A pan-cancer analysis of CpG Island gene regulation reveals extensive plasticity within Polycomb target genes.

Zheng, Yueyuan; Huang, Guowei; Silva, Tiago C; Yang, Qian; Jiang, Yan-Yi; Koeffler, H Phillip; Lin, De-Chen; Berman, Benjamin P

Zheng, Yueyuan; Huang, Guowei; Silva, Tiago C; Yang, Qian; Jiang, Yan-Yi; Koeffler, H Phillip; Lin, De-Chen; Berman, Benjamin P.

Afiliación

Zheng Y; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Huang G; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Silva TC; Department of Pathology, Shantou University Medical College, Shantou, Guangdong, People's Republic of China.
Yang Q; Center for Bioinformatics and Functional Genomics, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Jiang YY; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Koeffler HP; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Lin DC; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA.
Berman BP; Department of Medicine, Samuel Oschin Comprehensive Cancer Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA. dchlin11@gmail.com.

Nat Commun ; 12(1): 2485, 2021 04 30.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33931649

Asunto(s)

Cromatina/metabolismo; Islas de CpG; Regulación Neoplásica de la Expresión Génica/genética; Neoplasias/metabolismo; Proteínas del Grupo Polycomb/metabolismo; Transducción de Señal/genética; Sitios de Unión; Línea Celular Tumoral; Cromatina/genética; Secuenciación de Inmunoprecipitación de Cromatina; Metilación de ADN; Proteínas de Unión al ADN/metabolismo; Bases de Datos Genéticas; Regulación hacia Abajo; Células Madre Embrionarias/metabolismo; Elementos de Facilitación Genéticos; Perfilación de la Expresión Génica; Factor Nuclear 4 del Hepatocito/genética; Factor Nuclear 4 del Hepatocito/metabolismo; Histonas/metabolismo; Humanos; Familia de Multigenes; Neoplasias/genética; Proteínas del Grupo Polycomb/genética; Análisis de Componente Principal; Regiones Promotoras Genéticas; Unión Proteica; Regulación hacia Arriba

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Cromatina / Transducción de Señal / Regulación Neoplásica de la Expresión Génica / Islas de CpG / Proteínas del Grupo Polycomb / Neoplasias Límite: Humans Idioma: En Revista: Nat Commun Asunto de la revista: BIOLOGIA / CIENCIA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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