[MLVA analysis and virulence profile of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus causing infections in Paraguayan children]. / Análisis MLVA y perfil de virulencia de aislamientos de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina adquiridos en la comunidad causantes de infecciones pediátricas en Paraguay.

Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) is one of the first causes of skin and soft tissue infections, and can also produce severe diseases such as osteomyelitis and pneumonia. The aim of this descriptive study was to determine the SCCmec type and virulence profile and to study the genetic diversity by MLVA analysis of 21 CA-MRSA isolates that infected Paraguayan children in 2010. The SCCmec type and virulence factors were performed by PCR and genetic diversity by MLVA (multiple locus variable analysis). All the isolates carried SCCmec cassette iv. hla, hlb and sea genes were detected in 28,6%, 9,5% and 4,8% respectively. The MLVA analysis showed high genetic diversity with congruent antibiotic resistance and virulence profiles. This study revealed the presence of CA-MRSA harbouring SCCmeciv with high genetic diversity, providing information not available in our country.

Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) clones from Paraguayan children.

INTRODUCTION: Staphylococcus aureus is considered one of the most important human pathogens, and its levels of resistance to methicillin have increased even in strains isolated from people without nosocomial risk factors. Molecular analysis is essential for understanding the patterns of dissemination. The objective of this study was to identify community-acquired methicillin-resistant S. aureus (CA-MRSA) clones that infected Paraguayan children patients in two periods of time. METHODOLOGY: An observational, descriptive study was designed to determine the genetic variability of 115 isolates of CA-MRSA recovered from children who attended four reference centers in Paraguay between 2009-2010 and 2012-2013. RESULTS: The combined use of Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE), Multi-Locus Sequencing Typing, Multi-Locus Variable Analysis (MLVA) and Spa typing techniques allowed the identification of two dominant clones: ST30-IV-t019 (77%) and ST5-IV-t311 (10%), and the establishment of the former as the leading cause of CA-MRSA infections in children during the study period. CONCLUSIONS: This is the first study that provides epidemiological information as well as microbiological and molecular characteristics of CA-MRSA isolates recovered from children from Asunción and the Central Department of Paraguay.

[Inducible resistance to clindamycin in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from Paraguayan children]. / Resistencia inducible a clindamicina en Staphylococcus aureus resistentes a meticilina aislados de pacientes pediátricos en Paraguay.

BACKGROUND: The double disc diffusion method is an alternative diagnostic that allows the identification of Staphylococcus aureus isolates apparently susceptible to clindamycin but that may develop resistance due to an induction phenomena, mainly asociated to the increase in resistance to methicillin, thus increasing the possibility of failure in the treatment. AIM: To determine the frequency of induced clindamycin resistance in methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolated from Paraguayan children. MATERIALS AND METHODS: In this cross sectional study, we collected 145 S. aureus isolates that caused skin and soft tissue and osteoarticular infections in pediatric patients of the Central Hospital I.P.S. in the period from December-2012 to November-2013. Resistance to clindamycin was determined by automated methods and double disc diffusion. PCR was performed for ermA, ermB, ermC and msrA genes from representative isolates. RESULTS: The global resistance to methicillin and clindamycin was 67 and 13%, respectively (11% attributable to the inducible mechanism). The ermC and msrA genes were detected individually in 25 and 17% of the isolates respectively while an isolate presented both genes simultaneously. DISCUSSION: The frequency of inducible resistance to clindamycin indicates the importance of double disc diffusion methods in microbiological practice, as well as being within the cut off points considered acceptable for the use of this antibiotic for skin infections. and osteoarticular caused by MRSA.

Progresión de los componentes de la presión arterial y la correlación con las medidas antropométricas y laboratoriales en adultos jóvenes / Progression of blood pressure components and correlation with anthropometric and laboratory measurements in young adults

Introducción: La presencia de hipertensión arterial en población joven aumenta el riesgo de eventos cardiovasculares en la mediana edad y como consecuencia una morbimortalidad prematura. El propósito de este estudio es evaluar la progresión de los componentes de la presión arterial y la correlación con las medidas antropométricas y laboratoriales en estudiantes de la Universidad Nacional de Asunción- Paraguay. Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo correlacional, longitudinal, prospectivo, desde el año 2013 hasta el año 2017 evaluando al inicio 284 universitarios y 240 al final de las carreras. Se midieron variables sociodemográficas, antropométricas, presión arterial, determinaciones bioquímicas. La progresión de los componentes de la presión arterial, de las variables antropométricas y clínicas se calcularon mediante la prueba T de muestras relacionadas. La correlación de la presión arterial sistólica y presión arterial diastólica con las variables antropométricas y laboratoriales con la correlación de Pearson. Resultados: La progresión de los componentes de la presión arterial presentó una diferencia estadísticamente significativa en la presión arterial sistólica, presión arterial diastólica y presión de pulso. En relación con las características antropométricas y clínicas de los estudiantes se encontró una diferencia estadísticamente significativa entre la medición inicial y final en el peso, perímetro abdominal, glicemia, insulina, colesterol total, colesterol de alta densidad, colesterol de baja densidad, triglicéridos y proteína C reactiva. La correlación más importante encontrada entre las medidas antropométricas con la presión arterial sistólica y presión arterial diastólica fue la circunferencia abdominal. Conclusión: Se encontró aumento de la tendencia de la presión arterial y de otros factores de riesgo cardiovascular en universitarios.

Introduction: The presence of arterial hypertension in young population increases the risk of cardiovascular events in middle age and as a consequence premature morbimortality. The purpose of this study was to evaluate the progression of blood pressure components and the correlation with anthropometric and laboratory measurements in students of the National University of Asuncion, Paraguay. Materials and methods: A descriptive correlational, longitudinal, prospective, descriptive study was conducted from 2013 to 2017 evaluating at the beginning 284 undergraduates and 240 at the end of the careers. Sociodemographic variables, anthropometric variables, blood pressure, biochemical determinations were measured. The progression of blood pressure components, anthropometric and clinical variables were calculated using the related samples t-test. The correlation of systolic blood pressure and diastolic blood pressure with anthropometric and laboratory variables was correlated with Pearson's correlation. Results: The progression of blood pressure components presented a statistically significant difference in systolic blood pressure, diastolic blood pressure and pulse pressure. In relation to the anthropometric and clinical characteristics of the students, a statistically significant difference was found between the initial and final measurements in weight, abdominal perimeter, glycemia, insulin, total cholesterol, high-density cholesterol, low-density cholesterol, triglycerides, and C-reactive protein. The most important correlation found between anthropometric measurements with systolic blood pressure and diastolic blood pressure was abdominal circumference. Conclusion: An increase in the trend of blood pressure and other cardiovascular risk factors was found in university students.

