Modeling tissue-relevant Caenorhabditis elegans metabolism at network, pathway, reaction, and metabolite levels.

Yilmaz, Lutfu Safak; Li, Xuhang; Nanda, Shivani; Fox, Bennett; Schroeder, Frank; Walhout, Albertha Jm

Yilmaz, Lutfu Safak; Li, Xuhang; Nanda, Shivani; Fox, Bennett; Schroeder, Frank; Walhout, Albertha Jm.

Afiliación

Yilmaz LS; Program in Systems Biology, Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA, USA.
Li X; Program in Systems Biology, Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA, USA.
Nanda S; Program in Systems Biology, Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA, USA.
Fox B; Boyce Thompson Institute, Department of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA.
Schroeder F; Boyce Thompson Institute, Department of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA.
Walhout AJ; Program in Systems Biology, Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA, USA.

Mol Syst Biol ; 16(10): e9649, 2020 10.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33022146

Asunto(s)

Proteínas de Caenorhabditis elegans/metabolismo; Caenorhabditis elegans/metabolismo; Regulación de la Expresión Génica/genética; Transcriptoma/genética; Algoritmos; Animales; Caenorhabditis elegans/genética; Proteínas de Caenorhabditis elegans/genética; Biología Computacional; Simulación por Computador; Redes Reguladoras de Genes; Gónadas/metabolismo; Mucosa Intestinal/metabolismo; Redes y Vías Metabólicas; Neuroglía/metabolismo; Especificidad de Órganos/genética; Especificidad de Órganos/fisiología; RNA-Seq; Análisis de la Célula Individual; Tejido Subcutáneo/metabolismo

Palabras clave

Caenorhabditis elegans; data integration; metabolic network; single-cell RNA-seq; tissue metabolism

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Regulación de la Expresión Génica / Caenorhabditis elegans / Proteínas de Caenorhabditis elegans / Transcriptoma Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Mol Syst Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOTECNOLOGIA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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