Sediment-associated microbial community profiling: sample pre-processing through sequential membrane filtration for 16S rRNA amplicon sequencing.

Serrana, Joeselle M; Watanabe, Kozo

Serrana, Joeselle M; Watanabe, Kozo.

Afiliación

Serrana JM; Center for Marine Environmental Studies (CMES), Ehime University, Bunkyo-cho 3, Matsuyama, Ehime, 790-8577, Japan.
Watanabe K; Center for Marine Environmental Studies (CMES), Ehime University, Bunkyo-cho 3, Matsuyama, Ehime, 790-8577, Japan. watanabe.kozo.mj@ehime-u.ac.jp.

BMC Microbiol ; 22(1): 33, 2022 01 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35057747

Asunto(s)

Bacterias/genética; Bacterias/aislamiento & purificación; ADN Bacteriano/genética; Sedimentos Geológicos/microbiología; Microbiota/genética; ARN Ribosómico 16S/genética; Bacterias/clasificación; Biología Computacional; ADN Bacteriano/aislamiento & purificación; ADN Bacteriano/normas; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Filtros Microporos; Filogenia; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Manejo de Especímenes/métodos

Palabras clave

16S rRNA amplicon sequencing; River sediments; Sediment-associated microbial communities; Sequential membrane filtration

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacterias / ADN Bacteriano / ARN Ribosómico 16S / Sedimentos Geológicos / Microbiota Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: BMC Microbiol Asunto de la revista: MICROBIOLOGIA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Japón

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