Detalles de la búsqueda
1.
Putative genome contamination has minimal impact on the GTDB taxonomy.
Microb Genom;
10(5)2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38809778
2.
AnnoView enables large-scale analysis, comparison, and visualization of microbial gene neighborhoods.
Brief Bioinform;
25(3)2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38747283
3.
Author Correction: CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome quality using machine learning.
Nat Methods;
21(4): 735, 2024 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38514780
4.
Author Correction: Greengenes2 unifies microbial data in a single reference tree.
Nat Biotechnol;
2023 Oct 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37853258
5.
Proposal of names for 329 higher rank taxa defined in the Genome Taxonomy Database under two prokaryotic codes.
FEMS Microbiol Lett;
3702023 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37480240
6.
CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome quality using machine learning.
Nat Methods;
20(8): 1203-1212, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37500759
7.
Greengenes2 unifies microbial data in a single reference tree.
Nat Biotechnol;
2023 Jul 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37500913
8.
GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database.
Bioinformatics;
38(23): 5315-5316, 2022 11 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36218463
9.
Development of the SeqCode: A proposed nomenclatural code for uncultivated prokaryotes with DNA sequences as type.
Syst Appl Microbiol;
45(5): 126305, 2022 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36049255
10.
SeqCode: a nomenclatural code for prokaryotes described from sequence data.
Nat Microbiol;
7(10): 1702-1708, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36123442
11.
Chemotaxis may assist marine heterotrophic bacterial diazotrophs to find microzones suitable for N2 fixation in the pelagic ocean.
ISME J;
16(11): 2525-2534, 2022 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35915168
12.
Chemotaxis shapes the microscale organization of the ocean's microbiome.
Nature;
605(7908): 132-138, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35444277
13.
GTDB: an ongoing census of bacterial and archaeal diversity through a phylogenetically consistent, rank normalized and complete genome-based taxonomy.
Nucleic Acids Res;
50(D1): D785-D794, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34520557
14.
Successional dynamics and alternative stable states in a saline activated sludge microbial community over 9 years.
Microbiome;
9(1): 199, 2021 10 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34615557
15.
Diverse sediment microbiota shape methane emission temperature sensitivity in Arctic lakes.
Nat Commun;
12(1): 5815, 2021 10 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34611153
16.
A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database.
Nat Microbiol;
6(7): 946-959, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34155373
17.
Evaluation of the Microba Community Profiler for Taxonomic Profiling of Metagenomic Datasets From the Human Gut Microbiome.
Front Microbiol;
12: 643682, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33959106
18.
Prokaryotic taxonomy and nomenclature in the age of big sequence data.
ISME J;
15(7): 1879-1892, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33824426
19.
Critical evaluation of faecal microbiome preservation using metagenomic analysis.
ISME Commun;
1(1): 14, 2021 May 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37938632
20.
A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.
Nat Biotechnol;
39(1): 105-114, 2021 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32690973