Prevalence and Implications of Contamination in Public Genomic Resources: A Case Study of 43 Reference Arthropod Assemblies.

Francois, Clementine M; Durand, Faustine; Figuet, Emeric; Galtier, Nicolas

Francois, Clementine M; Durand, Faustine; Figuet, Emeric; Galtier, Nicolas.

Afiliación

Francois CM; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France clementine.francois@univ-lyon1.fr.
Durand F; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.
Figuet E; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.
Galtier N; UMR 5554, Institut des Sciences de l'Evolution; CNRS, University of Montpellier, IRD, EPHE, Montpellier, France.

G3 (Bethesda) ; 10(2): 721-730, 2020 02 06.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31862787

Asunto(s)

Artrópodos/genética; Contaminación de ADN; Genoma; Genómica; Animales; Biología Computacional/métodos; Bases de Datos Genéticas; Genoma de los Insectos; Genómica/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Humanos; Anotación de Secuencia Molecular; Filogenia; Reproducibilidad de los Resultados; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

automated detection pipeline; contaminant sequences; curation of genomic databases; horizontal gene transfer

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Artrópodos / Genoma / Genómica / Contaminación de ADN Tipo de estudio: Prevalence_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: G3 (Bethesda) Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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