Detalhe da pesquisa
1.
An interactive resource to identify cancer genetic and lineage dependencies targeted by small molecules.
Cell
; 154(5): 1151-1161, 2013 Aug 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23993102
2.
Densely interconnected transcriptional circuits control cell states in human hematopoiesis.
Cell
; 144(2): 296-309, 2011 Jan 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21241896
3.
GeNets: a unified web platform for network-based genomic analyses.
Nat Methods
; 15(7): 543-546, 2018 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29915188
4.
Addendum: The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modelling of anticancer drug sensitivity.
Nature
; 565(7738): E5-E6, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30559381
5.
Integrative genomic analysis by interoperation of bioinformatics tools in GenomeSpace.
Nat Methods
; 13(3): 245-247, 2016 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26780094
6.
Correlating chemical sensitivity and basal gene expression reveals mechanism of action.
Nat Chem Biol
; 12(2): 109-16, 2016 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26656090
7.
The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modelling of anticancer drug sensitivity.
Nature
; 483(7391): 603-7, 2012 Mar 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22460905
8.
Initial genome sequencing and analysis of multiple myeloma.
Nature
; 471(7339): 467-72, 2011 Mar 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21430775
9.
The landscape of somatic copy-number alteration across human cancers.
Nature
; 463(7283): 899-905, 2010 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20164920
10.
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration.
bioRxiv
; 2023 Jun 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37398372
11.
NMF Clustering: Accessible NMF-based Clustering Utilizing GPU Acceleration.
J Bioinform Syst Biol
; 6(4): 379-383, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38390437
12.
Inferring cellular and molecular processes in single-cell data with non-negative matrix factorization using Python, R and GenePattern Notebook implementations of CoGAPS.
Nat Protoc
; 18(12): 3690-3731, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37989764
13.
A phenotypically supervised single-cell analysis protocol to study within-cell-type heterogeneity of cultured mammalian cells.
STAR Protoc
; 2(2): 100561, 2021 06 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34095869
14.
NASA GeneLab RNA-seq consensus pipeline: standardized processing of short-read RNA-seq data.
iScience
; 24(4): 102361, 2021 Apr 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33870146
15.
16.
Imaging-AMARETTO: An Imaging Genomics Software Tool to Interrogate Multiomics Networks for Relevance to Radiography and Histopathology Imaging Biomarkers of Clinical Outcomes.
JCO Clin Cancer Inform
; 4: 421-435, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32383980
17.
The GenePattern Notebook Environment.
Cell Syst
; 5(2): 149-151.e1, 2017 08 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28822753
18.
The impact of Life Science Identifier on informatics data.
Drug Discov Today
; 10(22): 1566-72, 2005 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16257380
19.
Harnessing Connectivity in a Large-Scale Small-Molecule Sensitivity Dataset.
Cancer Discov
; 5(11): 1210-23, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26482930
20.
Cytoscape: the network visualization tool for GenomeSpace workflows.
F1000Res
; 3: 151, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25165537