Progresión de los determinantes de factores de riesgo cardiovascular en estudiantes de la Universidad Nacional de Asunción-Paraguay

RESUMEN Los factores de riesgo cardiovascular empiezan a edad temprana de la vida y causan morbimortalidad prematura. Se evaluó la progresión de hipertensión arterial y de otros factores de riesgo cardiovascular en estudiantes de la Universidad Nacional de Asunción- Paraguay. Estudio descriptivo en el que se compararon dos mediciones transversales (año 2013 y 2017). Se estudió a 284 universitarios al inicio y a 240 al final de las carreras. Se midieron variables sociodemográficas, antropométricas, presión arterial, determinaciones bioquímicas, consumo de alcohol y tabaco. La presión arterial se clasificó según el Séptimo informe del Comité Nacional para la Prevención, Detección, Evaluación y Tratamiento de la Hipertensión arterial. Se aplicó la prueba t-Student para variables continuas y Chi cuadrado para variables categóricas y regresión logística para asociación entre hipertensión y factores de riesgo cardiovascular. Se encontró hipertensión en el grupo año 2013 en 6,7% (IC del 95%:3,4-10%) de los estudiantes y en el grupo año 2017 en 21,2% (IC del 95%:17,8-24,6%) de los estudiantes (p= <0,001). En hombres se encontró aumento de la tendencia de c-HDL disminuido, triglicéridos aumentados, consumo de alcohol y en el índice de resistencia a la insulina (p<0,05), y en mujeres aumento del consumo de alcohol, del hábito sedentario y del índice de resistencia a la insulina (p < 0,05). Había una asociación de la hipertensión con la circunferencia abdominal aumentada (OR: 15,7; IC del 95%: 4,6-53,5; p=<0,001). Se encontró aumento de la tendencia de la presión arterial y de otros factores de riesgo cardiovascular en universitarios.

ABSTRACT Cardiovascular risk factors begin at an early age of life and cause premature morbidity and mortality. The progression of arterial hypertension and other cardiovascular risk factors in students of the National University of Asunción-Paraguay was evaluated. Descriptive study in which two cross-sectional measurements (year 2013 and 2017) were compared. Two hundred eighty-four university students were studied at the beginning and 240 at the end of their careers. Sociodemographic, anthropometric, blood pressure, biochemical determinations, alcohol and tobacco consumption were measured. Blood pressure was classified according to the Seventh Report of the Joint National Committee on the Prevention, Detection, Evaluation and Treatment of High Blood Pressure. The t-Student test was applied for continuous variables and Chi square for categorical variables and logistic regression for association between hypertension and cardiovascular risk factors. Hypertension was found in the 2013 group in 6.7% (95% CI: 3.4-10%) of the students and in the 2017 group in 21.2% (95% CI: 17.8-24, 6%) of the students (p = <0.001). In men, there was an increase in the tendency of decreased c-HDL, increased triglycerides, alcohol consumption and insulin resistance index (p <0.05), and in women an increase in alcohol consumption, sedentary habits and insulin resistance index (p <0.05). There was an association of hypertension with increased abdominal circumference (OR: 15.7; 95% CI: 4.6-53.5; p = <0.001). An increase was found in the tendency of blood pressure and other cardiovascular risk factors in university students.

Vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en cepas de Neisseria gonorrhoeae aisladas en Paraguay. Año 2021

Neisseria gonorrhoeae (N. gonorrhoeae) es el agente causal de la gonorrea, infección de transmisión sexual (ITS) que corresponde a la segunda causa más frecuente de ITS a nivel mundial, provocando una alta morbilidad y costo en atención de salud. En las últimas décadas han aumentado los reportes a nivel mundial de cepas resistentes a penicilina, sulfonamidas, tetraciclina, macrólidos y fluoroquinolonas, y más recientemente a azitromicina y cefalosporinas de espectro extendido como ceftriaxona y cefixima. El objetivo principal de este estudio fue determinar la sensibilidad a los antimicrobianos en cepas de N. gonorrhoeae que fueron enviadas al Laboratorio Central de Salud Pública (LCSP), por los centros colaboradores de la Red de Vigilancia Laboratorial de la Resistencia a los Antimicrobianos (RAM). Para ello, se realizó un estudio prospectivo de corte transversal de enero a diciembre de 2021. Se caracterizaron 128 cepas como N. gonorrhoeae a las cuales se le realizaron pruebas de susceptibilidad obteniéndose 48% de resistencia y 52% de sensibilidad intermedia a penicilina. El 70% presentó resistencia a ciprofloxacina y el 19% a tetraciclina. Se obtuvo 100% de sensibilidad a ceftriaxona y cefixima. El fenotipo de resistencia de mayor prevalencia fue QRNG, asociado con resistencia a ciprofloxacina, seguido del fenotipo PPNG-QRNG, asociado con resistencia a penicilina y ciprofloxacina. Ante estos hallazgos y frente a la emergencia mundial de la resistencia a los antimicrobianos, especialmente de cefalosporinas de espectro extendido, se recomienda que los laboratorios de bacteriología fortalezcan la vigilancia para apoyar la detección de casos y proporcionar el tratamiento adecuado.

Neisseria gonorrhoeae (N. gonorrhoeae) is the causal agent of gonorrhea, a sexually transmitted infection (STI) that is the second most common cause of STIs worldwide, causing high morbidity and cost in health care. In recent decades, reports of strains resistant to penicillin, fluoroquinolones, sulfonamides, tetracycline, macrolides, and more recently to azithromycin and extended-spectrum cephalosporins such as ceftriaxone and cefixime have increased worldwide. The main objective of this study was to determine the sensitivity to antimicrobials in N. gonorrhoeae strains that were sent to the Central Laboratory of Public Health (LCSP), by the collaborating centers of the Antimicrobial Resistance Laboratory Surveillance Network (RAM). For this, a prospective cross-sectional study was carried out from January to December, 2021. One hundred eighty strains were characterized as N. gonorrhoeae, which were subjected to sensitivity tests, obtaining 48% resistance and 52% intermediate sensitivity to penicillin while 70% presented resistance to ciprofloxacin and 19% to tetracycline. Also, 100% sensitivity to ceftriaxone and cefixime was obtained. The most prevalent resistance phenotype was QRNG, associated with resistance to ciprofloxacin, followed by the PPNG-QRNG phenotype, associated with resistance to penicillin and ciprofloxacin. Given these findings and the global emergence of antimicrobial resistance, especially extended-spectrum cephalosporins, it is recommended that bacteriology laboratories fortify surveillance to support case detection and provide appropriate treatment.

