QM/MM studies on the calcium-assisted ß-elimination mechanism of pectate lyase from bacillus subtilis.

Ma, Guangcai; Zhu, Wenyou; Liu, Yongjun

Ma, Guangcai; Zhu, Wenyou; Liu, Yongjun.

Afiliación

Ma G; Key Laboratory of Colloid and Interface Chemistry, Ministry of Education, School of Chemistry and Chemical Engineering, Shandong University, Shandong, Jinan, 250100, China.
Zhu W; Key Laboratory of Colloid and Interface Chemistry, Ministry of Education, School of Chemistry and Chemical Engineering, Shandong University, Shandong, Jinan, 250100, China.
Liu Y; College of Chemistry and Chemical Engineering, Xuzhou Institute of Technology, Xuzhou, Jiangsu, 221111, China.

Proteins ; 84(11): 1606-1615, 2016 11.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27447541

Asunto(s)

Bacillus subtilis/química; Proteínas Bacterianas/química; Calcio/química; Pectinas/química; Polisacárido Liasas/química; Protones; Arginina/química; Arginina/metabolismo; Bacillus subtilis/enzimología; Proteínas Bacterianas/genética; Proteínas Bacterianas/metabolismo; Calcio/metabolismo; Dominio Catalítico; Disacáridos/química; Disacáridos/metabolismo; Expresión Génica; Enlace de Hidrógeno; Hidrólisis; Lisina/química; Lisina/metabolismo; Modelos Moleculares; Simulación de Dinámica Molecular; Pectinas/metabolismo; Polisacárido Liasas/genética; Polisacárido Liasas/metabolismo; Dominios Proteicos; Estructura Secundaria de Proteína; Teoría Cuántica; Electricidad Estática; Azúcares Ácidos/química; Azúcares Ácidos/metabolismo

Palabras clave

4,5-unsaturated digalacturonate; polysaccharide lyase; reaction mechanism; theoretical study; α-1,4-glycosidic bond

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Polisacárido Liasas / Protones / Bacillus subtilis / Proteínas Bacterianas / Calcio / Pectinas Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Proteins Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: China

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