Detalhe da pesquisa
1.
Spectral neural approximations for models of transcriptional dynamics.
Biophys J
; 2024 May 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38715358
2.
RNA velocity unraveled.
PLoS Comput Biol
; 18(9): e1010492, 2022 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36094956
3.
Assessing Markovian and Delay Models for Single-Nucleus RNA Sequencing.
Bull Math Biol
; 85(11): 114, 2023 10 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37828255
4.
Modeling bursty transcription and splicing with the chemical master equation.
Biophys J
; 121(6): 1056-1069, 2022 03 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35143775
5.
New and notable: Revisiting the "two cultures" through extrinsic noise.
Biophys J
; 123(1): 1-3, 2024 01 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38041403
6.
Length biases in single-cell RNA sequencing of pre-mRNA.
Biophys Rep (N Y)
; 3(1): 100097, 2023 Mar 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36660179
7.
The telegraph process is not a subordinator.
bioRxiv
; 2023 Jan 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36711462
8.
Biophysically Interpretable Inference of Cell Types from Multimodal Sequencing Data.
bioRxiv
; 2023 Sep 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37745403
9.
Studying stochastic systems biology of the cell with single-cell genomics data.
bioRxiv
; 2023 May 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37292934
10.
Studying stochastic systems biology of the cell with single-cell genomics data.
Cell Syst
; 14(10): 822-843.e22, 2023 10 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37751736
11.
Biophysical modeling with variational autoencoders for bimodal, single-cell RNA sequencing data.
bioRxiv
; 2023 May 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36712140
12.
Interpretable and tractable models of transcriptional noise for the rational design of single-molecule quantification experiments.
Nat Commun
; 13(1): 7620, 2022 Dec 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36494337
13.
Special function methods for bursty models of transcription.
Phys Rev E
; 102(2-1): 022409, 2020 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32942485
14.
Protein velocity and acceleration from single-cell multiomics experiments.
Genome Biol
; 21(1): 39, 2020 02 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32070398
15.
Stochastic simulation and statistical inference platform for visualization and estimation of transcriptional kinetics.
PLoS One
; 15(3): e0230736, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32214380