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1.
Front Vet Sci ; 10: 1325263, 2023.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38260198

RESUMO

A new species of nematode parasite of the genus Delicata (Molineidae: Anoplostrongylinae) is described from the small intestine of a road-killed Greater Naked-tailed Armadillo Cabassous tatouay (Cingulata: Chlamyphoridae) on the BR-040 highway in Rio de Janeiro state, Brazil. The genus Delicata includes 13 species of parasitizing armadillos and anteaters distributed in Brazil, Argentina, and Trinidad and Tobago. The present species is distinguished from almost all species of Delicata by the longest length of the body, except for D. khalili and D. appendiculata. However, these can be distinguished from each other by the length of the spicules. The species that closely resembles, Delicata tatouay n. sp. is D. speciosa, but it can be distinguished by a robust branch from rays 2 and 3, rays 4 larger, and rays 8 longer compared to those of the new species. The new species is the only one with a tail, characterized by a terminal spine with rattlesnake tail-like transversal striations.

2.
Front Bioinform ; 3: 1308708, 2023.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38162124

RESUMO

Focused ion beam-scanning electron microscopy (FIB-SEM) images can provide a detailed view of the cellular ultrastructure of tumor cells. A deeper understanding of their organization and interactions can shed light on cancer mechanisms and progression. However, the bottleneck in the analysis is the delineation of the cellular structures to enable quantitative measurements and analysis. We mitigated this limitation using deep learning to segment cells and subcellular ultrastructure in 3D FIB-SEM images of tumor biopsies obtained from patients with metastatic breast and pancreatic cancers. The ultrastructures, such as nuclei, nucleoli, mitochondria, endosomes, and lysosomes, are relatively better defined than their surroundings and can be segmented with high accuracy using a neural network trained with sparse manual labels. Cell segmentation, on the other hand, is much more challenging due to the lack of clear boundaries separating cells in the tissue. We adopted a multi-pronged approach combining detection, boundary propagation, and tracking for cell segmentation. Specifically, a neural network was employed to detect the intracellular space; optical flow was used to propagate cell boundaries across the z-stack from the nearest ground truth image in order to facilitate the separation of individual cells; finally, the filopodium-like protrusions were tracked to the main cells by calculating the intersection over union measure for all regions detected in consecutive images along z-stack and connecting regions with maximum overlap. The proposed cell segmentation methodology resulted in an average Dice score of 0.93. For nuclei, nucleoli, and mitochondria, the segmentation achieved Dice scores of 0.99, 0.98, and 0.86, respectively. The segmentation of FIB-SEM images will enable interpretative rendering and provide quantitative image features to be associated with relevant clinical variables.

3.
Biota Neotrop. (Online, Ed. ingl.) ; 23(4): e20231534, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533962

RESUMO

Abstract Protected areas play a fundamental role in the preservation of species, environmental education, and ecosystem services maintenance. Most of the world population live in urban areas, which highlight the importance of preserved areas in urban centers. However, many urban protected areas in Brazil lack species surveys, which limits biodiversity conservation and implementation of management plans. In this study, we surveyed the species of medium and large mammals of Chico Mendes Municipal Natural Park (MNP) and Canal das Taxas corridor through camera traps, thus providing the first comprehensive in situ survey of terrestrial mammals for the area. We also verified whether there was mammalian fauna exchange between the Chico Mendes and Marapendi MNPs through the vegetation corridor formed by the Canal das Taxas. Between November 2020 and July 2021, with a sampling effort of 1,334 trap-days, we recorded five native and five exotic species in the studied areas, including one Vulnerable species in the Municipality and State of Rio de Janeiro (Cuniculus paca). We also confirmed that Canal das Taxas works as a wildlife corridor for native species. Finally, we highlight that species checklists based on secondary information for the region are of limited usefulness and recommend in situ surveys even in small, urban protected areas of Rio de Janeiro city.


Resumo As áreas protegidas têm papel fundamental na preservação das espécies, na educação ambiental e na manutenção dos serviços ecossistêmicos. A maior parte da população mundial vive em áreas urbanas, o que evidencia a importância das áreas preservadas nos centros urbanos. No entanto, muitas áreas protegidas urbanas no Brasil carecem de levantamentos de espécies, o que limita a conservação da biodiversidade e a implementação de planos de manejo. Neste estudo, inventariamos as espécies de mamíferos de médio e grande porte do Parque Natural Municipal Chico Mendes e do corredor do Canal das Taxas por meio de armadilhas fotográficas, fornecendo assim o primeiro levantamento in situ abrangente de mamíferos terrestres para a área. Também verificamos se houve intercâmbio de fauna de mamíferos entre os parques Chico Mendes e Marapendi através do Canal das Taxas. Entre novembro de 2020 e julho de 2021, com um esforço amostral de 1.334 armadilhas-dia, registramos cinco espécies nativas e cinco espécies exóticas nas áreas de estudo, incluindo uma espécie Vulnerável no município e estado do Rio de Janeiro (Cuniculus paca). Confirmamos que o Canal das Taxas funciona como um corredor de fauna para espécies nativas. Por fim, ressaltamos que listas de espécies baseadas em informações secundárias para a região são de utilidade limitada e recomendamos levantamentos in situ, mesmo em pequenas Unidades de Conservação urbanas da cidade do Rio de Janeiro.

