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1.

The transcriptome of early GGT/KRT19-positive hepatocellular carcinoma reveals a downregulated gene expression profile associated with fatty acid metabolism.

Castro-Gil, María Paulette; Torres-Mena, Julia Esperanza; Salgado, Rosa M; Muñoz-Montero, Said A; Martínez-Garcés, José Michael; López-Torres, Carlos David; Mendoza-Vargas, Alfredo; Gabiño-López, Nayeli Belem; Villa-Treviño, Saúl; Del Pozo-Yauner, Luis; Arellanes-Robledo, Jaime; Krötzsch, Edgar; Pérez-Carreón, Julio Isael.

Genomics ; 114(1): 72-83, 2022 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34861383

2.

Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico.

Rodríguez-Maldonado, Abril Paulina; Vázquez-Pérez, Joel Armando; Cedro-Tanda, Alberto; Taboada, Blanca; Boukadida, Celia; Wong-Arámbula, Claudia; Nuñez-García, Tatiana Ernestina; Cruz-Ortiz, Natividad; Barrera-Badillo, Gisela; Hernández-Rivas, Lucía; López-Martínez, Irma; Mendoza-Vargas, Alfredo; Reyes-Grajeda, Juan Pablo; Alcaraz, Nicolas; Peñaloza-Figueroa, Fernando; Gonzalez-Barrera, Dulibeth; Rangel-DeLeon, Daniel; Herrera-Montalvo, Luis Alonso; Mejía-Nepomuceno, Fidencio; Hernández-Terán, Alejandra; Mújica-Sánchez, Mario; Becerril-Vargas, Eduardo; Martínez-Orozco, José Arturo; Pérez-Padilla, Rogelio; Salas-Hernández, Jorge; Sanchez-Flores, Alejandro; Isa, Pavel; Matías-Florentino, Margarita; Ávila-Ríos, Santiago; Muñoz-Medina, José Esteban; Grajales-Muñiz, Concepción; Salas-Lais, Angel Gustavo; Santos Coy-Arechavaleta, Andrea; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Arias, Carlos F; Ramírez-González, José Ernesto.

Arch Virol ; 166(11): 3173-3177, 2021 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34448936

3.

Metatranscriptomic analysis to define the Secrebiome, and 16S rRNA profiling of the gut microbiome in obesity and metabolic syndrome of Mexican children.

Gallardo-Becerra, Luigui; Cornejo-Granados, Fernanda; García-López, Rodrigo; Valdez-Lara, Alejandra; Bikel, Shirley; Canizales-Quinteros, Samuel; López-Contreras, Blanca E; Mendoza-Vargas, Alfredo; Nielsen, Henrik; Ochoa-Leyva, Adrián.

Microb Cell Fact ; 19(1): 61, 2020 Mar 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32143621

4.

RNA-Seq analysis of the multipartite genome of Rhizobium etli CE3 shows different replicon contributions under heat and saline shock.

López-Leal, Gamaliel; Tabche, Maria Luisa; Castillo-Ramírez, Santiago; Mendoza-Vargas, Alfredo; Ramírez-Romero, Miguel A; Dávila, Guillermo.

BMC Genomics ; 15: 770, 2014 Sep 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25201548

5.

RegulonDB version 7.0: transcriptional regulation of Escherichia coli K-12 integrated within genetic sensory response units (Gensor Units).

Gama-Castro, Socorro; Salgado, Heladia; Peralta-Gil, Martin; Santos-Zavaleta, Alberto; Muñiz-Rascado, Luis; Solano-Lira, Hilda; Jimenez-Jacinto, Verónica; Weiss, Verena; García-Sotelo, Jair S; López-Fuentes, Alejandra; Porrón-Sotelo, Liliana; Alquicira-Hernández, Shirley; Medina-Rivera, Alejandra; Martínez-Flores, Irma; Alquicira-Hernández, Kevin; Martínez-Adame, Ruth; Bonavides-Martínez, César; Miranda-Ríos, Juan; Huerta, Araceli M; Mendoza-Vargas, Alfredo; Collado-Torres, Leonardo; Taboada, Blanca; Vega-Alvarado, Leticia; Olvera, Maricela; Olvera, Leticia; Grande, Ricardo; Morett, Enrique; Collado-Vides, Julio.

Nucleic Acids Res ; 39(Database issue): D98-105, 2011 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21051347

6.

SARS-CoV-2 Genome Variations in Viral Shedding of an Immunocompromised Patient with Non-Hodgkin's Lymphoma.

Villaseñor-Echavarri, Rodrigo; Gomez-Romero, Laura; Martin-Onraet, Alexandra; Herrera, Luis A; Escobar-Arrazola, Marco A; Ramirez-Vega, Oscar A; Barrientos-Flores, Corazón; Mendoza-Vargas, Alfredo; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Vilar-Compte, Diana; Cedro-Tanda, Alberto.

Viruses ; 15(2)2023 01 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36851588

7.

