Calculation of Relative Binding Free Energy in the Water-Filled Active Site of Oligopeptide-Binding Protein A.

Maurer, Manuela; de Beer, Stephanie B A; Oostenbrink, Chris

Maurer, Manuela; de Beer, Stephanie B A; Oostenbrink, Chris.

Afiliación

Maurer M; Institute of Molecular Modeling and Simulation, University of Natural Resources and Life Sciences, Muthgasse 18, A-1190 Vienna, Austria. manuela.maurer@boku.ac.at.
de Beer SB; Institute of Molecular Modeling and Simulation, University of Natural Resources and Life Sciences, Muthgasse 18, A-1190 Vienna, Austria. stephanie.de-beer@boku.ac.at.
Oostenbrink C; Institute of Molecular Modeling and Simulation, University of Natural Resources and Life Sciences, Muthgasse 18, A-1190 Vienna, Austria. chris.oostenbrink@boku.ac.at.

Molecules ; 21(4): 499, 2016 Apr 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27092480

Asunto(s)

Proteínas Bacterianas/química; Proteínas Bacterianas/metabolismo; Proteínas Portadoras/química; Proteínas Portadoras/metabolismo; Lipoproteínas/química; Lipoproteínas/metabolismo; Sitios de Unión; Dominio Catalítico; Ligandos; Modelos Moleculares; Simulación de Dinámica Molecular; Unión Proteica; Termodinámica; Agua/química

Palabras clave

GROMOS; OppA; computational alchemy; free-energy calculations; free-energy perturbation; molecular dynamics simulations; thermodynamic integration

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Bacterianas / Proteínas Portadoras / Lipoproteínas Idioma: En Revista: Molecules Asunto de la revista: BIOLOGIA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Austria

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