Detalhe da pesquisa
1.
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment.
Proteins
; 89(12): 1800-1823, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34453465
2.
ClusPro in rounds 38 to 45 of CAPRI: Toward combining template-based methods with free docking.
Proteins
; 88(8): 1082-1090, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32142178
3.
Sampling and refinement protocols for template-based macrocycle docking: 2018 D3R Grand Challenge 4.
J Comput Aided Mol Des
; 34(2): 179-189, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31879831
4.
Template-based modeling by ClusPro in CASP13 and the potential for using co-evolutionary information in docking.
Proteins
; 87(12): 1241-1248, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31444975
5.
Monte Carlo on the manifold and MD refinement for binding pose prediction of protein-ligand complexes: 2017 D3R Grand Challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 33(1): 119-127, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30421350
6.
Protein-ligand docking using FFT based sampling: D3R case study.
J Comput Aided Mol Des
; 32(1): 225-230, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29101520
7.
SOP-GPU: influence of solvent-induced hydrodynamic interactions on dynamic structural transitions in protein assemblies.
J Comput Chem
; 37(17): 1537-51, 2016 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27015749
8.
Molecular mechanisms, thermodynamics, and dissociation kinetics of knob-hole interactions in fibrin.
J Biol Chem
; 288(31): 22681-92, 2013 Aug 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23720752
9.
Protein-Protein and Protein-Peptide Docking with ClusPro Server.
Methods Mol Biol
; 2165: 157-174, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32621224
10.
ClusPro LigTBM: Automated Template-based Small Molecule Docking.
J Mol Biol
; 432(11): 3404-3410, 2020 05 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31863748
11.
Improved Modeling of Peptide-Protein Binding Through Global Docking and Accelerated Molecular Dynamics Simulations.
Front Mol Biosci
; 6: 112, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31737642
12.
Kinase Atlas: Druggability Analysis of Potential Allosteric Sites in Kinases.
J Med Chem
; 62(14): 6512-6524, 2019 07 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31274316
13.
Use of deep neural network ensembles to identify embryonic-fetal transition markers: repression of COX7A1 in embryonic and cancer cells.
Oncotarget
; 9(8): 7796-7811, 2018 Jan 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29487692