance and High Transcript Abundance.

Dickson, Zachery W; Golding, G Brian.

Mol Biol Evol ; 39(5)2022 05 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35482425

8.

LANDMark: an ensemble approach to the supervised selection of biomarkers in high-throughput sequencing data.

Rudar, Josip; Porter, Teresita M; Wright, Michael; Golding, G Brian; Hajibabaei, Mehrdad.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 110, 2022 Mar 31.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35361114

9.

DELPHI: accurate deep ensemble model for protein interaction sites prediction.

Li, Yiwei; Golding, G Brian; Ilie, Lucian.

Bioinformatics ; 37(7): 896-904, 2021 05 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32840562

10.

Genomic inversions in Escherichia coli alter gene expression and are associated with nucleoid protein binding sites.

Lato, Daniella F; Zeng, Qing; Golding, G Brian.

Genome ; 65(5): 287-299, 2022 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35073184

11.

Coding and long non-coding RNAs provide evidence of distinct transcriptional reprogramming for two ecotypes of the extremophile plant Eutrema salsugineum undergoing water deficit stress.

Simopoulos, Caitlin M A; MacLeod, Mitchell J R; Irani, Solmaz; Sung, Wilson W L; Champigny, Marc J; Summers, Peter S; Golding, G Brian; Weretilnyk, Elizabeth A.

BMC Genomics ; 21(1): 396, 2020 Jun 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32513102

12.

Spatial Patterns of Gene Expression in Bacterial Genomes.

Lato, Daniella F; Golding, G Brian.

J Mol Evol ; 88(6): 510-520, 2020 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32506154

13.

The role of introgression and ecotypic parallelism in delineating intraspecific conservation units.

Taylor, Rebecca S; Manseau, Micheline; Horn, Rebekah L; Keobouasone, Sonesinh; Golding, G Brian; Wilson, Paul J.

Mol Ecol ; 29(15): 2793-2809, 2020 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32567754

14.

Human-Specific Mutations and Positively Selected Sites in MARCO Confer Functional Changes.

Novakowski, Kyle E; Yap, Nicholas V L; Yin, Charles; Sakamoto, Kaori; Heit, Bryan; Golding, G Brian; Bowdish, Dawn M E.

Mol Biol Evol ; 35(2): 440-450, 2018 02 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29165618

15.

Sex solves Haldane's dilemma.

Hickey, Donal A; Golding, G Brian.

Genome ; 62(11): 761-768, 2019 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31437405

16.

Genetic resiliency and the Black Death: No apparent loss of mitogenomic diversity due to the Black Death in medieval London and Denmark.

Klunk, Jennifer; Duggan, Ana T; Redfern, Rebecca; Gamble, Julia; Boldsen, Jesper L; Golding, G Brian; Walter, Brittany S; Eaton, Katherine; Stangroom, Julianna; Rouillard, Jean-Marie; Devault, Alison; DeWitte, Sharon N; Poinar, Hendrik N.

Am J Phys Anthropol ; 169(2): 240-252, 2019 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30964548

17.

Prediction of plant lncRNA by ensemble machine learning classifiers.

Simopoulos, Caitlin M A; Weretilnyk, Elizabeth A; Golding, G Brian.

BMC Genomics ; 19(1): 316, 2018 May 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29720103

18.

Divergent subgenome evolution after allopolyploidization in African clawed frogs (Xenopus).

Furman, Benjamin L S; Dang, Utkarsh J; Evans, Ben J; Golding, G Brian.

J Evol Biol ; 31(12): 1945-1958, 2018 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30341989

19.

The advantage of recombination when selection is acting at many genetic Loci.

Hickey, Donal A; Golding, G Brian.

J Theor Biol ; 442: 123-128, 2018 04 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29355539

20.

Second-pandemic strain of Vibrio cholerae from the Philadelphia cholera outbreak of 1849.

Devault, Alison M; Golding, G Brian; Waglechner, Nicholas; Enk, Jacob M; Kuch, Melanie; Tien, Joseph H; Shi, Mang; Fisman, David N; Dhody, Anna N; Forrest, Stephen; Bos, Kirsten I; Earn, David J D; Holmes, Edward C; Poinar, Hendrik N.

N Engl J Med ; 370(4): 334-40, 2014 Jan 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24401020

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