Detalles de la búsqueda
1.
Parsnp 2.0: scalable core-genome alignment for massive microbial datasets.
Bioinformatics;
40(5)2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38724243
2.
Crykey: Rapid identification of SARS-CoV-2 cryptic mutations in wastewater.
Nat Commun;
15(1): 4545, 2024 May 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38806450
3.
Probiotic treatment causes sex-specific neuroprotection after traumatic brain injury in mice.
Res Sq;
2024 Apr 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38645104
4.
PreK-12 school and citywide wastewater monitoring of the enteric viruses astrovirus, rotavirus, and sapovirus.
Sci Total Environ;
931: 172683, 2024 Jun 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38663617
5.
Unveiling microbial diversity: harnessing long-read sequencing technology.
Nat Methods;
21(6): 954-966, 2024 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38689099
6.
Sensitivity and consistency of long- and short-read metagenomics and epicPCR for the detection of antibiotic resistance genes and their bacterial hosts in wastewater.
J Hazard Mater;
469: 133939, 2024 May 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38490149
7.
Microbial Community Profiling Protocol with Full-length 16S rRNA Sequences and Emu.
Curr Protoc;
4(3): e978, 2024 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38511467
8.
Parsnp 2.0: Scalable Core-Genome Alignment for Massive Microbial Datasets.
bioRxiv;
2024 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38352342
9.
Reference-free Structural Variant Detection in Microbiomes via Long-read Coassembly Graphs.
bioRxiv;
2024 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38352454
10.
Identification of a novel CG307 sub-clade in third-generation-cephalosporin-resistant Klebsiella pneumoniae causing invasive infections in the USA.
Microb Genom;
10(2)2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38407244
11.
The pan-microbiome profiling system Taxa4Meta identifies clinical dysbiotic features and classifies diarrheal disease.
J Clin Invest;
134(2)2024 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37962956
12.
KombOver: Efficient k-core and K-truss based characterization of perturbations within the human gut microbiome.
Pac Symp Biocomput;
29: 506-520, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38160303
13.
Crykey: Rapid Identification of SARS-CoV-2 Cryptic Mutations in Wastewater.
medRxiv;
2023 Nov 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37986916
14.
Evolutionary and spatiotemporal analyses reveal multiple introductions and cryptic transmission of SARS-CoV-2 VOC/VOI in Malta.
Microbiol Spectr;
11(6): e0153923, 2023 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37800925
15.
The long game of tenure.
Nat Biotechnol;
41(10): 1373-1374, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37626231
16.
Minmers are a generalization of minimizers that enable unbiased local Jaccard estimation.
Bioinformatics;
39(9)2023 09 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37603771
17.
Bakdrive: identifying a minimum set of bacterial species driving interactions across multiple microbial communities.
Bioinformatics;
39(39 Suppl 1): i47-i56, 2023 06 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37387148
18.
Minmers are a generalization of minimizers that enable unbiased local Jaccard estimation.
bioRxiv;
2023 May 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37325780
19.
Enabling accurate and early detection of recently emerged SARS-CoV-2 variants of concern in wastewater.
Nat Commun;
14(1): 2834, 2023 05 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37198181
20.
Improved understanding of biorisk for research involving microbial modification using annotated sequences of concern.
Front Bioeng Biotechnol;
11: 1124100, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37180048