Detalhe da pesquisa
1.
An Atlas of Peroxiredoxins Created Using an Active Site Profile-Based Approach to Functionally Relevant Clustering of Proteins.
PLoS Comput Biol
; 13(2): e1005284, 2017 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28187133
2.
DASP3: identification of protein sequences belonging to functionally relevant groups.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 458, 2016 Nov 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27835946
3.
RRDistMaps: a UCSF Chimera tool for viewing and comparing protein distance maps.
Bioinformatics
; 31(9): 1484-6, 2015 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25540183
4.
cddApp: a Cytoscape app for accessing the NCBI conserved domain database.
Bioinformatics
; 31(1): 134-6, 2015 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25212755
5.
Enhancing UCSF Chimera through web services.
Nucleic Acids Res
; 42(Web Server issue): W478-84, 2014 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24861624
6.
The Structure-Function Linkage Database.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D521-30, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24271399
7.
Multidomain Assembler (MDA) Generates Models of Large Multidomain Proteins.
Biophys J
; 108(9): 2097-102, 2015 May 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25954868
8.
IHMCIF: An Extension of the PDBx/mmCIF Data Standard for Integrative Structure Determination Methods.
J Mol Biol
; : 168546, 2024 Mar 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38508301
9.
ModBase, a database of annotated comparative protein structure models, and associated resources.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D465-74, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21097780
10.
UCSF ChimeraX: Tools for structure building and analysis.
Protein Sci
; 32(11): e4792, 2023 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37774136
11.
UCSF Chimera, MODELLER, and IMP: an integrated modeling system.
J Struct Biol
; 179(3): 269-78, 2012 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21963794
12.
Improving the quality of protein similarity network clustering algorithms using the network edge weight distribution.
Bioinformatics
; 27(3): 326-33, 2011 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21118823
13.
Designed divergent evolution of enzyme function.
Nature
; 440(7087): 1078-82, 2006 Apr 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16495946
14.
Computational tools for the interactive exploration of proteomic and structural data.
Mol Cell Proteomics
; 9(8): 1703-15, 2010 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20525940
15.
clusterMaker: a multi-algorithm clustering plugin for Cytoscape.
BMC Bioinformatics
; 12: 436, 2011 Nov 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22070249
16.
UCSF ChimeraX: Structure visualization for researchers, educators, and developers.
Protein Sci
; 30(1): 70-82, 2021 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32881101
17.
Genetic variants of human organic anion transporter 4 demonstrate altered transport of endogenous substrates.
Am J Physiol Renal Physiol
; 299(4): F767-75, 2010 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20668102
18.
Role of organic cation transporter 3 (SLC22A3) and its missense variants in the pharmacologic action of metformin.
Pharmacogenet Genomics
; 20(11): 687-99, 2010 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20859243
19.
Visualization software for molecular assemblies.
Curr Opin Struct Biol
; 17(5): 587-95, 2007 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17728125
20.
Functional genetic variation in the basal promoter of the organic cation/carnitine transporters OCTN1 (SLC22A4) and OCTN2 (SLC22A5).
J Pharmacol Exp Ther
; 329(1): 262-71, 2009 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19141711