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1.
PLoS Comput Biol ; 17(9): e1009439, 2021 09.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34550974

RESUMO

Recent neuroscience studies demonstrate that a deeper understanding of brain function requires a deeper understanding of behavior. Detailed behavioral measurements are now often collected using video cameras, resulting in an increased need for computer vision algorithms that extract useful information from video data. Here we introduce a new video analysis tool that combines the output of supervised pose estimation algorithms (e.g. DeepLabCut) with unsupervised dimensionality reduction methods to produce interpretable, low-dimensional representations of behavioral videos that extract more information than pose estimates alone. We demonstrate this tool by extracting interpretable behavioral features from videos of three different head-fixed mouse preparations, as well as a freely moving mouse in an open field arena, and show how these interpretable features can facilitate downstream behavioral and neural analyses. We also show how the behavioral features produced by our model improve the precision and interpretation of these downstream analyses compared to using the outputs of either fully supervised or fully unsupervised methods alone.


Assuntos
Algoritmos , Inteligência Artificial/estatística & dados numéricos , Comportamento Animal , Gravação em Vídeo , Animais , Biologia Computacional , Simulação por Computador , Cadeias de Markov , Camundongos , Modelos Estatísticos , Redes Neurais de Computação , Aprendizado de Máquina Supervisionado/estatística & dados numéricos , Aprendizado de Máquina não Supervisionado/estatística & dados numéricos , Gravação em Vídeo/estatística & dados numéricos
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