Epidemiologia de los casos de COVID - 19 diagnosticados en albergues sanitarios del gran Asunción, Paraguay (2020) / Epidemiology of COVID cases - 19 diagnosed in sanitary shelters in greater Asunción, Paraguay (2020)

Paraguay habilitó albergues sanitarios para que guarden cuarentena las personas venidas del exterior, como medida para evitar la propagación de casos de COVI-19. El objetivo fue describir las características epidemiológicas de los casos de COVID-19 diagnosticados en los albergues sanitarios en el Gran Asunción desde el 7 de marzo al 30 de setiembre. Estudio descriptivo, transversal, temporalmente retrospectivo. El muestreo fue no probabilístico de casos consecutivos. Las variables de los casos confirmados fueron, sexo, edad y distritos. Fueron utilizados datos de acceso abierto del Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Para análisis estadístico de las variables fueron incluidas frecuencias, expresadas como porcentajes, para lo cual fue utilizado el programa Excel. Se diagnosticaron 390 casos en el Gran Asunción. El mayor número de casos se registró en agosto (118 casos). El 69,2% (270) de los casos en el Gran Asunción fue del sexo masculino, relación hombre/mujer de 2,3. El 34,9% (136) tenía edades entre 20 a 29 años, (promedio 33.8±16,14, IC95% 2,2- 65,5). El 80% (310) del total se presentó en menores de 50 años. Las ciudades con mayor cantidad de casos fueron Asunción (46,2%, 180) y los Distritos de Luque (8,7%, 34); Ñemby (6,4%, 25) y Capiatá (5,1%,20). Las características epidemiológicas presentadas son las esperadas, dado el perfil sociodemográfico de estas ciudades

Paraguay opened sanitary shelters to quarantine people arriving from abroad, as a measure to prevent the spread of COVID-19 cases. The objective was to describe the epidemiological characteristics of COVID-19 cases diagnosed in sanitary shelters in Greater Asunción from March 7 to September 30. It was a descriptive, cross-sectional, temporally retrospective study, with non - probabilistic sampling of consecutive cases. The variables of confirmed cases in quarantine facilities were sex, age and departments. Open access data from the Ministry of Public Health and Social Welfare were used. For statistical analysis of the variables, frequencies, expressed as percentages, were included and the Excel program was used for it. Three hundred and ninety cases were diagnosed in Greater Asunción. The highest number of cases was in August (118 cases), 69.2% (270) of the cases in Greater Asunción were male, with a male/female ratio of 2.3, 34.9% (136) ranged from 20 to 29 years old, (mean 33.8 ±16.14, 95% CI 2.2-65.5). Eighty percent (310) of the cases occurred in the population under 50 years of age. The locations that presented the highest number of cases were Asunción (46.2%, 180) and the Districts of Luque (8.7%, 34); Ñemby (6.4%, 25) and Capiatá (5.1%, 20). The epidemiological characteristics presented were expected given the socio demographic profile of these cities

Epidemiology of COVID-19 cases diagnosed at quarantine facilities in Paraguay / Epidemiologia dos casos de COVID-19 diagnosticados nas instalações de quarentena no Paraguai

Aims: This study aimed to describe the epidemiological characteristics of COVID-19 cases diagnosed inquarantine facilities in Paraguay. Methods: This was a descriptive, cross-sectional, temporarily retrospective study. The time scope was from April 1 to September 30 2020. The variables were sex, age and administrative departments. The open access data available on the website of the Ministry of Public Health and Social Welfare was used. Frequencies expressed in percentages and the Chi square value were calculated to observe the statistically significant differences between cases and age and sex. Results: from April 4 to September 30 2020, 1.581 cases were diagnosed in COVID-19. The fewest number of positive cases were reported in April (50) and the highest number was reported in May (628). From the total, 69.6% (1.101) were male, (male / female ratio 2.3), 42.1% (666) were aged between 20-29 years, the average age was 30.23 years (range 0 to 87, standard deviation 14.66. 95% CI 1.5 - 58.95). The departments with the highest number of cases were Caaguazú 21.7 % (343), Alto Paraná 17.3 % (274), Central 13.3% (210) and Asunción 11.4% (180). The least number of cases of COVID-10 in women were registered in the Departments of Amambay, Pdte. Hayes, Ñeembucú and Boquerón, and in men the Departments of Ñeembucú and Boquerón. The largest number of male cases were registered in Caaguazú 70.8% (243), Alto Paraná 66.1% (181), Central 69.5% (146) and Asunción 68.9% (124). The number of Covid-19 infected people in quarantine facilities presented statistically significant differences between the variables sex and age. Conclusion: the quarantine facilities are one of the measures that the Paraguayan government needed to avoid the rapid spread and dispersion of the virus. The epidemiology of the cases diagnosed in them corresponds to what was expected according to the characteristics of the country.

Objetivo: descrever as características epidemiológicas dos casos de COVID-19 diagnosticados em instalações de quarentena no Paraguai. Metodologia: estudo descritivo, transversal, temporalmente retrospectivo. Quanto ao âmbito temporal foi considerado o período de 1 de abril a 31 de setembro de 2020. As variáveis analisadas foram: sexo, idade e Departamentos Administrativos. Foram utilizados dados abertos de acesso público que estão disponíveis na página oficial do Ministério da Saúde Pública e Bem-Estar Social. Foram calculadas frequências expressadas em porcentagem e aplicado o teste de qui-quadrado para ver diferenças estatisticamente significativas entre os casos, idade e sexo. Resultados: De 4 de abril a 30 de setembro de 2020, foram diagnosticados 1.581 casos de COVID-19. Em abril houve a menor quantidade de casos positivos (50) e em maio a maior quantidade (628). 69.6% (1.101) foram em indivíduos do sexo masculino (relação homem/mulher de 2,3). 42.1% (666) tinham idade compreendida entre 20-29 anos, com uma média de 30.23 anos (classificação 0 a 87, desvio padrão 14,66, IC 95% 1.5 ­ 58.95). Os Departamentos com maior número de casos foram 21.7 % (343), Alto Paraná 17.3 % (274), Central 13.3% (210) e Assunção 11.4% (180). O menor número de casos de COVID-19 em mulheres foi registado nos Departamentos de Amambay, Pdte. Hayes, Ñeembucú e Boquerón, e nos homens, os Departamentos de Ñeembucú e Boquerón. A maior quantidade de casos no sexo masculino foi registrado em Caaguazú 70.8% (243), Alto Paraná 66.1% (181), Central 69.5% (146) e Assunção 68.9% (124). O número de infectados por COVID-19 nos albergues apresentou diferenças estatisticamente significativas entre as variáveis sexo e idade. Conclusão: Os abrigos temporários são uma das importantes medidas adotadas pelo governo paraguaio para evitar a rápida dispersão e propagação do vírus. A epidemiologia dos casos neles diagnosticados correspondem às esperadas para as características do país.

