Detalles de la búsqueda
1.
Comprehensive assessment of 11 de novo HiFi assemblers on complex eukaryotic genomes and metagenomes.
Genome Res
; 34(2): 326-340, 2024 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38428994
2.
Babesia BdFE1 esterase is required for the anti-parasitic activity of the ACE inhibitor fosinopril.
J Biol Chem
; 299(11): 105313, 2023 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37797695
3.
Karyotype variation, spontaneous genome rearrangements affecting chemical insensitivity, and expression level polymorphisms in the plant pathogen Phytophthora infestans revealed using its first chromosome-scale assembly.
PLoS Pathog
; 18(10): e1010869, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36215336
4.
Prediction of histone post-translational modifications using deep learning.
Bioinformatics
; 36(24): 5610-5617, 2021 Apr 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33367499
5.
Reference-agnostic representation and visualization of pan-genomes.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 502, 2021 Oct 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34656081
6.
DeeplyEssential: a deep neural network for predicting essential genes in microbes.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 14): 367, 2020 Sep 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32998698
7.
The genome of cowpea (Vigna unguiculata [L.] Walp.).
Plant J
; 98(5): 767-782, 2019 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31017340
8.
Accurate detection of chimeric contigs via Bionano optical maps.
Bioinformatics
; 35(10): 1760-1762, 2019 05 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30295726
9.
Selfish: discovery of differential chromatin interactions via a self-similarity measure.
Bioinformatics
; 35(14): i145-i153, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510653
10.
A multi-parent advanced generation inter-cross (MAGIC) population for genetic analysis and improvement of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp.).
Plant J
; 93(6): 1129-1142, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29356213
11.
Novo&Stitch: accurate reconciliation of genome assemblies via optical maps.
Bioinformatics
; 34(13): i43-i51, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949964
12.
Validating genome-wide CRISPR-Cas9 function improves screening in the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica.
Metab Eng
; 55: 102-110, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31216436
13.
Genome resources for climate-resilient cowpea, an essential crop for food security.
Plant J
; 89(5): 1042-1054, 2017 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27775877
14.
Higher classification sensitivity of short metagenomic reads with CLARK-S.
Bioinformatics
; 32(24): 3823-3825, 2016 12 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27540266
15.
BRAT-nova: fast and accurate mapping of bisulfite-treated reads.
Bioinformatics
; 32(17): 2696-8, 2016 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153660
16.
rasbhari: Optimizing Spaced Seeds for Database Searching, Read Mapping and Alignment-Free Sequence Comparison.
PLoS Comput Biol
; 12(10): e1005107, 2016 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27760124
17.
Sequencing of 15 622 gene-bearing BACs clarifies the gene-dense regions of the barley genome.
Plant J
; 84(1): 216-27, 2015 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26252423
18.
De novo meta-assembly of ultra-deep sequencing data.
Bioinformatics
; 31(12): i9-16, 2015 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26072514
19.
When less is more: 'slicing' sequencing data improves read decoding accuracy and de novo assembly quality.
Bioinformatics
; 31(18): 2972-80, 2015 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25995232
20.
CLARK: fast and accurate classification of metagenomic and genomic sequences using discriminative k-mers.
BMC Genomics
; 16: 236, 2015 Mar 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25879410