Detalles de la búsqueda
1.
DIRECTEUR: transcriptome-based prediction of small molecules that replace transcription factors for direct cell conversion.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38273708
2.
Galectin-10 in serum extracellular vesicles reflects asthma pathophysiology.
J Allergy Clin Immunol
; 153(5): 1268-1281, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38551536
3.
From drug repositioning to target repositioning: prediction of therapeutic targets using genetically perturbed transcriptomic signatures.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i68-i76, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758779
4.
Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii99-ii105, 2022 09 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36124791
5.
TRANSDIRE: data-driven direct reprogramming by a pioneer factor-guided trans-omics approach.
Bioinformatics
; 38(10): 2839-2846, 2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35561200
6.
Epigenetic landscape of drug responses revealed through large-scale ChIP-seq data analyses.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 51, 2022 Jan 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35073843
7.
The novel driver gene ASAP2 is a potential druggable target in pancreatic cancer.
Cancer Sci
; 112(4): 1655-1668, 2021 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33605496
8.
Network-based characterization of disease-disease relationships in terms of drugs and therapeutic targets.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i516-i524, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657408
9.
Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm.
Bioinformatics
; 35(14): i191-i199, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510663
10.
PENDISC: a simple method for constructing a mathematical model from time-series data of metabolite concentrations.
Bull Math Biol
; 76(6): 1333-51, 2014 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24801819
11.
Network-based identification of diagnosis-specific trans-omic biomarkers via integration of multiple omics data.
Biosystems
; 236: 105122, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38199520
12.
De novo drug design based on patient gene expression profiles via deep learning.
Mol Inform
; 42(8-9): e2300064, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37475603
13.
Pathway trajectory analysis with tensor imputation reveals drug-induced single-cell transcriptomic landscape.
Nat Comput Sci
; 2(11): 758-770, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38177364
14.
Regulome-based characterization of drug activity across the human diseasome.
NPJ Syst Biol Appl
; 8(1): 44, 2022 11 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36344521
15.
Omics-based Identification of Glycan Structures as Biomarkers for a Variety of Diseases.
Mol Inform
; 39(1-2): e1900112, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31622036
16.
The Use of Large-Scale Chemically-Induced Transcriptome Data Acquired from LINCS to Study Small Molecules.
Methods Mol Biol
; 1888: 189-203, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30519948
17.
Predicting inhibitory and activatory drug targets by chemically and genetically perturbed transcriptome signatures.
Sci Rep
; 8(1): 156, 2018 01 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29317676
18.
Evaluation of an S-system root-finding method for estimating parameters in a metabolic reaction model.
Math Biosci
; 301: 21-31, 2018 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29410225
19.
Pathway-Based Drug Repositioning for Cancers: Computational Prediction and Experimental Validation.
J Med Chem
; 61(21): 9583-9595, 2018 11 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30371064
20.
KampoDB, database of predicted targets and functional annotations of natural medicines.
Sci Rep
; 8(1): 11216, 2018 07 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30046160