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Polymorphism in cathelicidin gene (CAMP) that alters Hypoxia-inducible factor (HIF-1α::ARNT) binding is not associated with tuberculosis.

López Campos, G N; Velarde Félix, J S; Sandoval Ramírez, L; Cázares Salazar, S; Corona Nakamura, A L; Amaya Tapia, G; Prado Montes de Oca, E.

Int J Immunogenet ; 41(1): 54-62, 2014 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23953711

RESUMEN

Polymorphisms in the CAMP gene (cathelicidin) have not been tested in tuberculosis susceptibility. We tested polymorphisms rs9844812 (HIF-1α::ARNT binding site) and rs56122065 (CAMP) plus rs1800972 (DEFB1). SNP rs1800972 was associated with extrapulmonary tuberculosis (EPTB) in a codominant model (genotype CG, P = 0.037, OR 4.82; 95% CI: 0.92-47.42; statistical power, 82%), but not PTB (P = 0.101) in a Mexican population.

Asunto(s)

Péptidos Catiónicos Antimicrobianos/genética , Predisposición Genética a la Enfermedad , Subunidad alfa del Factor 1 Inducible por Hipoxia/genética , Polimorfismo Genético , Tuberculosis/genética , Regiones no Traducidas 5' , Alelos , Secuencia de Aminoácidos , Péptidos Catiónicos Antimicrobianos/química , Translocador Nuclear del Receptor de Aril Hidrocarburo/genética , Translocador Nuclear del Receptor de Aril Hidrocarburo/metabolismo , Secuencia de Bases , Sitios de Unión , Estudios de Casos y Controles , Exones , Frecuencia de los Genes , Genotipo , Humanos , Subunidad alfa del Factor 1 Inducible por Hipoxia/metabolismo , Datos de Secuencia Molecular , Motivos de Nucleótidos , Polimorfismo de Nucleótido Simple , Posición Específica de Matrices de Puntuación , Regiones Promotoras Genéticas , Unión Proteica , Tuberculosis/metabolismo , Tuberculosis Pulmonar/genética , Tuberculosis Pulmonar/metabolismo , beta-Defensinas/genética , Catelicidinas

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