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DNA Seq ; 14(1): 1-13, 2003 Feb.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12751327

RESUMO

We have sequenced and analysed a 148 kb genomic region of Tetraodon nigroviridis, a teleost fish with a compact genome. Several genes were identified by comparison with genomic or transcript sequences of other species, informatic prediction and screening of a cDNA library. As expected for a compact genome, sizes of the identified genes and introns are very small, and intergenic distances are short. Among identified genes, three code for amylases. As in mammals, these genes are linked, but they are found in a small region of less than 11 kb. These results represent the first description of a genomic sequence larger than 100 kb in this species. Synteny with the human genome is restricted to three regions corresponding to human 1p32.3, 1p13.3 and 1p21.1.


Assuntos
Amilases/genética , Tetraodontiformes/genética , Sequência de Aminoácidos , Mapeamento Cromossômico , Cromossomos Humanos Par 1/genética , Clonagem Molecular , DNA/química , DNA/genética , DNA Complementar/química , DNA Complementar/genética , Humanos , Dados de Sequência Molecular , Alinhamento de Sequência , Análise de Sequência de DNA , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Software , Sintenia
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