Detalles de la búsqueda
1.
PRAWNS: compact pan-genomic features for whole-genome population genomics.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36579850
2.
Listeria monocytogenes Illness and Deaths Associated With Ongoing Contamination of a Multiregional Brand of Ice Cream Products, United States, 2010-2015.
Clin Infect Dis
; 76(1): 89-95, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35797187
3.
Toward the Adoption of Loop-Mediated Isothermal Amplification for Salmonella Screening at the National Antimicrobial Resistance Monitoring System's Retail Meat Sites.
Foodborne Pathog Dis
; 19(11): 758-766, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36367550
4.
Evaluating the accuracy of Listeria monocytogenes assemblies from quasimetagenomic samples using long and short reads.
BMC Genomics
; 22(1): 389, 2021 May 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34039264
5.
GalaxyTrakr: a distributed analysis tool for public health whole genome sequence data accessible to non-bioinformaticians.
BMC Genomics
; 22(1): 114, 2021 Feb 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33568057
6.
Phylogenetic and Biogeographic Patterns of Vibrio parahaemolyticus Strains from North America Inferred from Whole-Genome Sequence Data.
Appl Environ Microbiol
; 87(3)2021 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33187991
7.
Using full chloroplast genomes of 'red' and 'yellow' Bixa orellana (achiote) for kmer based identification and phylogenetic inference.
BMC Genomics
; 21(1): 544, 2020 Aug 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32762642
8.
Genomic diversity of Salmonella enterica isolated from papaya samples collected during multiple outbreaks in 2017.
Microbiology (Reading)
; 166(5): 453-459, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32100709
9.
Quasimetagenomic source tracking of Listeria monocytogenes from naturally contaminated ice cream.
BMC Infect Dis
; 20(1): 83, 2020 Jan 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31996135
10.
Short communication: Multistate outbreak of Listeria monocytogenes infections retrospectively linked to unpasteurized milk using whole-genome sequencing.
J Dairy Sci
; 103(1): 176-178, 2020 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31733864
11.
Phylogenomic Pipeline Validation for Foodborne Pathogen Disease Surveillance.
J Clin Microbiol
; 57(5)2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30728194
12.
Metagenome tracking biogeographic agroecology: Phytobiota of tomatoes from Virginia, Maryland, North Carolina and California.
Food Microbiol
; 79: 132-136, 2019 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30621868
13.
TreeToReads - a pipeline for simulating raw reads from phylogenies.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 178, 2017 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28320310
14.
Singleton Sequence Type 382, an Emerging Clonal Group of Listeria monocytogenes Associated with Three Multistate Outbreaks Linked to Contaminated Stone Fruit, Caramel Apples, and Leafy Green Salad.
J Clin Microbiol
; 55(3): 931-941, 2017 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28053218
15.
Whole Genome and Core Genome Multilocus Sequence Typing and Single Nucleotide Polymorphism Analyses of Listeria monocytogenes Isolates Associated with an Outbreak Linked to Cheese, United States, 2013.
Appl Environ Microbiol
; 83(15)2017 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28550058
16.
Tracing Origins of the Salmonella Bareilly Strain Causing a Food-borne Outbreak in the United States.
J Infect Dis
; 213(4): 502-8, 2016 Feb 15.
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| MEDLINE | ID: mdl-25995194
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Implementation of Nationwide Real-time Whole-genome Sequencing to Enhance Listeriosis Outbreak Detection and Investigation.
Clin Infect Dis
; 63(3): 380-6, 2016 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27090985
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Infectious Dose of Listeria monocytogenes in Outbreak Linked to Ice Cream, United States, 2015.
Emerg Infect Dis
; 22(12): 2113-2119, 2016 12.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27869595
19.
Practical Value of Food Pathogen Traceability through Building a Whole-Genome Sequencing Network and Database.
J Clin Microbiol
; 54(8): 1975-83, 2016 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27008877
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Core Genome Multilocus Sequence Typing for Identification of Globally Distributed Clonal Groups and Differentiation of Outbreak Strains of Listeria monocytogenes.
Appl Environ Microbiol
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Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27520821