Detalhe da pesquisa
1.
Chromosome Conformation Capture and Beyond: Toward an Integrative View of Chromosome Structure and Function.
Mol Cell
; 77(4): 688-708, 2020 02 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32001106
2.
Hypothesis-driven probabilistic modelling enables a principled perspective of genomic compartments.
Nucleic Acids Res
; 51(3): 1103-1119, 2023 02 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36629266
3.
Genome organization and DNA accessibility control antigenic variation in trypanosomes.
Nature
; 563(7729): 121-125, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30333624
4.
Structural organization of the inactive X chromosome in the mouse.
Nature
; 535(7613): 575-9, 2016 07 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27437574
5.
Study of mitotic chromatin supports a model of bookmarking by histone modifications and reveals nucleosome deposition patterns.
Genome Res
; 28(10): 1455-1466, 2018 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30166406
6.
Three invariant Hi-C interaction patterns: Applications to genome assembly.
Methods
; 142: 89-99, 2018 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29684640
7.
DNA-guided establishment of nucleosome patterns within coding regions of a eukaryotic genome.
Genome Res
; 25(11): 1727-38, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26330564
8.
The Hitchhiker's guide to Hi-C analysis: practical guidelines.
Methods
; 72: 65-75, 2015 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25448293
9.
The DNA-encoded nucleosome organization of a eukaryotic genome.
Nature
; 458(7236): 362-6, 2009 Mar 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19092803
10.
KMD clustering: robust general-purpose clustering of biological data.
Commun Biol
; 6(1): 1110, 2023 11 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37919399
11.
CTCF-mediated 3D chromatin predetermines the gene expression program in the male germline.
bioRxiv
; 2023 Dec 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38076840
12.
Distinct modes of regulation by chromatin encoded through nucleosome positioning signals.
PLoS Comput Biol
; 4(11): e1000216, 2008 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18989395
13.
Attenuated chromatin compartmentalization in meiosis and its maturation in sperm development.
Nat Struct Mol Biol
; 26(3): 175-184, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30778237
14.
Novel families of toxin-like peptides in insects and mammals: a computational approach.
J Mol Biol
; 369(2): 553-66, 2007 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17433819
15.
Current density imaging by pulsed conduction electron spin resonance.
J Magn Reson
; 184(1): 44-50, 2007 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17029992
16.
ProtoNet 4.0: a hierarchical classification of one million protein sequences.
Nucleic Acids Res
; 33(Database issue): D216-8, 2005 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15608180
17.
Functional annotation prediction: all for one and one for all.
Protein Sci
; 15(6): 1557-62, 2006 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16672244
18.
PANDORA: keyword-based analysis of protein sets by integration of annotation sources.
Nucleic Acids Res
; 31(19): 5617-26, 2003 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-14500825
19.
Automatic detection of false annotations via binary property clustering.
BMC Bioinformatics
; 6: 46, 2005 Mar 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15755318
20.
A functional hierarchical organization of the protein sequence space.
BMC Bioinformatics
; 5: 196, 2004 Dec 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15596019