Detalles de la búsqueda
1.
Rearrangements within the U6 snRNA Core during the Transition between the Two Catalytic Steps of Splicing.
Mol Cell
; 75(3): 538-548.e3, 2019 08 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31229405
2.
SimRNAweb v2.0: a web server for RNA folding simulations and 3D structure modeling, with optional restraints and enhanced analysis of folding trajectories.
Nucleic Acids Res
; 2024 May 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38738621
3.
RNA 3D structure modeling by fragment assembly with small-angle X-ray scattering restraints.
Bioinformatics
; 39(9)2023 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37647627
4.
rna-tools.online: a Swiss army knife for RNA 3D structure modeling workflow.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W657-W662, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35580057
5.
RNA-Puzzles Round IV: 3D structure predictions of four ribozymes and two aptamers.
RNA
; 26(8): 982-995, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32371455
6.
RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation tools.
Nucleic Acids Res
; 48(2): 576-588, 2020 01 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31799609
7.
RNArchitecture: a database and a classification system of RNA families, with a focus on structural information.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D202-D205, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29069520
8.
RNA 3D structure prediction guided by independent folding of homologous sequences.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 512, 2019 Oct 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31640563
9.
RNA-Puzzles Round III: 3D RNA structure prediction of five riboswitches and one ribozyme.
RNA
; 23(5): 655-672, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28138060
10.
SimRNAweb: a web server for RNA 3D structure modeling with optional restraints.
Nucleic Acids Res
; 44(W1): W315-9, 2016 07 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27095203
11.
RNA-Puzzles Round II: assessment of RNA structure prediction programs applied to three large RNA structures.
RNA
; 21(6): 1066-84, 2015 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25883046
12.
NPDock: a web server for protein-nucleic acid docking.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W425-30, 2015 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25977296
13.
Computational modeling of protein-RNA complex structures.
Methods
; 65(3): 310-9, 2014 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24083976
14.
Computational modeling of RNA 3D structures, with the aid of experimental restraints.
RNA Biol
; 11(5): 522-36, 2014.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24785264
15.
Structural bioinformatics of the human spliceosomal proteome.
Nucleic Acids Res
; 40(15): 7046-65, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22573172
16.
RNA3DB: A structurally-dissimilar dataset split for training and benchmarking deep learning models for RNA structure prediction.
J Mol Biol
; : 168552, 2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38552946
17.
RNA3DB: A structurally-dissimilar dataset split for training and benchmarking deep learning models for RNA structure prediction.
bioRxiv
; 2024 Mar 11.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38352531
18.
MetaLocGramN: A meta-predictor of protein subcellular localization for Gram-negative bacteria.
Biochim Biophys Acta
; 1824(12): 1425-33, 2012 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22705560
19.
RNA 3D Structure Comparison Using RNA-Puzzles Toolkit.
Methods Mol Biol
; 2586: 263-285, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36705910
20.
Modeling of Protein-RNA Complex Structures Using Computational Docking Methods.
Methods Mol Biol
; 1414: 353-72, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27094302