Detalles de la búsqueda
1.
Experimental and Theoretical Studies on the Reactions of Aliphatic Imines with Isocyanates.
Chemistry
; 30(14): e202304272, 2024 Mar 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38226702
2.
Combining IC50 or Ki Values from Different Sources Is a Source of Significant Noise.
J Chem Inf Model
; 64(5): 1560-1567, 2024 Mar 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38394344
3.
Unraveling motion in proteins by combining NMR relaxometry and molecular dynamics simulations: A case study on ubiquitin.
J Chem Phys
; 160(10)2024 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38465679
4.
Accounting for Solvation Correlation Effects on the Thermodynamics of Water Networks in Protein Cavities.
J Chem Inf Model
; 63(6): 1794-1805, 2023 03 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36917685
5.
Accelerating Alchemical Free Energy Prediction Using a Multistate Method: Application to Multiple Kinases.
J Chem Inf Model
; 63(22): 7133-7147, 2023 Nov 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37948537
6.
DASH: Dynamic Attention-Based Substructure Hierarchy for Partial Charge Assignment.
J Chem Inf Model
; 63(19): 6014-6028, 2023 Oct 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37738206
7.
Improving the IR spectra alignment algorithm with spectra deconvolution and combination with Raman or VCD spectroscopy.
Phys Chem Chem Phys
; 25(3): 2063-2074, 2023 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36546852
8.
Influence of the Fluorophore Mobility on Distance Measurements by Gas-Phase FRET.
J Phys Chem A
; 127(27): 5620-5628, 2023 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37403246
9.
Implicit solvent approach based on generalized Born and transferable graph neural networks for molecular dynamics simulations.
J Chem Phys
; 158(20)2023 May 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37212404
10.
Energy-based clustering: Fast and robust clustering of data with known likelihood functions.
J Chem Phys
; 159(2)2023 Jul 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37428043
11.
Simulation of aqueous solutes using the adaptive solvent-scaling (AdSoS) scheme.
J Chem Phys
; 159(23)2023 Dec 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38099543
12.
Predicting Collagen Triple Helix Stability through Additive Effects of Terminal Residues and Caps.
Angew Chem Int Ed Engl
; 62(3): e202214728, 2023 01 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36409045
13.
Frame Shifts Affect the Stability of Collagen Triple Helices.
J Am Chem Soc
; 144(40): 18642-18649, 2022 10 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36179150
14.
Replica-Exchange Enveloping Distribution Sampling Using Generalized AMBER Force-Field Topologies: Application to Relative Hydration Free-Energy Calculations for Large Sets of Molecules.
J Chem Inf Model
; 62(12): 3043-3056, 2022 06 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35675713
15.
Incorporating NOE-Derived Distances in Conformer Generation of Cyclic Peptides with Distance Geometry.
J Chem Inf Model
; 62(3): 472-485, 2022 02 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35029985
16.
RestraintMaker: a graph-based approach to select distance restraints in free-energy calculations with dual topology.
J Comput Aided Mol Des
; 36(3): 175-192, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35314898
17.
Relative free-energy calculations for scaffold hopping-type transformations with an automated RE-EDS sampling procedure.
J Comput Aided Mol Des
; 36(2): 117-130, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34978000
18.
Enhanced sampling without borders: on global biasing functions and how to reweight them.
Phys Chem Chem Phys
; 24(3): 1225-1236, 2022 Jan 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34935813
19.
Graph-convolutional neural networks for (QM)ML/MM molecular dynamics simulations.
Phys Chem Chem Phys
; 24(37): 22497-22512, 2022 Sep 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36106790
20.
Impact of solvent interactions on 1H and 13C chemical shifts investigated using DFT and a reference dataset recorded in CDCl3 and CCl4.
Phys Chem Chem Phys
; 24(38): 23551-23560, 2022 Oct 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36129319