In silico identification of novel SARS-COV-2 2'-O-methyltransferase (nsp16) inhibitors: structure-based virtual screening, molecular dynamics simulation and MM-PBSA approaches.

El Hassab, Mahmoud A; Ibrahim, Tamer M; Al-Rashood, Sara T; Alharbi, Amal; Eskandrani, Razan O; Eldehna, Wagdy M

El Hassab, Mahmoud A; Ibrahim, Tamer M; Al-Rashood, Sara T; Alharbi, Amal; Eskandrani, Razan O; Eldehna, Wagdy M.

Afiliación

El Hassab MA; Department of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of Pharmacy, Badr University in Cairo (BUC), Badr City, Egypt.
Ibrahim TM; Department of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of Pharmacy, Kafrelsheikh University, Kafrelsheikh, Egypt.
Al-Rashood ST; Department of Pharmaceutical Chemistry, College of Pharmacy, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia.
Alharbi A; Department of Pharmaceutical Chemistry, College of Pharmacy, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia.
Eskandrani RO; Department of Pharmaceutical Chemistry, College of Pharmacy, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia.
Eldehna WM; Department of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of Pharmacy, Kafrelsheikh University, Kafrelsheikh, Egypt.

J Enzyme Inhib Med Chem ; 36(1): 727-736, 2021 Dec.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33685335

Asunto(s)

Antivirales/química; Inhibidores Enzimáticos/química; SARS-CoV-2/enzimología; Proteínas no Estructurales Virales/química; Adenosina/análogos & derivados; Adenosina/química; Adenosina/metabolismo; Antivirales/metabolismo; Sitios de Unión; Cristalografía por Rayos X; Bases de Datos Farmacéuticas; Bases de Datos de Proteínas; Estabilidad de Medicamentos; Inhibidores Enzimáticos/metabolismo; Ensayos Analíticos de Alto Rendimiento; Humanos; Cinética; Metiltransferasas; Simulación del Acoplamiento Molecular; Simulación de Dinámica Molecular; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Conformación Proteica en Lámina beta; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; SARS-CoV-2/química; Termodinámica; Proteínas no Estructurales Virales/antagonistas & inhibidores

Palabras clave

3D pharmacophore; COVID-19 therapies; MM-PBSA calculations; SARS COV-2 2'-O-methyltransferase (nsp16) Inhibitor; molecular dynamics

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Antivirales / Proteínas no Estructurales Virales / Inhibidores Enzimáticos / SARS-CoV-2 Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Screening_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: J Enzyme Inhib Med Chem Asunto de la revista: BIOQUIMICA / QUIMICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Egipto

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