Detalles de la búsqueda
1.
Training machine learning potentials for reactive systems: A Colab tutorial on basic models.
J Comput Chem
; 45(10): 638-647, 2024 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38082539
2.
Bridging semiempirical and ab initio QM/MM potentials by Gaussian process regression and its sparse variants for free energy simulation.
J Chem Phys
; 159(5)2023 Aug 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37530109
3.
Facilitating ab initio QM/MM free energy simulations by Gaussian process regression with derivative observations.
Phys Chem Chem Phys
; 24(41): 25134-25143, 2022 Oct 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36222412
4.
Computational Investigation of Substituent Effects on the Fluorescence Wavelengths of Oxyluciferin Analogs.
J Photochem Photobiol A Chem
; 4312022 Oct 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36407037
5.
Oxymatrine promotes hypertrophic scar repair through reduced human scar fibroblast viability, collagen and induced apoptosis via autophagy inhibition.
Int Wound J
; 19(5): 1221-1231, 2022 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34749441
6.
Affordable Ab Initio Path Integral for Thermodynamic Properties via Molecular Dynamics Simulations Using Semiempirical Reference Potential.
J Phys Chem A
; 125(50): 10677-10685, 2021 Dec 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34894680
7.
A simplified charge projection scheme for long-range electrostatics in ab initio QM/MM calculations.
J Chem Phys
; 154(2): 024115, 2021 Jan 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33445891
8.
Controlling the Cleavage of Carbon-Carbon Bonds To Generate α,α-Difluorobenzyl Carbanions for the Construction of Difluoromethylbenzenes.
J Org Chem
; 84(18): 11665-11675, 2019 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31449418
9.
Accelerated computation of free energy profile at ab initio quantum mechanical/molecular mechanical accuracy via a semi-empirical reference potential. II. Recalibrating semi-empirical parameters with force matching.
Phys Chem Chem Phys
; 21(37): 20595-20605, 2019 Oct 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31508625
10.
Representation of the QM Subsystem for Long-Range Electrostatic Interaction in Non-Periodic Ab Initio QM/MM Calculations.
Molecules
; 23(10)2018 Sep 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30274290
11.
Free Energy Profile Decomposition Analysis for QM/MM Simulations of Enzymatic Reactions.
J Chem Theory Comput
; 19(22): 8234-8244, 2023 Nov 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37943896
12.
Shikonin promotes hypertrophic scar repair by autophagy of hypertrophic scar-derived fibroblasts.
Acta Cir Bras
; 38: e384623, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37878984
13.
Machine learning based implicit solvent model for aqueous-solution alanine dipeptide molecular dynamics simulations.
RSC Adv
; 13(7): 4565-4577, 2023 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36760282
14.
Visualization of Electron Density Changes Along Chemical Reaction Pathways.
Mol Phys
; 121(9-10)2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37638114
15.
Perspective: Reference-Potential Methods for the Study of Thermodynamic Properties in Chemical Processes: Theory, Applications, and Pitfalls.
J Phys Chem Lett
; 14(20): 4866-4875, 2023 May 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37196031
16.
Stereoelectronic control in regioselective carbohydrate protection.
J Org Chem
; 77(3): 1457-67, 2012 Feb 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22283732
17.
Role of p53-dependent placental apoptosis in the reproductive and developmental toxicities of caffeine in rodents.
Clin Exp Pharmacol Physiol
; 39(4): 357-63, 2012 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22243401
18.
Accelerating Ab Initio Quantum Mechanical and Molecular Mechanical (QM/MM) Molecular Dynamics Simulations with Multiple Time Step Integration and a Recalibrated Semiempirical QM/MM Hamiltonian.
J Phys Chem B
; 2022 Jun 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35653199
19.
Elucidation of the methyl transfer mechanism catalyzed by chalcone O-methyltransferase: a density functional study.
J Comput Chem
; 32(14): 3068-74, 2011 Nov 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21815175
20.
Li1.2Mn0.54Ni0.13Co0.13O2 nanosheets with porous structure as a high-performance cathode material for lithium-ion batteries.
RSC Adv
; 11(58): 36588-36595, 2021 Nov 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35494357