[Community-acquired Staphylococcus aureus isolated from Paraguayan children: clinical, phenotypic and genotypic characterization]. / Staphylococcus aureus adquiridos en la comunidad: caracterización clínica, fenotípica y genotípica de aislados en niños paraguayos.

INTRODUCTION: The prevalence of Staphylococcus aureus in the community has increased, being the pediatric population the most affected. This fact highlights the need for epidemiological surveillance. AIM: To characterize clinical, phenotypic and genotypic isolates of S. aureus children's samples with community-acquired infections, collected in hospitals of Asuncion and the Central Department, between November 2009 and December 2010. MATERIALS AND METHODS: Descriptive and transverse analysis with analytical component. Clinical data collected by medical records, antibiotic susceptibility according to CLSI criteria and detection of mecA (encoding methicillin resistance) and luk-PV genes (encoding Panton Valentine leucocidin) by PCR using specific oligonucleotides. RESULTS: 123 isolates of S. aureus, 76% came from skin and soft tissue infections and 20% from sepsis. 18.7% (n = 23) were resistant to methicillin (MRSA). The presence of the mecA gene, a variant there and the PVL was detected in 12.2 and 48 isolates respectively. 43% of MRSA (n = 10) was carrying luk-PV. The clinical and demographic differences between patients infected with MRSA or MSSA were not statistically significant. DISCUSSION: This study constitutes the first phenotypic and genotypic characterization of S. aureus associated with pediatric patients in Paraguay.

Identificación de los mecanismos resistencia enzimáticos en uropatógenos de pacientes ambulatorios de un hospital público de San Lorenzo, Paraguay; 2015-2019 / Identification of enzyme resistance mechanisms in pathogens from an outpatient clinic in a public hospital in San Lorenzo, Paraguay; 2015-2019

Introducción: El propósito del estudio es determinar en los urocultivos, la prevalencia de los mecanismos enzimáticos de resistencia encontrados in vitro. Materiales y métodos: Se realizó un estudio retrospectivo, de ambos sexos, mayores de 18 años, que acudieron al Consultorio Externo de Clínica Médica y Urgencias por síntomas de infección urinaria. Se incluyeron todos los urocultivos en los que se aislaron uropatógenos con recuento ≥ 105 UFC/mL. Se excluyeron los urocultivos polimicrobianos, los que no contaban con antibiograma o aquellos con datos clínicos incompletos. Resultados: Se identificaron 1031 urocultivos que cumplieron con los criterios establecidos para la realización del estudio. El 56% correspondió al sexo femenino y el 43% al masculino. La edad media de las mujeres fue de 52± 20 años y el de los hombres fue de 62±16 años. Los uropatógenos más frecuentes fueron Escherichia coli 553 (52% en promedio) seguida de Klebsiella pneumoniae con 148 (14% en promedio). Urocultivos de varones: El principal mecanismo de resistencia de Escherichia coli fueron las BLEE, 55 aislamientos (91%); seguida de las MBL, 3 aislamientos (5%) y KPC, 2 aislamientos (3%). En Klebsiella pneumoniae en 53 aislamientos se puedo observar: BLEE, 31 aislamientos (58%); seguida de las KPC 13 aislamientos (25%) y MBL, 9 aislamientos en (16%). Urocultivos en mujeres: Las enzimas de Escherichia coli fueron 81 aislamientos, de los cuales fueron BLEE, 79 aislamientos (97%); seguido de las KPC, 1 aislamiento (1%) y las MBL, 1 aislamiento (1%). En Klebsiella pneumoniae se pudo observar los siguientes mecanismos enzimáticos en base a 35 aislamientos; BLEE, 19 aislamientos (54%), seguida de las KPC, 12 aislamientos (34%) y por último, MBL, 4 aislamientos (13%). Conclusión: En las IVU de nuestro estudio, Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae fueron las principales bacterias que originan resistencia a los antibióticos y la BLEE fue la enzima más frecuentemente identificada en ambos sexos.

Introduction: The objective of this study was to assess frequency of enzymatic resistance mechanisms isolated from community urinary tract infections (UTI) determined in vitro in urine cultures. Objectives: This is a retrospective study, a total of 1031 urine samples were included from patients with urinary tract infection who had consulted at the Outpatient Clinic and Emergencies Services. The following information was recorded, age, sex, urine sample. All urine cultures in which pathogens with a count of ≥ 105 CFU / mL were included. Were excluded polymicrobial urine cultures, those without an antibiogram or those with incomplete clinical data. Results: A total of 1031 urine samples met inclusion criteria, 56% of patients were female and 43% male. The mean age of the women was 52 ± 20 years and in men was 62 ± 16 years. 553 (52%) E. coli and 148 (14%) Klebsiella strains were isolated from community samples. Male urine cultures: The main resistance mechanism of Escherichia coli was ESBLs, 55 isolates (91%); followed by MBL, 3 isolates (5%) and KPC, 2 isolates (3%). In Klebsiella pneumoniae (53 isolates); ESBL, 31 isolates (58%); followed by KPC 13 isolates (25%) and MBL, 9 isolates in (16%). Female urine culture: Escherichia coli enzymes 81 isolates, of which ESBLs were 79 isolates (97%); followed by KPC, 1 isolate (1%) and MBL, 1 isolate (1%). In Klebsiella pneumoniae the following enzymatic mechanisms could be observed based on 35 isolates; ESBL, 19 isolates (54%), followed by KPCs, 12 isolates (34%) and finally, MBL, 4 isolates (13%). Conclusion: The result of our study showed high prevalence of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae causing resistance to antibiotics in culture bacteria from urine samples of patients with UTI, and ESBL was the main ß-lactamase resistance mechanism in Klebsiella and E. coli isolates in both male and female.

