Detalhe da pesquisa
1.
Docking cholesterol to integral membrane proteins with Rosetta.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010947, 2023 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36972273
2.
Recent Advances in NMR Protein Structure Prediction with ROSETTA.
Int J Mol Sci
; 24(9)2023 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37175539
3.
Better together: Elements of successful scientific software development in a distributed collaborative community.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007507, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32365137
4.
Classification of the Molecular Defects Associated with Pathogenic Variants of the SLC6A8 Creatine Transporter.
Biochemistry
; 59(13): 1367-1377, 2020 04 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32207963
5.
A Novel Domain Assembly Routine for Creating Full-Length Models of Membrane Proteins from Known Domain Structures.
Biochemistry
; 57(13): 1939-1944, 2018 04 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29185719
6.
Comparison of NMR and crystal structures of membrane proteins and computational refinement to improve model quality.
Proteins
; 86(1): 57-74, 2018 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29044728
7.
Computational Prediction of the Heterodimeric and Higher-Order Structure of gpE1/gpE2 Envelope Glycoproteins Encoded by Hepatitis C Virus.
J Virol
; 91(8)2017 04 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28148799
8.
Expanding the toolkit for membrane protein modeling in Rosetta.
Bioinformatics
; 33(5): 754-756, 2017 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28011777
9.
Computing structure-based lipid accessibility of membrane proteins with mp_lipid_acc in RosettaMP.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 115, 2017 Feb 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28219343
10.
Specificity and Speed: Tethered Photopharmacology.
Biochemistry
; 56(39): 5214-5220, 2017 10 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28876905
11.
Combining Evolutionary Information and an Iterative Sampling Strategy for Accurate Protein Structure Prediction.
PLoS Comput Biol
; 11(12): e1004661, 2015 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26713437
12.
An Integrated Framework Advancing Membrane Protein Modeling and Design.
PLoS Comput Biol
; 11(9): e1004398, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26325167
13.
Computational modeling of membrane proteins.
Proteins
; 83(1): 1-24, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25355688
14.
Peptide Folding in Translocon-Like Pores.
J Membr Biol
; 248(3): 407-17, 2015 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26016471
15.
Specificities of Modeling of Membrane Proteins Using Multi-Template Homology Modeling.
Methods Mol Biol
; 2627: 141-166, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36959446
16.
Sequence-structure-function relationships in the microbial protein universe.
Nat Commun
; 14(1): 2351, 2023 04 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37100781
17.
Ensuring scientific reproducibility in bio-macromolecular modeling via extensive, automated benchmarks.
Nat Commun
; 12(1): 6947, 2021 11 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34845212
18.
Statistically derived asymmetric membrane potentials from α-helical and ß-barrel membrane proteins.
Sci Rep
; 8(1): 4446, 2018 03 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29535329
19.
Improving Loop Modeling of the Antibody Complementarity-Determining Region 3 Using Knowledge-Based Restraints.
PLoS One
; 11(5): e0154811, 2016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27182833