Clinical and Virological Features of SARS-CoV-2 Variants during the Four Waves of the Pandemic in the Mexican Southeast.

Baeza-Flores, Guadalupe Del Carmen; Luna-Arias, Juan Pedro; Ruiz-Quiñones, Jesús Arturo; Boldo-León, Xavier Miguel; Cedro-Tanda, Alberto; Garnica-López, Dora; Mendoza-Vargas, Alfredo; Magaña-Cerino, Jesús M; Martínez-López, Mirian Carolina.

Trop Med Infect Dis ; 8(3)2023 Feb 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36977135

8.

Rhizobial extrachromosomal replicon variability, stability and expression in natural niches.

López-Guerrero, Martha G; Ormeño-Orrillo, Ernesto; Acosta, José Luis; Mendoza-Vargas, Alfredo; Rogel, Marco A; Ramírez, Miguel Angel; Rosenblueth, Mónica; Martínez-Romero, Julio; Martínez-Romero, Esperanza.

Plasmid ; 68(3): 149-58, 2012 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22813963

9.

Analytical Performances of the COVISTIX^TM Antigen Rapid Test for SARS-CoV-2 Detection in an Unselected Population (All-Comers).

Garcia-Cardenas, Francisco; Peñaloza, Fernando; Bertin-Montoya, Jennifer; Valdéz-Vázquez, Rafael; Franco, Alba; Cortés, Ricardo; Frias-Jimenez, Emmanuel; Cedro-Tanda, Alberto; Mendoza-Vargas, Alfredo; Reyes-Grajeda, Juan Pablo; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Herrera, Luis A.

Pathogens ; 11(6)2022 May 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35745482

10.

End-point RT-PCR based on a conservation landscape for SARS-COV-2 detection.

Cruz-Rangel, Armando; Gómez-Romero, Laura; Cisneros-Villanueva, Mireya; de Anda Jáuregui, G; Luna-Pineda, Victor; Cedro-Tanda, Alberto; Campos-Romero, Abraham; Mendoza-Vargas, Alfredo; Reyes-Grajeda, J P; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Herrera, Luis A; Vadillo-Ortega, Felipe.

Sci Rep ; 12(1): 4759, 2022 03 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35306521

11.

Early Genomic, Epidemiological, and Clinical Description of the SARS-CoV-2 Omicron Variant in Mexico City.

Cedro-Tanda, Alberto; Gómez-Romero, Laura; de Anda-Jauregui, Guillermo; Garnica-López, Dora; Alfaro-Mora, Yair; Sánchez-Xochipa, Sonia; García-García, Eulices F; Mendoza-Vargas, Alfredo; Frías-Jiménez, Emmanuel J; Moreno, Bernardo; Campos-Romero, Abraham; Moreno-Camacho, José L; Alcantar-Fernández, Jonathan; Ortíz-Ramírez, Jesús; Benitez-González, Mariana; Trejo-González, Roxana; Aguirre-Chavarría, Daniel; Núñez-Martínez, Marcela E; Uribe-Figueroa, Laura; Angulo, Ofelia; Ruiz, Rosaura; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Herrera, Luis A.

Viruses ; 14(3)2022 03 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35336952

12.

Intestinal microbiota fingerprint in subjects with irritable bowel syndrome responders to a low FODMAP diet.

Valdez-Palomares, Fernanda; Nambo-Venegas, Rafael; Uribe-García, Jacqueline; Mendoza-Vargas, Alfredo; Granados-Portillo, Omar; Meraz-Cruz, Noemí; Palacios-González, Berenice.

Food Funct ; 12(7): 3206-3218, 2021 Apr 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33877245

13.

Lovastatin as a supplement to mitigate rumen methanogenesis: an overview.

Ábrego-Gacía, Amaury; Poggi-Varaldo, Héctor M; Robles-González, Vania; Ponce-Noyola, Teresa; Calva-Calva, Graciano; Ríos-Leal, Elvira; Estrada-Bárcenas, Daniel; Mendoza-Vargas, Alfredo.

J Anim Sci Biotechnol ; 12(1): 123, 2021 Dec 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34911584

14.

Gut dsDNA virome shows diversity and richness alterations associated with childhood obesity and metabolic syndrome.

Bikel, Shirley; López-Leal, Gamaliel; Cornejo-Granados, Fernanda; Gallardo-Becerra, Luigui; García-López, Rodrigo; Sánchez, Filiberto; Equihua-Medina, Edgar; Ochoa-Romo, Juan Pablo; López-Contreras, Blanca Estela; Canizales-Quinteros, Samuel; Hernández-Reyna, Abigail; Mendoza-Vargas, Alfredo; Ochoa-Leyva, Adrian.

iScience ; 24(8): 102900, 2021 Aug 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34409269

15.

The Evolutionary Landscape of SARS-CoV-2 Variant B.1.1.519 and Its Clinical Impact in Mexico City.