Resistencia inducible a clindamicina en Staphylococcus aureus resistentes a meticilina aislados de pacientes pediátricos en Paraguay / Inducible resistance to clindamycin in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from Paraguayan children

Resumen Introducción: El método de difusión de doble disco se presenta como una alternativa diagnóstica que permite identificar aislados de Staphylococcus aureus susceptibles a clindamicina, ante el aumento de resistencia a meticilina, reduciendo así la posibilidad de fallo en el tratamiento. Objetivo: Determinar la frecuencia de resistencia a clindamicina inducida por eritromicina en S. aureus resistentes a meticilina (SARM) aislados de niños paraguayos. Materiales y Métodos: Estudio observacional, descriptivo, de corte transversal. Se colectaron 145 aislados S. aureus que causaron infecciones de piel y tejidos blandos y osteo-articulares en pacientes pediátricos del Hospital Central del Instituto de Previsión Social en el período de diciembre-2012 a noviembre-2013. La resistencia a clindamicina se determinó por métodos automatizados y de difusión de doble disco. Se realizó reacción de polimerasa en cadena para genes ermA, ermB, ermC y msrA de aislados representativos. Resultados: La resistencia global a meticilina y clindamicina fue de 67 y 13%, respectivamente (11% atribuible al mecanismo de resistencia a clindamicina inducible). Los genes ermC y msrA fueron detectados individualmente en 25 y 17% de los aislados, respectivamente, mientras que un aislado presentó ambos genes en simultáneo. Discusión: La frecuencia de mecanismo de resistencia inducible a clindamicina señala la importancia de los métodos de difusión de doble disco en la práctica microbiológica, así como se encuentran en los límites de puntos de cortes considerados como aceptables para el uso de este antimicrobiano para infecciones cutáneas y osteo-articulares causadas por SARM.

Background: The double disc diffusion method is an alternative diagnostic that allows the identification of Staphylococcus aureus isolates apparently susceptible to clindamycin but that may develop resistance due to an induction phenomena, mainly asociated to the increase in resistance to methicillin, thus increasing the possibility of failure in the treatment. Aim: To determine the frequency of induced clindamycin resistance in methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolated from Paraguayan children. Materials and Methods: In this cross sectional study, we collected 145 S. aureus isolates that caused skin and soft tissue and osteoarticular infections in pediatric patients of the Central Hospital I.P.S. in the period from December-2012 to November-2013. Resistance to clindamycin was determined by automated methods and double disc diffusion. PCR was performed for ermA, ermB, ermC and msrA genes from representative isolates. Results: The global resistance to methicillin and clindamycin was 67 and 13%, respectively (11% attributable to the inducible mechanism). The ermC and msrA genes were detected individually in 25 and 17% of the isolates respectively while an isolate presented both genes simultaneously. Discussion: The frequency of inducible resistance to clindamycin indicates the importance of double disc diffusion methods in microbiological practice, as well as being within the cut off points considered acceptable for the use of this antibiotic for skin infections. and osteoarticular caused by MRSA.

Caso Venezuela: Reflexiones desde la bioética / Venezuela Case: Reflections from Bioethics / O caso da Venezuela: reflexões da bioética

Resumen: En este artículo se presenta el caso de Venezuela, país que, luego de haber tenido el mayor potencial de desarrollo de Latinoamérica, sufre una debacle política, económica y social que lo ha llevado a convertirse en el más pobre de la región, con la inflación más elevada, y a ser calificado en "emergencia humanitaria compleja". También se describen las graves violaciones a los derechos humanos: civiles, políticos, económicos, sociales, culturales y ambientales que ocurren allí sobre la base de la Declaración Universal sobre Bioética y Derechos Humanos, de la Unesco (2005). Además, se proporciona información sobre el desarrollo y la enseñanza de la bioética en Venezuela. El artículo concluye con el análisis de la situación del país desde otras perspectivas bioéticas enfocadas en Latinoamérica: bioética social y bioética de intervención; las repercusiones del problema en la región y la descripción de los esfuerzos realizados a nivel nacional e internacional para solventar la emergencia humanitaria y recuperar el país.

Abstract: This article presents the case of Venezuela, a country that, after having had the greatest development potential in Latin America, suffers a political, economic and social debacle that led it to become the poorest in the region, with the highest inflation, and to be qualified as a country in a "complex humanitarian emergency". It also describes the serious violations to human rights -civil, political, economic, social, cultural and environmental - that occur there based on the Universal Declaration on Bioethics and Human Rights by Unesco (2005). Additionally, information on the development and teaching of bioethics in Venezuela is provided. The article ends with an analysis of the country situation from other bioethical perspectives focused on Latin-America: social bioethics and intervention bioethics; the repercussions of the problem in the region and the description of the efforts made at national and international level to solve the humanitarian emergency and to recover the country.

Resumo: Este artigo apresenta o caso da Venezuela que, depois de ter o maior potencial de desenvolvimento da América Latina, sofre um desastre político, económico e social que a levou a se tornar o país mais pobre da região, além de apresentar a mais alta taxa de inflação e estar sob "emergência humanitária complexa". Também há relatos de graves violações dos direitos humanos (civil, político, económico, social, cultural e ambiental), com base na Declaração Universal de Bioética e Direitos Humanos, da Unesco (2005). Além disso, algumas informações sobre o desenvolvimento e ensino da bioética na Venezuela são fornecidas. O artigo é concluído com a análise da situação desse país, a partir de outras perspectivas bioéticas que estão enfocadas na América Latina, como a bioética social e a bioética de intervenção, as repercussões do problema na região e a descrição dos esforços realizados, em nível nacional e internacional, para solucionar a emergência humanitária e recuperar esse país.

Estudio preliminar de Infecciones Urinarias Intrahospitalarias en Salas de Clínica Médica de un hospital público de San Lorenzo / Preliminary study of intrahospital urinary tract infections in Internal Medicine rooms from a public Hospital in San Lorenzo

Fundamento y objetivo: Con este estudio preliminar pretendemos determinar las características demográficas y la relación entre determinados factores de riesgo con la presencia de bacterias gram negativas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en infecciones del tracto urinario de pacientes internados (ITU-IH). Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, retrospectivo de corte transversal del tipo casos y controles; de los pacientes adultos de ambos sexos que permanecieron internados en las salas de Clínica Médica del Hospital de Clínicas, de la ciudad de San Lorenzo, de enero del 2015 a agosto del 2017 con urocultivo positivo para bacterias Gram negativas y su relación con diversos factores. Resultados: Escherichia Coli fue aislada en el 43% de las IVU intrahospitalarias, seguida por Klebsiella pneumoniae (32%), Pseudomona aeruginosa (9%), Enterobacter cloacae (4%), Proteus mirabilis (4%), Morganella morganii (2%). En cuanto a los factores de riesgo asociados a ITU-IH debidas a bacterias gram negativas productoras de BLEE, el uso previo de antibiótico (ATB) fue el factor con mayor asociación con OR 2,5 (IC 95% 2,5-21,8) p 0,001. Conclusión: La bacteria Gram negativa implicada con mayor frecuencia en las ITU-IH fue Escherichia coli. El mayor porcentaje de los pacientes que presentó una ITU-IH durante su internación pertenecía al sexo femenino, presentaba algún tipo de comorbilidad; y permaneció hospitalizado por más de 10 días. En cuanto a los factores de riesgo asociados a ITU-IH producidas por bacterias Gram negativas productoras de BLEE, el uso previo de antibiótico fue el factor encontrado con mayor asociación.

