Detalles de la búsqueda
1.
Hi-GeoMVP: a hierarchical geometry-enhanced deep learning model for drug response prediction.
Bioinformatics;
40(4)2024 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38614131
2.
The k-Robinson-Foulds Dissimilarity Measures for Comparison of Labeled Trees.
J Comput Biol;
31(4): 328-344, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38271573
3.
Computing the Bounds of the Number of Reticulations in a Tree-Child Network That Displays a Set of Trees.
J Comput Biol;
31(4): 345-359, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38285528
4.
A fast and scalable method for inferring phylogenetic networks from trees by aligning lineage taxon strings.
Genome Res;
33(7): 1053-1060, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217252
5.
Two results about the Sackin and Colless indices for phylogenetic trees and their shapes.
J Math Biol;
85(6-7): 69, 2022 11 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36418585
6.
Detecting molecular subtypes from multi-omics datasets using SUMO.
Cell Rep Methods;
2(1)2022 01 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35211690
7.
How much can deep learning improve prediction of the responses to drugs in cancer cell lines?
Brief Bioinform;
23(1)2022 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34529029
8.
Introduction to the Special Issue of the 18th Annual International RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics.
J Bioinform Comput Biol;
19(6): 2102003, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34895112
9.
The Bourque distances for mutation trees of cancers.
Algorithms Mol Biol;
16(1): 9, 2021 Jun 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34112201
10.
A survey and systematic assessment of computational methods for drug response prediction.
Brief Bioinform;
22(1): 232-246, 2021 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31927568
11.
Stage-specific protein-domain mutational profile of invasive ductal breast cancer.
BMC Med Genomics;
13(Suppl 10): 150, 2020 10 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33087126
12.
Evidence for transmission of COVID-19 prior to symptom onset.
Elife;
92020 06 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32568070
13.
Generating normal networks via leaf insertion and nearest neighbor interchange.
BMC Bioinformatics;
20(Suppl 20): 642, 2019 Dec 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31842746
14.
Compression of Phylogenetic Networks and Algorithm for the Tree Containment Problem.
J Comput Biol;
26(3): 285-294, 2019 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30624954
15.
ZDOG: zooming in on dominating genes with mutations in cancer pathways.
BMC Bioinformatics;
20(1): 740, 2019 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31888434
16.
S-Cluster++: a fast program for solving the cluster containment problem for phylogenetic networks.
Bioinformatics;
34(17): i680-i686, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30423060
17.
RecPhyloXML: a format for reconciled gene trees.
Bioinformatics;
34(21): 3646-3652, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29762653
18.
Improved anticancer drug response prediction in cell lines using matrix factorization with similarity regularization.
BMC Cancer;
17(1): 513, 2017 Aug 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28768489
19.
A program to compute the soft Robinson-Foulds distance between phylogenetic networks.
BMC Genomics;
18(Suppl 2): 111, 2017 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361712
20.
A program for verification of phylogenetic network models.
Bioinformatics;
32(17): i503-i510, 2016 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27587668