Detalles de la búsqueda
1.
Recombination of repeat elements generates somatic complexity in human genomes.
Cell
; 185(16): 3025-3040.e6, 2022 08 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35882231
2.
Deep sequencing of short capped RNAs reveals novel families of noncoding RNAs.
Genome Res
; 2022 Aug 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35961773
3.
Defining super-enhancers by highly ranked histone H4 multi-acetylation levels identifies transcription factors associated with glioblastoma stem-like properties.
BMC Genomics
; 24(1): 574, 2023 Sep 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37759202
4.
Recounting the FANTOM CAGE-Associated Transcriptome.
Genome Res
; 30(7): 1073-1081, 2020 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32079618
5.
SCAFE: a software suite for analysis of transcribed cis-regulatory elements in single cells.
Bioinformatics
; 38(22): 5126-5128, 2022 11 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36173306
6.
Enhancer target prediction: state-of-the-art approaches and future prospects.
Biochem Soc Trans
; 51(5): 1975-1988, 2023 10 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37830459
7.
An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5' ends.
Nature
; 543(7644): 199-204, 2017 03 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28241135
8.
FANTOM enters 20th year: expansion of transcriptomic atlases and functional annotation of non-coding RNAs.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D892-D898, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33211864
9.
Expanded ENCODE delivers invaluable genomic encyclopedia.
Nature
; 583(7818): 685-686, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32728235
10.
Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D752-D758, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30407557
11.
Analysis of splice variants of the human protein disulfide isomerase (P4HB) gene.
BMC Genomics
; 21(1): 766, 2020 Nov 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33148170
12.
Exonuclease-mediated degradation of nascent RNA silences genes linked to severe malaria.
Nature
; 513(7518): 431-5, 2014 Sep 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25043062
13.
Analysis of the genome and transcriptome of Cryptococcus neoformans var. grubii reveals complex RNA expression and microevolution leading to virulence attenuation.
PLoS Genet
; 10(4): e1004261, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24743168
14.
Regulation of transcription termination by glucosylated hydroxymethyluracil, base J, in Leishmania major and Trypanosoma brucei.
Nucleic Acids Res
; 42(15): 9717-29, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25104019
15.
Comparative ribosome profiling reveals extensive translational complexity in different Trypanosoma brucei life cycle stages.
Nucleic Acids Res
; 42(6): 3623-37, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24442674
16.
Identification of the virulence landscape essential for Entamoeba histolytica invasion of the human colon.
PLoS Pathog
; 9(12): e1003824, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24385905
17.
Quantification of stochastic noise of splicing and polyadenylation in Entamoeba histolytica.
Nucleic Acids Res
; 41(3): 1936-52, 2013 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23258700
18.
Strand-specific RNA-Seq reveals widespread and developmentally regulated transcription of natural antisense transcripts in Plasmodium falciparum.
BMC Genomics
; 15: 150, 2014 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24559473
19.
Annotation of nuclear lncRNAs based on chromatin interactions.
PLoS One
; 19(5): e0295971, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38709794
20.
CamoTSS: analysis of alternative transcription start sites for cellular phenotypes and regulatory patterns from 5' scRNA-seq data.
Nat Commun
; 14(1): 7240, 2023 11 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37945584