All-atom simulations disentangle the functional dynamics underlying gene maturation in the intron lariat spliceosome.

Casalino, Lorenzo; Palermo, Giulia; Spinello, Angelo; Rothlisberger, Ursula; Magistrato, Alessandra

Casalino, Lorenzo; Palermo, Giulia; Spinello, Angelo; Rothlisberger, Ursula; Magistrato, Alessandra.

Afiliación

Casalino L; Molecular and Statistical Biophysics, International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy.
Palermo G; Department of Bioengineering, University of California, Riverside, CA 92507.
Spinello A; Consiglio Nazionale delle Ricerche-Istituto Officina dei Materiali-Democritos National Simulation Center c/o International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy.
Rothlisberger U; Laboratory of Computational Chemistry and Biochemistry, École Polytechnique Fédérale de Lausanne, CH-1015 Lausanne, Switzerland.
Magistrato A; Consiglio Nazionale delle Ricerche-Istituto Officina dei Materiali-Democritos National Simulation Center c/o International School for Advanced Studies (SISSA), 34136 Trieste, Italy; alessandra.magistrato@sissa.it.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 115(26): 6584-6589, 2018 06 26.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29891649

Asunto(s)

Simulación por Computador; Intrones/genética; Modelos Genéticos; Conformación de Ácido Nucleico; Precursores del ARN/metabolismo; Empalme del ARN/fisiología; Proteínas Represoras/fisiología; Ribonucleoproteína Nuclear Pequeña U5/fisiología; Proteínas de Schizosaccharomyces pombe/fisiología; Empalmosomas/fisiología; Magnesio/fisiología; Modelos Moleculares; Simulación de Dinámica Molecular; Movimiento (Física); Análisis de Componente Principal; Conformación Proteica; Precursores del ARN/genética; ARN de Hongos/genética; ARN de Hongos/metabolismo; ARN Nuclear Pequeño/genética; ARN Nuclear Pequeño/metabolismo; Proteínas Represoras/química; Ribonucleoproteína Nuclear Pequeña U5/química; Schizosaccharomyces/genética; Schizosaccharomyces/metabolismo; Proteínas de Schizosaccharomyces pombe/química; Electricidad Estática

Palabras clave

RNA; gene maturation; molecular dynamics; spliceosome; splicing

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Represoras / Simulación por Computador / Precursores del ARN / Intrones / Empalme del ARN / Empalmosomas / Ribonucleoproteína Nuclear Pequeña U5 / Proteínas de Schizosaccharomyces pombe / Modelos Genéticos / Conformación de Ácido Nucleico Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Proc Natl Acad Sci U S A Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Italia

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