Cedro-Tanda, Alberto; Gómez-Romero, Laura; Alcaraz, Nicolás; de Anda-Jauregui, Guillermo; Peñaloza, Fernando; Moreno, Bernardo; Escobar-Arrazola, Marco A; Ramirez-Vega, Oscar A; Munguia-Garza, Paulina; Garcia-Cardenas, Francisco; Cisneros-Villanueva, Mireya; Moreno-Camacho, Jose L; Rodriguez-Gallegos, Jorge; Luna-Ruiz Esparza, Marco A; Fernández Rojas, Miguel A; Mendoza-Vargas, Alfredo; Reyes-Grajeda, Juan Pablo; Campos-Romero, Abraham; Angulo, Ofelia; Ruiz, Rosaura; Sheinbaum-Pardo, Claudia; Sifuentes-Osornio, José; Kershenobich, David; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Herrera, Luis A.

Viruses ; 13(11)2021 10 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34834987

16.

Saliva is a reliable and accessible source for the detection of SARS-CoV-2.

Herrera, Luis A; Hidalgo-Miranda, Alfredo; Reynoso-Noverón, Nancy; Meneses-García, Abelardo A; Mendoza-Vargas, Alfredo; Reyes-Grajeda, Juan P; Vadillo-Ortega, Felipe; Cedro-Tanda, Alberto; Peñaloza, Fernando; Frías-Jimenez, Emmanuel; Arriaga-Canon, Cristian; Ruiz, Rosaura; Angulo, Ofelia; López-Villaseñor, Imelda; Amador-Bedolla, Carlos; Vilar-Compte, Diana; Cornejo, Patricia; Cisneros-Villanueva, Mireya; Hurtado-Cordova, Eduardo; Cendejas-Orozco, Mariana; Hernández-Morales, José S; Moreno, Bernardo; Hernández-Cruz, Irwin A; Herrera, César A; García, Francisco; González-Woge, Miguel A; Munguía-Garza, Paulina; Luna-Maldonado, Fernando; Sánchez-Vizcarra, Antonia; Osnaya, Vincent G; Medina-Molotla, Nelly; Alfaro-Mora, Yair; Cáceres-Gutiérrez, Rodrigo E; Tolentino-García, Laura; Rosas-Escobar, Patricia; Román-González, Sergio A; Escobar-Arrazola, Marco A; Canseco-Méndez, Julio C; Ortiz-Soriano, Diana R; Domínguez-Ortiz, Julieta; González-Barrera, Ana D; Aparicio-Bautista, Diana I; Cruz-Rangel, Armando; Alarcón-Zendejas, Ana Paula; Contreras-Espinosa, Laura; González, Rodrigo; Guerra-Calderas, Lissania; Meraz-Rodríguez, Marco A; Montalvo-Casimiro, Michel; Montiel-Manríquez, Rogelio.

Int J Infect Dis ; 105: 83-90, 2021 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33581365

17.

Doing More with Less: A Comparison of 16S Hypervariable Regions in Search of Defining the Shrimp Microbiota.

García-López, Rodrigo; Cornejo-Granados, Fernanda; Lopez-Zavala, Alonso A; Sánchez-López, Filiberto; Cota-Huízar, Andrés; Sotelo-Mundo, Rogerio R; Guerrero, Abraham; Mendoza-Vargas, Alfredo; Gómez-Gil, Bruno; Ochoa-Leyva, Adrian.

Microorganisms ; 8(1)2020 Jan 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31963525

18.

Relevance of epidemiological surveillance in travelers: an imported case of Leishmania tropica in Mexico.

Fernández-Figueroa, Edith Araceli; Sánchez-Montes, Sokani; Miranda-Ortíz, Haydee; Mendoza-Vargas, Alfredo; Cervantes-Sarabia, Rocely; Cárdenas-Ovando, Roberto Alejandro; Ruiz-Remigio, Adriana; Becker, Ingeborg.

Rev Inst Med Trop Sao Paulo ; 62: e41, 2020.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32578727

19.

Effect of Dietary Magnesium Content on Intestinal Microbiota of Rats.

García-Legorreta, Arantxa; Soriano-Pérez, Luis Alfonso; Flores-Buendía, Aline Mariana; Medina-Campos, Omar Noel; Noriega, Lilia G; Granados-Portillo, Omar; Nambo-Venegas, Rafael; Tovar, Armando R; Mendoza-Vargas, Alfredo; Barrera-Oviedo, Diana; Pedraza-Chaverri, José; Palacios-González, Berenice.

Nutrients ; 12(9)2020 Sep 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32971775

20.

Functional and taxonomic classification of a greenhouse water drain metagenome.

López-Leal, Gamaliel; Cornejo-Granados, Fernanda; Hurtado-Ramírez, Juan Manuel; Mendoza-Vargas, Alfredo; Ochoa-Leyva, Adrian.

Stand Genomic Sci ; 13: 20, 2018.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30323887

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