4.
Biota Neotrop. (Online, Ed. ingl.) ; 23(2): e20221454, 2023. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1447506

RESUMO

Abstract The construction of highways is responsible for access to previously protected areas, resulting in changes in landscape and dynamics of the animal populations that live in these areas. These enterprises are the major responsible for the mortality of wild animals, surpassing hunting and even the trafficking of animals. The objective of this study was to make a list that reflects the diversity of amphibians and reptile's road-killed along the BR-040, a highway that crosses the threaten lowland Atlantic Forest in Southeastern region of Brazil, including the use of microhabitats, lifestyle, activity pattern, reproductive cycles, and possible rare or endangered species. The study area consists of 180,4 km of highways. Monitoring began in 2006 and continues to the present day. A total of 1,410 individuals from 60 species were recorded in this study. The reptiles were more frequent in number of individuals and species. The commonest species recorded were Crotalus durissus and Dipsas mikanii. We have registered a single endangered species: Ranacephala hogei. The highest rates of road-kill were recorded during the wet season. Road-kills of fauna is a major threat to species, studies are of great importance to define plans that seek to mitigate the effects generated by these enterprises.


Resumo A construção de rodovias é responsável pelo acesso a áreas anteriormente protegidas, resultando em alterações na paisagem e na dinâmica das populações animais que vivem nessas áreas. Esses empreendimentos são os maiores responsáveis pela mortalidade de animais silvestres, superando a caça e até mesmo o tráfico de animais. O objetivo deste estudo foi realizar uma lista que reflita a diversidade de anfíbios e répteis atropelados ao longo da BR-040, uma rodovia que atravessa a ameaçada Mata Atlântica na região Sudeste do Brasil, incluindo o uso de microhabitats, estilo de vida, padrão de atividade, ciclos reprodutivos, e possíveis espécies raras ou ameaçadas. A área de estudo é constituída por 180,4 km de rodovias. O monitoramento começou em 2006 e segue até os dias atuais. Ao todo 1.410 indivíduos de 60 espécies foram registrados nesse estudo. Os répteis foram mais frequentes, em número de indivíduos e espécies. As espécies mais comumente registradas foram Crotalus durissus e Dipsas mikanii. Registramos uma espécie ameaçada de extinção: Ranacephala hogei. A maior taxa de atropelamento foi registrada durante a estação chuvosa. O atropelamento de fauna é uma grande ameaça as espécies, sendo de grande importância estudos para definição de planos que busquem mitigar os efeitos gerados por esses empreendimentos.

5.
Rev. bras. parasitol. vet ; 25(4): 407-413, Sept.-Dec. 2016. tab
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-830055

RESUMO

Abstract The current study aimed to investigate the helminth parasites of a population of Galictis cuja (Carnivora, Mustelidae) that occur in Atlantic Forest in the Southeastern region of Brazil. We necropsied 18 specimens of G. cuja, collected between January 2009 and May 2014, ran over victims on BR-040 highway, between the municipalities of Duque de Caxias, state of Rio de Janeiro and Juiz de Fora, state of Minas Gerais, localities inserted in Atlantic rainforest Biome. A total of six species of helminths were identified: Dioctophyme renale, Molineus elegans, Physaloptera sp., Strongyloides sp., Platynosomum illiciens, and Pachysentis gethi. Molineus elegans, Physaloptera sp. and P. illiciens were recorded for the first time in this host. Data provided in the current study when compared to the previous reports of parasitism by helminths in G. cuja in Brazil demonstrate that this study is the most representative with this host species.


Resumo O presente estudo teve como objetivo investigar a fauna de helmintos de uma população de Galictis cuja (Carnivora, Mustelidae) que ocorre em uma região de Mata Atlântica na região Sudeste do Brasil. Foram necropsiados 18 espécimes de G. cuja, coletados entre Janeiro de 2009 e Maio de 2014, que foram mortos acidentalmente por atropelamentos na rodovia BR-040, entre os municípios de Duque de Caxias, no Estado do Rio de Janeiro e Juiz de Fora, no Estado de Minas Gerais, localidades inseridas no Bioma Mata Atlântica. No total seis espécies de helmintos foram identificadas: Dioctophyme renale, Molineus elegans, Physaloptera sp, Strongyloides sp, Platynosomum illiciens e Pachysentis gethi. Molineus elegans, Physaloptera sp. e P. illiciens foram registradas pela primeira vez nesta espécie de hospedeiro. O estudo amplia a diversidade de helmintos conhecidos para o hospedeiro em questão. Os dados fornecidos no presente estudo quando comparados com os registros prévios de helmintos em G. cuja no Brasil demonstram que este estudo é o mais representativo com esta espécie de hospedeiro.


Assuntos
Animais , Mustelidae/parasitologia , Helmintos/isolamento & purificação , Brasil , Florestas
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