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SPIRE, a modular pipeline for eQTL analysis of RNA-Seq data, reveals a regulatory hotspot controlling miRNA expression in C. elegans.
Kel, Ivan; Chang, Zisong; Galluccio, Nadia; Romeo, Margherita; Beretta, Stefano; Diomede, Luisa; Mezzelani, Alessandra; Milanesi, Luciano; Dieterich, Christoph; Merelli, Ivan.
Afiliación
  • Kel I; Instituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche, via F.lli Cervi 93, 20090, Segrate, Milano, Italy. ivan.kel@itb.cnr.it nadia.galluccio@itb.cnr.it alessandra.mezzelani@itb.cnr.it luciano.milanesi@itb.cnr.it ivan.merelli@itb.cnr.it.
  • Chang Z; Max Delbrück Center for Molecular Medicine, Berlin Institute for Medical Systems Biology, Robert-Rössle-Straße 10, 13125, Berlin, Germany. zisong.chang@mdc-berlin.de.
  • Galluccio N; Instituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche, via F.lli Cervi 93, 20090, Segrate, Milano, Italy. ivan.kel@itb.cnr.it nadia.galluccio@itb.cnr.it alessandra.mezzelani@itb.cnr.it luciano.milanesi@itb.cnr.it ivan.merelli@itb.cnr.it.
  • Romeo M; Dipartimento di Biochimica e Farmacologia Molecolare, IRCCS - Istituto di Ricerche Farmacologiche "Mario Negri", Via Giuseppe La Masa 19, Milan, Italy. margherita.romeo@marionegri.it luisa.diomede@marionegri.it.
  • Beretta S; Dipartimento di Informatica Sistemistica e Comunicazione, Università degli studi di Milano-Biccoca, Viale Sarca 336, 20125 Milano, Italy. stefano.beretta@disco.unimib.it.
  • Diomede L; Dipartimento di Biochimica e Farmacologia Molecolare, IRCCS - Istituto di Ricerche Farmacologiche "Mario Negri", Via Giuseppe La Masa 19, Milan, Italy. margherita.romeo@marionegri.it luisa.diomede@marionegri.it.
  • Mezzelani A; Instituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche, via F.lli Cervi 93, 20090, Segrate, Milano, Italy. ivan.kel@itb.cnr.it nadia.galluccio@itb.cnr.it alessandra.mezzelani@itb.cnr.it luciano.milanesi@itb.cnr.it ivan.merelli@itb.cnr.it.
  • Milanesi L; Instituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche, via F.lli Cervi 93, 20090, Segrate, Milano, Italy. ivan.kel@itb.cnr.it nadia.galluccio@itb.cnr.it alessandra.mezzelani@itb.cnr.it luciano.milanesi@itb.cnr.it ivan.merelli@itb.cnr.it.
  • Dieterich C; Section of Bioinformatics and Systems Cardiology, Klaus Tschira Institute for Integrative Computational Cardiology and Department of Internal Medicine III, University of Heidelberg, Grabengasse 1, 69117 Heidelberg, Germany. christoph.dieterich@med.uni-heidelberg.de.
  • Merelli I; Instituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche, via F.lli Cervi 93, 20090, Segrate, Milano, Italy. ivan.kel@itb.cnr.it nadia.galluccio@itb.cnr.it alessandra.mezzelani@itb.cnr.it luciano.milanesi@itb.cnr.it ivan.merelli@itb.cnr.it.
Mol Biosyst ; 12(11): 3447-3458, 2016 10 18.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27722582
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Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Regulación de la Expresión Génica / Caenorhabditis elegans / Biología Computacional / MicroARNs / Sitios de Carácter Cuantitativo Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Mol Biosyst Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOQUIMICA Año: 2016 Tipo del documento: Article
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Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Regulación de la Expresión Génica / Caenorhabditis elegans / Biología Computacional / MicroARNs / Sitios de Carácter Cuantitativo Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Mol Biosyst Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOQUIMICA Año: 2016 Tipo del documento: Article