Detalhe da pesquisa
1.
On the surprising effectiveness of a simple matrix exponential derivative approximation, with application to global SARS-CoV-2.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(3): e2318989121, 2024 Jan 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38215186
2.
Rapidly changing speciation and extinction rates can be inferred in spite of nonidentifiability.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(7): e2208851120, 2023 02 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36757894
3.
Random-effects substitution models for phylogenetics via scalable gradient approximations.
Syst Biol
; 2024 May 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38712512
4.
Scalable gradients enable Hamiltonian Monte Carlo sampling for phylodynamic inference under episodic birth-death-sampling models.
PLoS Comput Biol
; 20(3): e1011640, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38551979
5.
Robustness of Phylogenetic Inference to Model Misspecification Caused by Pairwise Epistasis.
Mol Biol Evol
; 38(10): 4603-4615, 2021 09 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34043795
6.
Systematic Exploration of the High Likelihood Set of Phylogenetic Tree Topologies.
Syst Biol
; 69(2): 280-293, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31504997
7.
19 Dubious Ways to Compute the Marginal Likelihood of a Phylogenetic Tree Topology.
Syst Biol
; 69(2): 209-220, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31504998
8.
Locally adaptive Bayesian birth-death model successfully detects slow and rapid rate shifts.
PLoS Comput Biol
; 16(10): e1007999, 2020 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33112848
9.
Horseshoe-based Bayesian nonparametric estimation of effective population size trajectories.
Biometrics
; 76(3): 677-690, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32277713
10.
Rejoinder for discussion on "Horseshoe-based Bayesian nonparametric estimation of effective population size trajectories".
Biometrics
; 76(3): 695-699, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32378741
11.
Scalable gradients enable Hamiltonian Monte Carlo sampling for phylodynamic inference under episodic birth-death-sampling models.
bioRxiv
; 2023 Nov 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37961423
12.
Random-effects substitution models for phylogenetics via scalable gradient approximations.
ArXiv
; 2023 Sep 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36994154
13.
The recency and geographical origins of the bat viruses ancestral to SARS-CoV and SARS-CoV-2.
bioRxiv
; 2023 Jul 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37502985
14.
Accelerated evolution of SARS-CoV-2 in free-ranging white-tailed deer.
Nat Commun
; 14(1): 5105, 2023 08 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37640694
15.
The dawn of open access to phylogenetic data.
PLoS One
; 9(10): e110268, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25343725