SHAPE Selection (SHAPES) enrich for RNA structure signal in SHAPE sequencing-based probing data.

Poulsen, Line Dahl; Kielpinski, Lukasz Jan; Salama, Sofie R; Krogh, Anders; Vinther, Jeppe

Poulsen, Line Dahl; Kielpinski, Lukasz Jan; Salama, Sofie R; Krogh, Anders; Vinther, Jeppe.

Afiliación

Poulsen LD; Department of Biology, University of Copenhagen, DK-2200 Copenhagen N, Denmark.
Kielpinski LJ; Department of Biology, University of Copenhagen, DK-2200 Copenhagen N, Denmark.
Salama SR; Center for Biomolecular Science and Engineering, and Howard Hughes Medical Institute, University of California Santa Cruz, Santa Cruz, California 95064, USA.
Krogh A; Department of Biology, University of Copenhagen, DK-2200 Copenhagen N, Denmark.
Vinther J; Department of Biology, University of Copenhagen, DK-2200 Copenhagen N, Denmark.

RNA ; 21(5): 1042-52, 2015 May.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-25805860

Asunto(s)

Radical Hidroxilo/química; Conformación de Ácido Nucleico; Sondas ARN/química; ARN/química; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Acilación; Bacillus subtilis/genética; Biotina/química; Escherichia coli/genética; Radical Hidroxilo/metabolismo; ARN/análisis; Caperuzas de ARN/química; ARN Bacteriano/química; ARN Ribosómico 16S/química; Ribonucleasa P/genética; Sitio de Iniciación de la Transcripción

Palabras clave

NPIA; RNA structure; SHAPE; Selection; sequencing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: ARN / Sondas ARN / Análisis de Secuencia de ARN / Radical Hidroxilo / Conformación de Ácido Nucleico Idioma: En Revista: RNA Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2015 Tipo del documento: Article País de afiliación: Dinamarca

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