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1.

Regulatory networks and 5' partner usage of miRNA host gene fusions in breast cancer.

Hafstað, Völundur; Søkilde, Rolf; Häkkinen, Jari; Larsson, Malin; Vallon-Christersson, Johan; Rovira, Carlos; Persson, Helena.

Int J Cancer ; 151(1): 95-106, 2022 07 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35182081

2.

Analysis of fusion transcripts indicates widespread deregulation of snoRNAs and their host genes in breast cancer.

Persson, Helena; Søkilde, Rolf; Häkkinen, Jari; Vallon-Christersson, Johan; Mitelman, Felix; Borg, Åke; Höglund, Mattias; Rovira, Carlos.

Int J Cancer ; 146(12): 3343-3353, 2020 06 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32067223

3.

Refinement of breast cancer molecular classification by miRNA expression profiles.

Søkilde, Rolf; Persson, Helena; Ehinger, Anna; Pirona, Anna Chiara; Fernö, Mårten; Hegardt, Cecilia; Larsson, Christer; Loman, Niklas; Malmberg, Martin; Rydén, Lisa; Saal, Lao; Borg, Åke; Vallon-Christerson, Johan; Rovira, Carlos.

BMC Genomics ; 20(1): 503, 2019 Jun 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31208318

4.

PAPD5-mediated 3' adenylation and subsequent degradation of miR-21 is disrupted in proliferative disease.

Boele, Joost; Persson, Helena; Shin, Jay W; Ishizu, Yuri; Newie, Inga S; Søkilde, Rolf; Hawkins, Shannon M; Coarfa, Cristian; Ikeda, Kazuhiro; Takayama, Ken-ichi; Horie-Inoue, Kuniko; Ando, Yoshinari; Burroughs, A Maxwell; Sasaki, Chihiro; Suzuki, Chizuru; Sakai, Mizuho; Aoki, Shintaro; Ogawa, Ayumi; Hasegawa, Akira; Lizio, Marina; Kaida, Kaoru; Teusink, Bas; Carninci, Piero; Suzuki, Harukazu; Inoue, Satoshi; Gunaratne, Preethi H; Rovira, Carlos; Hayashizaki, Yoshihide; de Hoon, Michiel J L.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 111(31): 11467-72, 2014 Aug 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25049417

5.

Mining of public sequencing databases supports a non-dietary origin for putative foreign miRNAs: underestimated effects of contamination in NGS.

Tosar, Juan Pablo; Rovira, Carlos; Naya, Hugo; Cayota, Alfonso.

RNA ; 20(6): 754-7, 2014 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24729469

6.

Passenger strand loading in overexpression experiments using microRNA mimics.

Søkilde, Rolf; Newie, Inga; Persson, Helena; Borg, Åke; Rovira, Carlos.

RNA Biol ; 12(8): 787-91, 2015.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26121563

7.

Comparative microRNA profiling of Trypanosoma cruzi infected human cells.

Rego, Natalia; Libisch, María Gabriela; Rovira, Carlos; Tosar, Juan Pablo; Robello, Carlos.

Front Cell Infect Microbiol ; 13: 1187375, 2023.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37424776

8.

Search for an aetiological virus candidate in chronic lymphocytic leukaemia by extensive transcriptome analysis.

Rego, Natalia; Bianchi, Sergio; Moreno, Pilar; Persson, Helena; Kvist, Anders; Pena, Alvaro; Oppezzo, Pablo; Naya, Hugo; Rovira, Carlos; Dighiero, Guillermo; Pritsch, Otto.

Br J Haematol ; 157(6): 709-17, 2012 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22489537

9.

Expression of MicroRNAs Is Dysregulated by HIV While Mycobacterium tuberculosis Drives Alterations of Small Nucleolar RNAs in HIV Positive Adults With Active Tuberculosis.

Olsson, Oskar; Tesfaye, Fregenet; Søkilde, Rolf; Mazurek, Jolanta; Abebe, Markos; Yeba, Habtamu; Aseffa, Abraham; Skogmar, Sten; Balcha, Taye Tolera; Rovira, Carlos; Björkman, Per; Jansson, Marianne.

