String kernels for protein sequence comparisons: improved fold recognition.

Nojoomi, Saghi; Koehl, Patrice

Nojoomi, Saghi; Koehl, Patrice.

Afiliación

Nojoomi S; Biotechnology program, University of California, Davis, 1, Shields Avenue, Davis, CA, 95616, USA.
Koehl P; Department of Computer Science and Genome Center, 1, Shields Avenue, Davis, CA, 95616, USA. pakoehl@ucdavis.edu.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 137, 2017 Feb 28.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28245816

Asunto(s)

Análisis de Secuencia de Proteína/métodos; Homología de Secuencia de Aminoácido; Algoritmos; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/química; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/clasificación; Filogenia; Pliegue de Proteína; Proteínas/química; Alineación de Secuencia

Palabras clave

Alignment free methods; Kernel; Protein sequence

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Homología de Secuencia de Aminoácido / Análisis de Secuencia de Proteína Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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