Ground and objective: On this preliminary study we aim to determine the demographic features and the relation between certain risk factors and the presence of Gram negative betalactamase producing bacteria (ESBL) in urinary tract infections (UTI) on hospitalized patients. Materials and Methods: An observational, retrospective, cross sectional, case control type study was performed; on adult patients of both genders that were hospitalized in the Internal Medicine wards from Hospital de Clínicas, in the city of San Lorenzo, from January 2015 to August 2017, that had positive urine culture for Gram negative bacteria, and its relationship with diverse factors. Results: Escherichia Coli was isolated on 43% of nosocomial UTI, followed by Klebsiella pneumoniae (32%), Pseudomona aeruginosa (9%), Enterobacter cloacae (4%), Proteus mirabilis (4%), Morganella morganii (2%). As for the risk factors associated to nosocomial UTI produced by Gram negative ESBL-producing bacteria, the prior use of antibiotics was the greatest associated factor with an OR 2,5 (CI 95% 2,5-21,8) p 0,001. Conclusion: The most implicated Gram negative bacteria on nosocomial UTI was Escherichia Coli. The greatest percentage of patients that presented nosocomial UTI during their admission belonged to female sex, presented comorbidities and was hospitalized for a period longer than 10 days. As to the associated risk factors for nosocomial UTI produced by Gram negative ESBL-producing bacteria, the prior use of antibiotics was the greatest associated factor.

Análisis MLVA y perfil de virulencia de aislamientos de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina adquiridos en la comunidad causantes de infecciones pediátricas en Paraguay

Staphylococcus aureus resistente a la meticilina adquirido en la comunidad (SARM-AC) es uno de los principales patógenos causantes de infecciones de piel y partes blandas, aunque también se lo implica en infecciones graves, como osteomielitis y neumonía. El objetivo de este estudio descriptivo fue determinar el tipo de cassette SCCmec, el perfil de virulencia y la variabilidad genética de 21 aislamientos de SARM-AC que infectaron a niños paraguayos en el año 2010. Se determinó por PCR el tipo de cassette SCCmec y los factores de virulencia, en tanto que la variabilidad genética se determinó por la técnica multiple locus variable analysis (MLVA). Todos los aislamientos (100%) presentaron cassette SCCmec IV; algunos portaron factores de virulencia como hla, hlb y sea (el 28,6, el 9,5 y el 4,8%, respectivamente). El análisis MLVA mostró gran variabilidad genética, con datos de antibiotipo y perfil de virulencia congruentes. Este trabajo pone de manifiesto por primera vez en Paraguay la presencia de SARM-AC portador del cassette SCCmec IV con elevada diversidad genética.

Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) is one of the first causes of skin and soft tissue infections, and can also produce severe diseases such as osteomyelitis and pneumonia. The aim of this descriptive study was to determine the SCCmec type and virulence profile and to study the genetic diversity by MLVA analysis of 21 CA-MRSA isolates that infected Paraguayan children in 2010. The SCCmec type and virulence factors were performed by PCR and genetic diversity by MLVA (multiple locus variable analysis). All the isolates carried SCCmec cassette IV. hla, hlb and sea genes were detected in 28,6%, 9,5% and 4,8% respectively. The MLVA analysis showed high genetic diversity with congruent antibiotic resistance and virulence profiles. This study revealed the presence of CA-MRSA harbouring SCCmec IV with high genetic diversity, providing information not available in our country.

Susceptibilidad in vitro a los antibióticos de bacterias productoras de infecciones urinarias en la mujer: evaluación retrospectiva de 5 años / In vitro susceptibility testing to antimicrobial agents of urinary tract infection bacteria in women: a 5-year retrospective study

INTRODUCCIÓN: Las crecientes tasas de resistencia que muestran los patógenos urinarios representan un grave problema. El objetivo de este estudio ha sido realizar un seguimiento de la etiología de las infecciones urinarias, de adquisición comunitaria, de la resistencia a los antimicrobianos de primera línea y la presencia de Betalactamasas de Espectro Extendido en bacilos gram negativos (BLEE). MATERIAL Y MÉTODOS: El estudio fue realizado entre enero de 2011 y diciembre de 2015 con datos del Laboratorio Microbiología del Hospital de Clínicas de la Universidad Nacional de Asunción. RESULTADOS: Se obtuvieron 1957 uropatógenos en mujeres. Escherichia coli fue el gérmen más frecuentemente aislado (57%), seguido de Klebsiella pneumoniae (11%) y Streptococcus agalactiae, Staphylococcus saprophyticus y Proteus mirabilis (2%). El promedio de resistencia de Escherichia coli fue para trimetoprim-sulfametoxazol 43 %, ciprofloxacina 32%, ampicilina-sulbactam 32%, cefotaxima 13%, piperacilina tazobactam 8%, nitrofurantoína 2% y meropenem no presentaba resistencia alguna en este lapso. El 11% de las cepas de Escherichia coli y el 30 % de Klebsiella pneumoniae produjo betalactamasas de espectro extendido. CONCLUSIONES: Las tasas de resistencia y de resistencias cruzadas que se evidencian en este estudio representan un grave problema que obliga a evaluar permanentemente el tratamiento empírico de las infecciones urinarias en nuestro hospital

INTRODUCTION: The growing resistance rates of urinary pathogens represent a serious problem. The aim of this study was to analyze the etiology of community-acquired urinary tract infections, their first-line antimicrobial resistance and the presence of extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) in gram negative bacilli. METHODS: The study was conducted between January 2011 and December 2015 using data from the Microbiology Laboratory at the teaching hospital Hospital de Clínicas, which belongs to the National University of Asunción. RESULTS: A total of 1957 urinary pathogens were found in women. Escherichia coli was the most commonly isolated bacterium (57%), followed by Klebsiella pneumoniae (11%) and Streptococcus agalactiae (2%), Staphylococcus saprophyticus (2%) and Proteus mirabilis (2%). The resistance rates of Escherichia coliwere the following: to trimetoprim-sulfametoxazol, 43%; to ciprofloxacin, 32%; to ampicilin/sulbactam, 32%; to cefotaxime, 13 %; to piperacillin/tazobactam, 8%; nitrofurantoin, 2%, whereas it did not show resistance to meropenem during this period. Extended-spectrum beta-lactamases were produced by 11% of the E. coliisolates and 30% of the Klebsiella pneumoniae isolates. CONCLUSIONS: The resistance and cross-resistance rates found in this study pose a serious problem which compels the continuous assessment of the empirical therapy for urinary tract infections at this hospital