Front Microbiol ; 12: 808250, 2021.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35295678

10.

MicroRNAs and other small silencing RNAs in cancer.

Rovira, Carlos; Güida, Maria C; Cayota, Alfonso.

IUBMB Life ; 62(12): 859-68, 2010 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21154820

11.

Fine-tuning the metabolic rewiring and adaptation of translational machinery during an epithelial-mesenchymal transition in breast cancer cells.

Fernández-Calero, Tamara; Davyt, Marcos; Perelmuter, Karen; Chalar, Cora; Bampi, Giovana; Persson, Helena; Tosar, Juan Pablo; Hafstað, Völundur; Naya, Hugo; Rovira, Carlos; Bollati-Fogolín, Mariela; Ehrlich, Ricardo; Flouriot, Gilles; Ignatova, Zoya; Marín, Mónica.

Cancer Metab ; 8: 8, 2020.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32699630

12.

MiRNA expression in urothelial carcinomas: important roles of miR-10a, miR-222, miR-125b, miR-7 and miR-452 for tumor stage and metastasis, and frequent homozygous losses of miR-31.

Veerla, Srinivas; Lindgren, David; Kvist, Anders; Frigyesi, Attila; Staaf, Johan; Persson, Helena; Liedberg, Fredrik; Chebil, Gunilla; Gudjonsson, Sigurdur; Borg, Ake; Månsson, Wiking; Rovira, Carlos; Höglund, Mattias.

Int J Cancer ; 124(9): 2236-42, 2009 May 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19127597

13.

HER2 and p95HER2 differentially regulate miRNA expression in MCF-7 breast cancer cells and downregulate MYB proteins through miR-221/222 and miR-503.

Gorbatenko, Andrej; Søkilde, Rolf; Sorensen, Ester E; Newie, Inga; Persson, Helena; Morancho, Beatriz; Arribas, Joaquin; Litman, Thomas; Rovira, Carlos; Pedersen, Stine Falsig.

Sci Rep ; 9(1): 3352, 2019 03 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30833639

14.

miRNA-convergent gene fusions.

Rovira, Carlos.

Mol Cell Oncol ; 5(1): e1406433, 2018.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29404401

15.

Non-coding RNA fragments account for the majority of annotated piRNAs expressed in somatic non-gonadal tissues.

Tosar, Juan Pablo; Rovira, Carlos; Cayota, Alfonso.

Commun Biol ; 1: 2, 2018.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30271890

16.

A validation and extended description of the Lund taxonomy for urothelial carcinoma using the TCGA cohort.

Marzouka, Nour-Al-Dain; Eriksson, Pontus; Rovira, Carlos; Liedberg, Fredrik; Sjödahl, Gottfrid; Höglund, Mattias.

Sci Rep ; 8(1): 3737, 2018 02 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29487377

17.

Non-coding antisense transcription detected by conventional and single-stranded cDNA microarray.

Vallon-Christersson, Johan; Staaf, Johan; Kvist, Anders; Medstrand, Patrik; Borg, Ake; Rovira, Carlos.

BMC Genomics ; 8: 295, 2007 Aug 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17727707

18.

Translational machinery and protein folding: evidence of conformational variants of the estrogen receptor alpha.

Horjales, Sofía; Cota, Germán; Señorale-Pose, Mario; Rovira, Carlos; Román, Estela; Artagaveytia, Nora; Ehrlich, Ricardo; Marín, Mónica.

Arch Biochem Biophys ; 467(2): 139-43, 2007 Nov 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17900518

19.

Promoter usage of BRCA1-IRIS.

Kvist, Anders; Rovira, Carlos; Borg, Ake; Medstrand, Patrik.

Nat Cell Biol ; 7(4): 325-6; author rply 326, 2005 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15803125

20.

Preparation of highly multiplexed small RNA sequencing libraries.

Persson, Helena; Søkilde, Rolf; Pirona, Anna Chiara; Rovira, Carlos.

Biotechniques ; 63(2): 57-64, 2017 08 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28803540

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