Detalhe da pesquisa
1.
The single-cell epigenomic and transcriptional landscape of immunity to influenza vaccination.
Cell
; 184(15): 3915-3935.e21, 2021 07 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34174187
2.
MultiVI: deep generative model for the integration of multimodal data.
Nat Methods
; 20(8): 1222-1231, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37386189
3.
Optimizing sequence design strategies for perturbation MPRAs: a computational evaluation framework.
Nucleic Acids Res
; 52(4): 1613-1627, 2024 Feb 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38296821
4.
GeneFishing to reconstruct context specific portraits of biological processes.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(38): 18943-18950, 2019 09 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31484776
5.
Best practices for perturbation MPRA-a computational evaluation framework of sequence design strategies.
bioRxiv
; 2023 Sep 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37808807
6.
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells.
mBio
; : e0131823, 2023 Nov 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37938000
7.
PeakVI: A deep generative model for single-cell chromatin accessibility analysis.
Cell Rep Methods
; 2(3): 100182, 2022 03 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35475224
8.
Massively parallel reporter perturbation assays uncover temporal regulatory architecture during neural differentiation.
Nat Commun
; 13(1): 1504, 2022 03 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35315433
9.
NF-κB inhibitor alpha has a cross-variant role during SARS-CoV-2 infection in ACE2-overexpressing human airway organoids.
bioRxiv
; 2022 Aug 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35982664
10.
lentiMPRA and MPRAflow for high-throughput functional characterization of gene regulatory elements.
Nat Protoc
; 15(8): 2387-2412, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32641802
11.
Identification and Massively Parallel Characterization of Regulatory Elements Driving Neural Induction.
Cell Stem Cell
; 25(5): 713-727.e10, 2019 Nov 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31631012
12.
Functional interpretation of single cell similarity maps.
Nat Commun
; 10(1): 4376, 2019 09 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31558714
13.
MPRAnalyze: statistical framework for massively parallel reporter assays.
Genome Biol
; 20(1): 183, 2019 09 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31477158
14.
A Python library for probabilistic analysis of single-cell omics data.
Nat Biotechnol
; 40(2): 163-166, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35132262
15.
Author Correction: lentiMPRA and MPRAflow for high-throughput functional characterization of gene regulatory elements.
Nat Protoc
; 16(7): 3736, 2021 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33128032