Frecuencia de colonización y sensibilidad de Staphylococcus aureus en un grupo de niños sanos en Asunción

Introducción: La portación nasal de Staphylococcus aureus (SA) en individuos sanos constituye una fuente potencial de infección. La prevalencia de infecciones por SA adquiridas en la comunidad ha aumentado entre los niños sanos. Aunque la epidemiología de la colonización e infección por SA en otros países se ha estudiado ampliamente, los datos son limitados en el Paraguay. Objetivos: Determinar la prevalencia de la portación nasal por SA y su susceptibilidad antimicrobiana en una población de escolares sanos en Asunción, y evaluar factores de riesgo asociados a la colonización. Material y métodos: Estudio multicéntrico, prospectivo, descriptivo y analítico, sobre la colonización nasal por SA en niños de 5 a 16 años, durante el periodo comprendido entre junio y julio del 2016. Previa autorización de los padres y la escuela, se recogieron datos demográficos y factores de riesgo para la colonización. La determinación de SA se realizó mediante muestras de hisopado de las narinas de los niños. Se realizaron pruebas de susceptibilidad antimicrobiana en Agar Mueller y la sensibilidad a la vancomicina se realizó mediante tiras de E-Test®. Los datos fueron registrados en planillas Excel y analizados con el software R v.3.4.2 Resultados: 299 niños fueron incluidos en el estudio. De estos, 58%(173) eran mujeres con una media de edad de 10,6 (±2,5) años. El 79,9% procedía de Asunción y vivía con una media de 5,1 (±1,8) habitantes en el domicilio. Se determinó la presencia de SA en el 30,8% (92/299) de los niños. El 63% de los niños refirió algún factor de riesgo para la colonización por SA. Se objetivo que el antecedente de una enfermedad previa OR=1,92 (95%IC 0,88-4,28), el uso de antibióticos previos OR=1,51 (95%IC 0,89-2,55), la convivencia con mascotas OR=1,42(95%IC 0,81-2,50) y los tratamientos crónicos OR=1,20 (95%IC 0,55-2,61) fueron las variables asociadas a un mayor riesgo de presentar colonización por SA. Conclusión: En el presente estudio se objetivó que el 30,8% de los niños incluidos en el estudio presentaba colonización por SA y que los factores asociados a un mayor riesgo de colonización han sido el antecedente de una enfermedad previa, el uso de antibióticos, la convivencia con mascotas y los tratamientos crónicos.

Introduction: Staphylococcus aureus (SA) nasal carriage in healthy individuals is a potential source of infection. The prevalence of SA infections acquired in the community has increased among healthy children. Although the epidemiology of colonization and infection by SA in other countries has been studied extensively, data are limited in Paraguay. Objectives: To determine the prevalence of nasal carriage by SA and its antimicrobial susceptibility in a population of healthy schoolchildren in Asunción, and to evaluate risk factors associated with colonization. Material and methods: This was a multicenter, prospective, descriptive and analytical study on nasal colonization by SA in children aged 5 to 16 years between June and July 2016. After obtaining authorization from parents and the school, we collected data on demographics and on risk factors for colonization. The SA colonization determination was made by swabbing samples from the children's nostrils. Antimicrobial susceptibility tests were performed on Mueller Agar and the sensitivity to vancomycin was made using E-Test® strips. The data were recorded in Excel spreadsheets and analyzed with the R v.3.4.2 software. Results: 299 children were enrolled in the study. Of these, 58% (173) were female with an average age of 10.6 (± 2.5) years. 79.9% came from Asunción and lived with an average of 5.1 (± 1.8) inhabitants at home. The presence of SA was detected in 30.8% (92/299) of the children. 63% of children reported some risk factor for colonization by SA. We found that a history of a previous disease OR = 1.92 (95% CI 0.88-4.28), the use of previous antibiotics OR = 1.51 (95% CI 0.89-2.55), cohabitation with pets OR = 1.42 (95% CI 0.81-2.50) and chronic treatments OR = 1.20 (95% CI 0.55-2.61) were the variables associated with an increased risk for colonization by SA. Conclusion: In the present study it was found that 30.8% of the children enrolled in the study were colonized by SA and that factors associated with an increased risk of colonization were a history of a previous disease, the use of antibiotics, coexistence with pets and chronic treatments.

Evaluación de la capacidad formadora de biofilm de cepas de S. aureus resistentes a meticilina que infectaron a niños paraguayos

Introducción: La capacidad de S. aureus para adherirse a superficies y a otras células bacterianas, para conformar un biofilm, es una de las principales causas de la persistencia de las infecciones por este patógeno. Objetivo: Analizar la capacidad de formación de biofilm, mediante el ensayo in vitro en placa de poliestireno, de cepas de S. aureus. Material y métodos: Estudio descriptivo de corte trasverso Se estudiaron 10 cepas resistentes a meticilina, con caracterización molecular de factores de virulencia y representativas de los grupos clonales detectados en un total de 347 cepas que causaron infecciones de piel y partes blandas e invasivas en niños en el 2012. La estandarización del ensayo in vitro fue exitosa, permitiendo clasificar a las cepas en 3 categorías según la intensidad de formación del biofilm. Resultados: El 100% de las cepas analizadas fue formadora de biofilm y se identificó dentro de la categoría de formadores moderados. Conclusiones: La detección de la formación de biofilms bacterianos, sobre todo en infecciones crónicas, es un tema crucial, ya que de ello depende la elección de estrategias especiales para su eliminación, como la remoción quirúrgica, dada la inefectividad de las terapias antibióticas tradicionales.

Introduction: The capacity of S. aureus to adhere to surfaces and other bacterial cells by forming a biofilm is one of the main causes of the persistence of infections by this pathogen. Objective: To analyze the capacity of S. aureus strains to form biofilm, using in vitro polystyrene plate culture techniques. Materials and methods: This was a descriptive, cross-sectional study. We studied and performed molecular characterization of viruence factors in ten strains of S. aureus, which were representative of the clonal groups detected in a total of 347 strains that caused skin and soft tissue invasive infections in children in 2012. The standardization of the in vitro assay was successful, allowing to classify the strains into 3 categories according to the intensity of biofilm formation. Results: 100% of the analyzed strains were biofilm formers and were categorized as moderate formers. Conclusions: The detection of the formation of bacterial biofilms, especially in chronic infections, is crucial, since it affects the choice of special strategies, such as surgical removal, for their elimination, given the ineffectiveness of traditional antibiotic therapies.

