Detalles de la búsqueda
1.
OpenFold: retraining AlphaFold2 yields new insights into its learning mechanisms and capacity for generalization.
Nat Methods;
2024 May 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38744917
2.
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging.
bioRxiv;
2024 Apr 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38712088
3.
PMF-GRN: a variational inference approach to single-cell gene regulatory network inference using probabilistic matrix factorization.
Genome Biol;
25(1): 88, 2024 Apr 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38589899
4.
Correction to "Computational Prediction of Coiled-Coil Protein Gelation Dynamics and Structure".
Biomacromolecules;
25(5): 3214, 2024 May 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38630987
5.
Computational Design of Phosphotriesterase Improves V-Agent Degradation Efficiency.
ChemistryOpen;
: e202300263, 2024 Mar 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38426687
6.
Meta-analysis of the human gut microbiome uncovers shared and distinct microbial signatures between diseases.
bioRxiv;
2024 Feb 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38464323
7.
Analytical challenges in omics research on asthma and allergy: A National Institute of Allergy and Infectious Diseases workshop.
J Allergy Clin Immunol;
153(4): 954-968, 2024 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38295882
8.
Structure-primed embedding on the transcription factor manifold enables transparent model architectures for gene regulatory network and latent activity inference.
Genome Biol;
25(1): 24, 2024 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38238840
9.
Computational Prediction of Coiled-Coil Protein Gelation Dynamics and Structure.
Biomacromolecules;
25(1): 258-271, 2024 01 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38110299
10.
Learning sequence, structure, and function representations of proteins with language models.
bioRxiv;
2023 Nov 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38045331
11.
Protein-Engineered Fibers For Drug Encapsulation Traceable via 19F Magnetic Resonance.
ACS Appl Nano Mater;
6(22): 21245-21257, 2023 Nov 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38037605
12.
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression.
bioRxiv;
2023 Sep 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37790443
13.
Protein remote homology detection and structural alignment using deep learning.
Nat Biotechnol;
2023 Sep 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37679542
14.
OpenProteinSet: Training data for structural biology at scale.
ArXiv;
2023 Aug 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37608940
15.
CRISPR arrays as high-resolution markers to track microbial transmission during influenza infection.
Microbiome;
11(1): 136, 2023 06 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37330554
16.
Multi-level analysis of the gut-brain axis shows autism spectrum disorder-associated molecular and microbial profiles.
Nat Neurosci;
26(7): 1208-1217, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37365313
17.
Comprehensive Functional Annotation of Metagenomes and Microbial Genomes Using a Deep Learning-Based Method.
mSystems;
8(2): e0117822, 2023 04 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37010293
18.
Sequence-structure-function relationships in the microbial protein universe.
Nat Commun;
14(1): 2351, 2023 04 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37100781
19.
Specificities of Modeling of Membrane Proteins Using Multi-Template Homology Modeling.
Methods Mol Biol;
2627: 141-166, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36959446
20.
Structure primed embedding on the transcription factor manifold enables transparent model architectures for gene regulatory network and latent activity inference.
bioRxiv;
2023 Feb 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36778259