A transposable element annotation pipeline and expression analysis reveal potentially active elements in the microalga Tisochrysis lutea.

Berthelier, Jérémy; Casse, Nathalie; Daccord, Nicolas; Jamilloux, Véronique; Saint-Jean, Bruno; Carrier, Grégory

Berthelier, Jérémy; Casse, Nathalie; Daccord, Nicolas; Jamilloux, Véronique; Saint-Jean, Bruno; Carrier, Grégory.

Afiliación

Berthelier J; IFREMER, Physiology and Biotechnology of Algae Laboratory, rue de l'Ile d'Yeu, 44311, Nantes, France. berthelier.j@laposte.net.
Casse N; Mer Molécules Santé, EA 2160 IUML - FR 3473 CNRS, Le Mans University, Le Mans, France. berthelier.j@laposte.net.
Daccord N; Mer Molécules Santé, EA 2160 IUML - FR 3473 CNRS, Le Mans University, Le Mans, France.
Jamilloux V; Institut de Recherche en Horticulture et Semences, INRA of Angers, AGROCAMPUS-Ouest, SFR4207 QUASAV, Université d'Angers, Angers, France.
Saint-Jean B; Université Bretagne Loire, Angers, France.
Carrier G; Research Unit in Genomics-Info, INRA of Versailles, Versailles, France.

BMC Genomics ; 19(1): 378, 2018 May 22.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29783941

Asunto(s)

Elementos Transponibles de ADN/genética; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Microalgas/genética; Anotación de Secuencia Molecular/métodos; Genómica

Palabras clave

Algae; Annotation; Genome assembly; Haptophyte; Pipeline; Tisochrysis lutea; Tool; Transposable elements

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Texto completo: 1 Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Elementos Transponibles de ADN / Perfilación de la Expresión Génica / Microalgas / Anotación de Secuencia Molecular Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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