Detección molecular de belactamasas de espectro extendido (BLEE) en enterobacterias aisladas en Asunción / Molecular detection of extended spectrum beta-lactamase (esbl) in enterobacteria isolated in Asunción

Las betalactamasas de espectro extendido (BLEE), son enzimas responsables de la hidrólisis del anillo betalactámico de penicilinas y cefalosporinas, excepto carbapemenes, inhibiendo así su actividad terapéutica. Si bien es posible la detección fenotípica de este mecanismo de resistencia por métodos convencionales, sólo los métodos moleculares permiten la identificación del gen responsable de dicha resistencia. El objetivo de este estudio descriptivo retrospectivo fue identificar los genes blaCTX-M2, blaPER-2, blaSHV y blaTEM, en aislamientos de enterobacterias productoras de BLEE,; de muestras clínicas colectadas entre julio 2007 y abril 2008, provenientes de dos hospitales de referencia de Asunción, Paraguay. La detección molecular de los genes se realizó por reacción en cadena de la polimerasa empleando oligonucleótidos específicos. De los 232 aislados BLEE analizados, el 83% (n=192) portó al menos un gen bla, en el 17% (n=40) restante no fue detectado ninguno de los genes incluido en el estudio. Se observaron las siguientes frecuencias: 49% (94/192) blaCTX-M2, 45% (86/192) blaSHV, 40% (77/192) blaTEM y 7% (13/192) blaPER-2. En el 47% (90/192) se detectó más de un gen, siendo la combinación blaCTX-M2+blaTEM+blaSHV, la más frecuente observada en 32 aislados. El blaCTX-M2 como el gen más frecuente en este estudio; concuerda con lo reportado en nuestro país y en Argentina. Este es el primer reporte de la presencia de blaTEM y blaSHV en Paraguay. Es de gran importancia el estudio de otros genes codificantes de resistencia, considerando la emergencia de otras BLEE en la región como blaCTX-M15 con actividad predominantemente ceftazidimasa.

Extended spectrum beta-lactamases (ESBLs), are enzymes responsible for thehydrolysis of the beta-lactam ring and resistance to both cephalosporins and penicillins,except carbapenems, therefore inhibiting its therapeutics activity. Even though, detectionof the phenotypic resistance mechanism by conventional methods is possible, onlymolecular methods allow identification of the gene responsible for the resistance. Theobjective of this retrospective study was to identify the blaCTX-M2, blaPER-2, blaSHV, blaTEMgenes in ESBL-producing enterobacteriaceae isolates, recovered from clinical samples collected between July 2007 and April 2008, from two reference hospitals in Asunción,Paraguay. Molecular gene detection was performed by polymerase chain reaction usingspecifics oligonucleotides. Out of the tested 232 ESBL-producing isolates, 83% (n=192)carried at least one of the bla genes as follows; 49% (94/192) blaCTX-M2, 45% (86/192)blaSHV, 40% (77/192) blaTEM and 7% (13/192) blaPER-2. In the rest 17% (n=40) none of thegenes included in this study was detected; in 47% (90/192) more than one gene wasdetected, resulting blaCTX-M2 + blaTEM + blaSHV as the most frequent combination in 32isolates. The presence of blaCTX-M2, as the most frequent codifying genes of BLEE is inagreement with previous reports in Paraguay and Argentina. This is the first report of thepresence of blaTEM and blaSHV circulating in Paraguay. It is of much importance the study ofothers codifying resistance genes, taking into account the emergence of other BLEE in theregion, such as blaCTX-M15, predominantly with ceftazidimase activity.

Staphylococcus aureus adquiridos en la comunidad: caracterización clínica, fenotípica y genotípica de aislados en niños paraguayos / Community-acquired Staphylococcus aureus isolated from Paraguayan children: clinical, phenotypic and genotypic characterization

Introduction: The prevalence of Staphylococcus aureus in the community has increased, being the pediatric population the most affected. This fact highlights the need for epidemiological surveillance. Aim: To characterize clinical, phenotypic and genotypic isolates of S. aureus children’s samples with community-acquired infections, collected in hospitals of Asuncion and the Central Department, between November 2009 and December 2010. Materials and Methods: Descriptive and transverse analysis with analytical component. Clinical data collected by medical records, antibiotic susceptibility according to CLSI criteria and detection of mecA (encoding methicillin resistance) and luk-PV genes (encoding Panton Valentine leucocidin) by PCR using specific oligonucleotides. Results: 123 isolates of S. aureus, 76% came from skin and soft tissue infections and 20% from sepsis. 18.7% (n = 23) were resistant to methicillin (MRSA). The presence of the mecA gene, a variant there and the PVL was detected in 12.2 and 48 isolates respectively. 43% of MRSA (n = 10) was carrying luk-PV. The clinical and demographic differences between patients infected with MRSA or MSSA were not statistically significant. Discussion: This study constitutes the first phenotypic and genotypic characterization of S. aureus associated with pediatric patients in Paraguay.

Introducción: La prevalencia de infecciones por Staphylococcus aureus en la comunidad ha aumentado, siendo la población pediátrica la más afectada; poniendo de relieve la necesidad de una vigilancia epidemiológica. Objetivo: Caracterizar clínica, fenotípica y genotípicamente aislados de S. aureus de muestras de niños con infecciones adquiridas en la comunidad, recolectadas en hospitales de Asunción y el Departamento Central, entre noviembre de 2009 y diciembre de 2010. Materiales y Métodos: Estudio descriptivo de corte trasverso. Datos clínicos fueron recabados de fichas, la susceptibilidad a antimicrobianos se hizo según criterio del CLSI y la detección de genes mecA y luk-PV se realizó por RPC empleando oligonucleótidos específicos. Resultados: De 123 aislados de S. aureus, 76% provenían de infecciones de piel y tejidos blandos y 20% de pacientes con bacteriemias. 18,7% (n: 23) fueron resistentes a meticilina (SARM). Se detectó la presencia de genes mecA, una variante del mismo y luk-PV en 9,8%, 1,6 y 39% de los aislados, respectivamente. El 43% de los SARM (n: 10) fue portador de luk-PV. Las diferencias clínicas y demográficas entre pacientes infectados por SARM o SASM no fueron estadísticamente significativas. Discusión: Este estudio constituye la primera caracterización clínica, fenotípica y genotípica de S. aureus asociados a la comunidad en población pediátrica realizada en Paraguay.