A biology-driven deep generative model for cell-type annotation in cytometry.

Blampey, Quentin; Bercovici, Nadège; Dutertre, Charles-Antoine; Pic, Isabelle; Ribeiro, Joana Mourato; André, Fabrice; Cournède, Paul-Henry

Blampey, Quentin; Bercovici, Nadège; Dutertre, Charles-Antoine; Pic, Isabelle; Ribeiro, Joana Mourato; André, Fabrice; Cournède, Paul-Henry.

Afiliación

Blampey Q; Université Paris-Saclay, CentraleSupélec, Laboratory of Mathematics and Computer Science (MICS), 3 rue Joliot Curie, 91190,Gif-sur-Yvette, France.
Bercovici N; Université Paris-Saclay, Gustave Roussy, Inserm U981, 114 Rue Edouard Vaillant, 94805, Villejuif, France.
Dutertre CA; Université Paris Cité, Institut Cochin, CNRS, Inserm, 22 Rue Méchain, 75014, Paris, France.
Pic I; Université Paris-Saclay, Gustave Roussy, Inserm U1015, 114 Rue Edouard Vaillant, 94805, Villejuif, France.
Ribeiro JM; Université Paris-Saclay, Gustave Roussy, Inserm U981, 114 Rue Edouard Vaillant, 94805, Villejuif, France.
André F; Université Paris-Saclay, Gustave Roussy, Inserm U981, 114 Rue Edouard Vaillant, 94805, Villejuif, France.
Cournède PH; Gustave Roussy, Département de Médecine Oncologique, 114 Rue Edouard Vaillant, 94805, Villejuif, France.

Brief Bioinform ; 24(5)2023 09 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37497716

Asunto(s)

Biología; Reproducibilidad de los Resultados; Citometría de Flujo/métodos

Palabras clave

Batch-effect correction; Cell-type annotation; Cytometry; Deep Learning; Normalizing Flows

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Biología Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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